RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489485.5

CLDN11-209, Transcript of claudin 11, humanhuman

TSL 2

Gene CLDN11, Length 1,854 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN11-209ENST00000489485 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
CLDN11-209ENST00000489485 LZTFL1Q9NQ48 299 aa14.96□□□□□ -0.01
CLDN11-209ENST00000489485 COMMD8Q9NX08 183 aa14.96□□□□□ -0.01
CLDN11-209ENST00000489485 IL37Q9NZH6 218 aa14.96□□□□□ -0.01
CLDN11-209ENST00000489485 DUSP10Q9Y6W6 482 aa14.96□□□□□ -0.01
CLDN11-209ENST00000489485 ZSCAN12O43309 604 aa14.95□□□□□ -0.02
CLDN11-209ENST00000489485 FBXO21O94952 628 aa14.95□□□□□ -0.02
CLDN11-209ENST00000489485 RHOP08100 348 aa14.95□□□□□ -0.02
CLDN11-209ENST00000489485 GABRR2P28476 465 aa14.95□□□□□ -0.02
CLDN11-209ENST00000489485 GABRB2P47870 512 aa14.95□□□□□ -0.02
CLDN11-209ENST00000489485 NTHL1P78549 312 aa14.95□□□□□ -0.02
CLDN11-209ENST00000489485 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
CLDN11-209ENST00000489485 ITIH3Q06033 890 aa14.95□□□□□ -0.02
CLDN11-209ENST00000489485 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
CLDN11-209ENST00000489485 KIF5AQ12840 1032 aa14.95□□□□□ -0.02
CLDN11-209ENST00000489485 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa14.95□□□□□ -0.02
CLDN11-209ENST00000489485 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
CLDN11-209ENST00000489485 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
CLDN11-209ENST00000489485 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
CLDN11-209ENST00000489485 ZNF653Q96CK0 615 aa14.95□□□□□ -0.02
CLDN11-209ENST00000489485 ADAM7Q9H2U9 754 aa14.95□□□□□ -0.02
CLDN11-209ENST00000489485 MYO1AQ9UBC5 1043 aa14.95□□□□□ -0.02
CLDN11-209ENST00000489485 TRIM10Q9UDY6 481 aa14.95□□□□□ -0.02
CLDN11-209ENST00000489485 STRIP2Q9ULQ0 834 aa14.95□□□□□ -0.02
CLDN11-209ENST00000489485 SCML2Q9UQR0 700 aa14.95□□□□□ -0.02
CLDN11-209ENST00000489485 FAM92AA1XBS5 289 aa14.95□□□□□ -0.02
CLDN11-209ENST00000489485 GOLGA8SH3BPF8 625 aa14.95□□□□□ -0.02
CLDN11-209ENST00000489485 POU2F2P09086 479 aa14.95□□□□□ -0.02
CLDN11-209ENST00000489485 DAOAP59103 153 aa14.95□□□□□ -0.02
CLDN11-209ENST00000489485 PTP4A2Q12974 167 aa14.95□□□□□ -0.02
CLDN11-209ENST00000489485 ATAT1Q5SQI0 421 aa14.95□□□□□ -0.02
CLDN11-209ENST00000489485 PM20D1Q6GTS8 502 aa14.95□□□□□ -0.02
CLDN11-209ENST00000489485 ZSCAN30Q86W11 494 aa14.95□□□□□ -0.02
CLDN11-209ENST00000489485 XYLT1Q86Y38 959 aa14.95□□□□□ -0.02
CLDN11-209ENST00000489485 TMC8Q8IU68 726 aa14.95□□□□□ -0.02
CLDN11-209ENST00000489485 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa14.95□□□□□ -0.02
CLDN11-209ENST00000489485 FAM149B1Q96BN6 582 aa14.95□□□□□ -0.02
CLDN11-209ENST00000489485 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
CLDN11-209ENST00000489485 VCPIP1Q96JH7 1222 aa14.95□□□□□ -0.02
CLDN11-209ENST00000489485 MSLNLQ96KJ4 702 aa14.95□□□□□ -0.02
CLDN11-209ENST00000489485 LRRC3Q9BY71 257 aa14.95□□□□□ -0.02
CLDN11-209ENST00000489485 ATXN3LQ9H3M9 355 aa14.95□□□□□ -0.02
CLDN11-209ENST00000489485 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
CLDN11-209ENST00000489485 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
CLDN11-209ENST00000489485 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa14.95□□□□□ -0.02
CLDN11-209ENST00000489485 GMIPQ9P107 970 aa14.95□□□□□ -0.02
CLDN11-209ENST00000489485 COL6A3P12111 3177 aa14.95□□□□□ -0.02
CLDN11-209ENST00000489485 NOTCH4Q99466 2003 aa14.94□□□□□ -0.02
CLDN11-209ENST00000489485 A0A1W2PRU2 124 aa14.94□□□□□ -0.02
CLDN11-209ENST00000489485 YJEFN3A6XGL0 299 aa14.94□□□□□ -0.02
CLDN11-209ENST00000489485 E7ENQ6 273 aa14.94□□□□□ -0.02
CLDN11-209ENST00000489485 SART1O43290 800 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
CLDN11-209ENST00000489485 TMEM253P0C7T8 217 aa14.94□□□□□ -0.02
CLDN11-209ENST00000489485 GJA1P17302 382 aa14.94□□□□□ -0.02
CLDN11-209ENST00000489485 RRM1P23921 792 aa14.94□□□□□ -0.02
CLDN11-209ENST00000489485 GPC5P78333 572 aa14.94□□□□□ -0.02
CLDN11-209ENST00000489485 SLC6A3Q01959 620 aa14.94□□□□□ -0.02
CLDN11-209ENST00000489485 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa14.94□□□□□ -0.02
CLDN11-209ENST00000489485 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
CLDN11-209ENST00000489485 GAREM2Q75VX8 874 aa14.94□□□□□ -0.02
CLDN11-209ENST00000489485 MON1AQ86VX9 555 aa14.94□□□□□ -0.02
CLDN11-209ENST00000489485 REXO1L1PQ8IX06 675 aa14.94□□□□□ -0.02
CLDN11-209ENST00000489485 LEMD2Q8NC56 503 aa14.94□□□□□ -0.02
CLDN11-209ENST00000489485 PDZD8Q8NEN9 1154 aa14.94□□□□□ -0.02
CLDN11-209ENST00000489485 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
CLDN11-209ENST00000489485 GOLGA1Q92805 767 aa14.94□□□□□ -0.02
CLDN11-209ENST00000489485 HLA-CQ95604 372 aa14.94□□□□□ -0.02
CLDN11-209ENST00000489485 ARHGEF26Q96DR7 871 aa14.94□□□□□ -0.02
CLDN11-209ENST00000489485 GCNAQ96QF7 691 aa14.94□□□□□ -0.02
CLDN11-209ENST00000489485 S1PR5Q9H228 398 aa14.94□□□□□ -0.02
CLDN11-209ENST00000489485 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
CLDN11-209ENST00000489485 CD207Q9UJ71 328 aa14.94□□□□□ -0.02
CLDN11-209ENST00000489485 INTUQ9ULD6 942 aa14.94□□□□□ -0.02
CLDN11-209ENST00000489485 OBSL1O75147 1896 aa14.94□□□□□ -0.02
CLDN11-209ENST00000489485 DENND4CQ5VZ89 1909 aa14.93□□□□□ -0.02
CLDN11-209ENST00000489485 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
CLDN11-209ENST00000489485 A0A1W2PQH9 124 aa14.93□□□□□ -0.02
CLDN11-209ENST00000489485 GRAP2O75791 330 aa14.93□□□□□ -0.02
CLDN11-209ENST00000489485 MSNP26038 577 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
CLDN11-209ENST00000489485 CDC25CP30307 473 aa14.93□□□□□ -0.02
CLDN11-209ENST00000489485 CCR2P41597 374 aa14.93□□□□□ -0.02
CLDN11-209ENST00000489485 PGFP49763 221 aa14.93□□□□□ -0.02
CLDN11-209ENST00000489485 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
CLDN11-209ENST00000489485 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP14.93□□□□□ -0.02
CLDN11-209ENST00000489485 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
CLDN11-209ENST00000489485 TAF5Q15542 800 aa14.93□□□□□ -0.02
CLDN11-209ENST00000489485 OLFML1Q6UWY5 402 aa14.93□□□□□ -0.02
CLDN11-209ENST00000489485 SMRP1Q8NCR6 262 aa14.93□□□□□ -0.02
CLDN11-209ENST00000489485 TCEAL4Q96EI5 215 aa14.93□□□□□ -0.02
CLDN11-209ENST00000489485 TRIM11Q96F44 468 aa14.93□□□□□ -0.02
CLDN11-209ENST00000489485 IL21Q9HBE4 155 aa14.93□□□□□ -0.02
CLDN11-209ENST00000489485 WDR35Q9P2L0 1181 aa14.93□□□□□ -0.02
CLDN11-209ENST00000489485 GUCA1BQ9UMX6 200 aa14.93□□□□□ -0.02
CLDN11-209ENST00000489485 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
CLDN11-209ENST00000489485 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa14.93□□□□□ -0.02
CLDN11-209ENST00000489485 MACROD2A1Z1Q3 448 aa14.93□□□□□ -0.02
CLDN11-209ENST00000489485 ZNF197O14709 1029 aa14.93□□□□□ -0.02
CLDN11-209ENST00000489485 PJA2O43164 708 aa14.93□□□□□ -0.02
CLDN11-209ENST00000489485 KRT86O43790 486 aa14.93□□□□□ -0.02
CLDN11-209ENST00000489485 PAPLNO95428 1278 aa14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.7 ms