RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495357.1

CCDC39-AS1-201, CCDC39 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CCDC39-AS1, Length 283 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PJA1Q8NG27 643 aa5.47□□□□□ -1.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SNX18Q96RF0 628 aa5.47□□□□□ -1.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SELENOOQ9BVL4 669 aa5.47□□□□□ -1.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PNPLA8Q9NP80 782 aa5.47□□□□□ -1.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TRIM36Q9NQ86 728 aa5.47□□□□□ -1.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TBC1D23Q9NUY8 699 aa5.47□□□□□ -1.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RIMKLBQ9ULI2 386 aa5.47□□□□□ -1.53
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 H7C1Q1 480 aa5.46□□□□□ -1.54
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PMM2O15305 246 aa5.46□□□□□ -1.54
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PHKG2P15735 406 aa5.46□□□□□ -1.54
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZNF81P51508 661 aa5.46□□□□□ -1.54
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FHL3Q13643 280 aa5.46□□□□□ -1.54
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa5.46□□□□□ -1.54
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 USP49Q70CQ1 688 aa5.46□□□□□ -1.54
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KRT28Q7Z3Y7 464 aa5.46□□□□□ -1.54
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CHSY1Q86X52 802 aa5.46□□□□□ -1.54
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DDB2Q92466 427 aa5.46□□□□□ -1.54
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 IQCDQ96DY2 449 aa5.46□□□□□ -1.54
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZDHHC12Q96GR4 267 aa5.46□□□□□ -1.54
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TBCBQ99426 244 aa5.46□□□□□ -1.54
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CIPCQ9C0C6 399 aa5.46□□□□□ -1.54
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ASIC5Q9NY37 505 aa5.46□□□□□ -1.54
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LPAR3Q9UBY5 353 aa5.46□□□□□ -1.54
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa5.45□□□□□ -1.54
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 POM121BA6NF01 834 aa5.45□□□□□ -1.54
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PRRT4C9JH25 899 aa5.45□□□□□ -1.54
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SMIM22K7EJ46 135 aa5.45□□□□□ -1.54
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 EXOC5O00471 708 aa5.45□□□□□ -1.54
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CES2O00748 559 aa5.45□□□□□ -1.54
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 AREL1O15033 823 aa5.45□□□□□ -1.54
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ADAMTS3O15072 1205 aa5.45□□□□□ -1.54
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 EXOC3O60645 756 aa5.45□□□□□ -1.54
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NTSR1P30989 418 aa5.45□□□□□ -1.54
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TUBA4AP68366 448 aa5.45□□□□□ -1.54
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RRAGBQ5VZM2 374 aa5.45□□□□□ -1.54
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZNF66Q6ZN08 573 aa5.45□□□□□ -1.54
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PTCHD4Q6ZW05 846 aa5.45□□□□□ -1.54
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZNF366Q8N895 744 aa5.45□□□□□ -1.54
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RITA1Q96K30 269 aa5.45□□□□□ -1.54
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FAM227BQ96M60 508 aa5.45□□□□□ -1.54
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 COLEC11Q9BWP8 271 aa5.45□□□□□ -1.54
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SLC29A3Q9BZD2 475 aa5.45□□□□□ -1.54
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GJB4Q9NTQ9 266 aa5.45□□□□□ -1.54
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FLRT1Q9NZU1 646 aa5.45□□□□□ -1.54
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DNAJB11Q9UBS4 358 aa5.45□□□□□ -1.54
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 A0A1W2PPC4 97 aa5.44□□□□□ -1.54
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ANO9A1A5B4 782 aa5.44□□□□□ -1.54
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CLCA1A8K7I4 914 aa5.44□□□□□ -1.54
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 THAP12O43422 761 aa5.44□□□□□ -1.54
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CELA2AP08217 269 aa5.44□□□□□ -1.54
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CREB1P16220 341 aa5.44□□□□□ -1.54
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FGFR2P21802 821 aa5.44□□□□□ -1.54
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MCM5P33992 734 aa5.44□□□□□ -1.54
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DIO1P49895 249 aa5.44□□□□□ -1.54
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MTHFSP49914 203 aa5.44□□□□□ -1.54
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RENBPP51606 427 aa5.44□□□□□ -1.54
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 COPAP53621 1224 aa5.44□□□□□ -1.54
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LMAN2Q12907 356 aa5.44□□□□□ -1.54
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZNF425Q6IV72 752 aa5.44□□□□□ -1.54
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MZT2AQ6P582 158 aa5.44□□□□□ -1.54
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LIX1LQ8IVB5 337 aa5.44□□□□□ -1.54
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 C11orf44Q8N8P7 122 aa5.44□□□□□ -1.54
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa5.44□□□□□ -1.54
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa5.44□□□□□ -1.54
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MYO1AQ9UBC5 1043 aa5.44□□□□□ -1.54
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HPSEQ9Y251 543 aa5.44□□□□□ -1.54
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa5.44□□□□□ -1.54
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 COL15A1P39059 1388 aa5.43□□□□□ -1.54
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KCNQ3O43525 872 aa5.43□□□□□ -1.54
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 APEHP13798 732 aaKnown RBP5.43□□□□□ -1.54
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HTR7P34969 479 aa5.43□□□□□ -1.54
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 STT3AP46977 705 aa5.43□□□□□ -1.54
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP5.43□□□□□ -1.54
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GRM1Q13255 1194 aa5.43□□□□□ -1.54
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa5.43□□□□□ -1.54
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KSR2Q6VAB6 950 aa5.43□□□□□ -1.54
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa5.43□□□□□ -1.54
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP5.43□□□□□ -1.54
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LINC01465Q8N7H1 131 aa5.43□□□□□ -1.54
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MMS19Q96T76 1030 aa5.43□□□□□ -1.54
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GDF15Q99988 308 aa5.43□□□□□ -1.54
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP5.43□□□□□ -1.54
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 A8MVJ9 347 aa5.42□□□□□ -1.54
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa5.42□□□□□ -1.54
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CAND2O75155 1236 aa5.42□□□□□ -1.54
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DEUP1Q05D60 604 aa5.42□□□□□ -1.54
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP5.42□□□□□ -1.54
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CLCA4Q14CN2 919 aa5.42□□□□□ -1.54
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CLEC9AQ6UXN8 241 aa5.42□□□□□ -1.54
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 C11orf96Q7Z7L8 435 aa5.42□□□□□ -1.54
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GALNT4Q8N4A0 578 aa5.42□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.9 ms