RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 AFG1LQ8WV93 481 aa8.8□□□□□ -1
PTPRC-212ENST00000491302 CPT1BQ92523 772 aa8.8□□□□□ -1
PTPRC-212ENST00000491302 MPP4Q96JB8 637 aa8.8□□□□□ -1
PTPRC-212ENST00000491302 PGBD1Q96JS3 809 aa8.8□□□□□ -1
PTPRC-212ENST00000491302 PPM1MQ96MI6 270 aa8.8□□□□□ -1
PTPRC-212ENST00000491302 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa8.8□□□□□ -1
PTPRC-212ENST00000491302 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa8.8□□□□□ -1
PTPRC-212ENST00000491302 BRD8Q9H0E9 1235 aa8.8□□□□□ -1
PTPRC-212ENST00000491302 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
PTPRC-212ENST00000491302 RIC8AQ9NPQ8 531 aa8.8□□□□□ -1
PTPRC-212ENST00000491302 FEM1BQ9UK73 627 aa8.8□□□□□ -1
PTPRC-212ENST00000491302 FZD1Q9UP38 647 aa8.8□□□□□ -1
PTPRC-212ENST00000491302 EXOC5O00471 708 aa8.79□□□□□ -1
PTPRC-212ENST00000491302 DHHO43323 396 aa8.79□□□□□ -1
PTPRC-212ENST00000491302 TAF5LO75529 589 aa8.79□□□□□ -1
PTPRC-212ENST00000491302 SPDEFO95238 335 aa8.79□□□□□ -1
PTPRC-212ENST00000491302 PRKCBP05771 671 aa8.79□□□□□ -1
PTPRC-212ENST00000491302 CDK7P50613 346 aa8.79□□□□□ -1
PTPRC-212ENST00000491302 ACTR2P61160 394 aa8.79□□□□□ -1
PTPRC-212ENST00000491302 CUL4BQ13620 913 aa8.79□□□□□ -1
PTPRC-212ENST00000491302 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP8.79□□□□□ -1
PTPRC-212ENST00000491302 ACOX1Q15067 660 aa8.79□□□□□ -1
PTPRC-212ENST00000491302 RPS6KA2Q15349 733 aa8.79□□□□□ -1
PTPRC-212ENST00000491302 ST3GAL2Q16842 350 aa8.79□□□□□ -1
PTPRC-212ENST00000491302 LY6KQ17RY6 165 aa8.79□□□□□ -1
PTPRC-212ENST00000491302 FAM110CQ1W6H9 321 aa8.79□□□□□ -1
PTPRC-212ENST00000491302 LNX2Q8N448 690 aa8.79□□□□□ -1
PTPRC-212ENST00000491302 IL17DQ8TAD2 202 aa8.79□□□□□ -1
PTPRC-212ENST00000491302 CXorf38Q8TB03 319 aa8.79□□□□□ -1
PTPRC-212ENST00000491302 SOCS4Q8WXH5 440 aa8.79□□□□□ -1
PTPRC-212ENST00000491302 GLG1Q92896 1179 aa8.79□□□□□ -1
PTPRC-212ENST00000491302 C3orf49Q96BT1 292 aa8.79□□□□□ -1
PTPRC-212ENST00000491302 ALG8Q9BVK2 526 aa8.79□□□□□ -1
PTPRC-212ENST00000491302 A1L4Q6 167 aa8.78□□□□□ -1
PTPRC-212ENST00000491302 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP8.78□□□□□ -1
PTPRC-212ENST00000491302 B9A039 149 aa8.78□□□□□ -1
PTPRC-212ENST00000491302 H0Y3Z8 333 aa8.78□□□□□ -1
PTPRC-212ENST00000491302 PROM1O43490 865 aa8.78□□□□□ -1
PTPRC-212ENST00000491302 WDR47O94967 919 aa8.78□□□□□ -1
PTPRC-212ENST00000491302 ONECUT2O95948 504 aa8.78□□□□□ -1
PTPRC-212ENST00000491302 LMNAP02545 664 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
PTPRC-212ENST00000491302 HTR7P34969 479 aa8.78□□□□□ -1
PTPRC-212ENST00000491302 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP8.78□□□□□ -1
PTPRC-212ENST00000491302 DGKQP52824 942 aa8.78□□□□□ -1
PTPRC-212ENST00000491302 FHL3Q13643 280 aa8.78□□□□□ -1
PTPRC-212ENST00000491302 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
PTPRC-212ENST00000491302 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa8.78□□□□□ -1
PTPRC-212ENST00000491302 BTBD16Q32M84 506 aa8.78□□□□□ -1
PTPRC-212ENST00000491302 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF618Q5T7W0 954 aa8.78□□□□□ -1
PTPRC-212ENST00000491302 LRRTM4Q86VH4 590 aa8.78□□□□□ -1
PTPRC-212ENST00000491302 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
PTPRC-212ENST00000491302 HERC6Q8IVU3 1022 aa8.78□□□□□ -1
PTPRC-212ENST00000491302 ARHGEF19Q8IW93 802 aa8.78□□□□□ -1
PTPRC-212ENST00000491302 C11orf44Q8N8P7 122 aa8.78□□□□□ -1
PTPRC-212ENST00000491302 SSH3Q8TE77 659 aa8.78□□□□□ -1
PTPRC-212ENST00000491302 LPIN2Q92539 896 aa8.78□□□□□ -1
PTPRC-212ENST00000491302 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP8.78□□□□□ -1
PTPRC-212ENST00000491302 FKBP10Q96AY3 582 aa8.78□□□□□ -1
PTPRC-212ENST00000491302 HAPLN3Q96S86 360 aa8.78□□□□□ -1
PTPRC-212ENST00000491302 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
PTPRC-212ENST00000491302 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
PTPRC-212ENST00000491302 VPS16Q9H269 839 aa8.78□□□□□ -1
PTPRC-212ENST00000491302 FSCN3Q9NQT6 498 aa8.78□□□□□ -1
PTPRC-212ENST00000491302 SMPD4Q9NXE4 827 aa8.78□□□□□ -1
PTPRC-212ENST00000491302 NDUFAF4Q9P032 175 aa8.78□□□□□ -1
PTPRC-212ENST00000491302 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
PTPRC-212ENST00000491302 SLC13A4Q9UKG4 626 aa8.78□□□□□ -1
PTPRC-212ENST00000491302 DAPP1Q9UN19 280 aa8.78□□□□□ -1
PTPRC-212ENST00000491302 SH2B3Q9UQQ2 575 aa8.78□□□□□ -1
PTPRC-212ENST00000491302 FAM90A18PA6NE21 464 aa8.77□□□□□ -1.01
PTPRC-212ENST00000491302 FAM90A16PA6NEW6 464 aa8.77□□□□□ -1.01
PTPRC-212ENST00000491302 UNC119BA6NIH7 251 aa8.77□□□□□ -1.01
PTPRC-212ENST00000491302 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa8.77□□□□□ -1.01
PTPRC-212ENST00000491302 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa8.77□□□□□ -1.01
PTPRC-212ENST00000491302 PRRT4C9JH25 899 aa8.77□□□□□ -1.01
PTPRC-212ENST00000491302 KIAA0355O15063 1070 aa8.77□□□□□ -1.01
PTPRC-212ENST00000491302 LARGE1O95461 756 aa8.77□□□□□ -1.01
PTPRC-212ENST00000491302 TK1P04183 234 aa8.77□□□□□ -1.01
PTPRC-212ENST00000491302 FAM90A15PP0C7V4 464 aa8.77□□□□□ -1.01
PTPRC-212ENST00000491302 FAM90A14PP0C7W9 464 aa8.77□□□□□ -1.01
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM225BP0DP42 221 aa8.77□□□□□ -1.01
PTPRC-212ENST00000491302 NR4A1P22736 598 aa8.77□□□□□ -1.01
PTPRC-212ENST00000491302 YY1P25490 414 aa8.77□□□□□ -1.01
PTPRC-212ENST00000491302 PTGS2P35354 604 aa8.77□□□□□ -1.01
PTPRC-212ENST00000491302 LIPAP38571 399 aa8.77□□□□□ -1.01
PTPRC-212ENST00000491302 GSTM5P46439 218 aa8.77□□□□□ -1.01
PTPRC-212ENST00000491302 MCM2P49736 904 aa8.77□□□□□ -1.01
PTPRC-212ENST00000491302 PRKAA2P54646 552 aa8.77□□□□□ -1.01
PTPRC-212ENST00000491302 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
PTPRC-212ENST00000491302 SP2Q02086 613 aa8.77□□□□□ -1.01
PTPRC-212ENST00000491302 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
PTPRC-212ENST00000491302 P3H1Q32P28 736 aa8.77□□□□□ -1.01
PTPRC-212ENST00000491302 VWA1Q6PCB0 445 aa8.77□□□□□ -1.01
PTPRC-212ENST00000491302 TRABD2AQ86V40 505 aa8.77□□□□□ -1.01
PTPRC-212ENST00000491302 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa8.77□□□□□ -1.01
PTPRC-212ENST00000491302 OVCA2Q8WZ82 227 aa8.77□□□□□ -1.01
PTPRC-212ENST00000491302 EXTL1Q92935 676 aa8.77□□□□□ -1.01
PTPRC-212ENST00000491302 VPS50Q96JG6 964 aa8.77□□□□□ -1.01
PTPRC-212ENST00000491302 C8orf49Q96NF6 230 aa8.77□□□□□ -1.01
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