RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486941.1

SNRNP40-205, Transcript of small nuclear ribonucleoprotein U5 subunit 40, human

TSL 2

Gene SNRNP40, Length 743 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNRNP40-205	ENST00000486941	SSH3	Q8TE77	659 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	CASKIN2	Q8WXE0	1202 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	NELL1	Q92832	810 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	PARK7	Q99497	189 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	HTATIP2	Q9BUP3	242 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	IDI2	Q9BXS1	227 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	SENP6	Q9GZR1	1112 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	LANCL2	Q9NS86	450 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	MOCS1	Q9NZB8	636 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	RUVBL1	Q9Y265	456 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	SLC45A1	Q9Y2W3	748 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	AFG3L2	Q9Y4W6	797 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	PCDHGA2	Q9Y5H1	932 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	PHIP	Q8WWQ0	1821 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	GAK	O14976	1311 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	PDS5A	Q29RF7	1337 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	CTNND1	O60716	968 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	SGPL1	O95470	568 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	EYA4	O95677	639 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	CDK4	P11802	303 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	FCER1A	P12319	257 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	CCL5	P13501	91 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	PRDX5	P30044	214 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	IL15	P40933	162 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	MTNR1B	P49286	362 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	MXRA7	P84157	204 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	PRKCZ	Q05513	592 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	MALL	Q13021	153 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	ATP2B3	Q16720	1220 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	SCYL3	Q8IZE3	742 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	CCHCR1	Q8TD31	782 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	DPF1	Q92782	380 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	SLC2A13	Q96QE2	648 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	TLR10	Q9BXR5	811 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	C14orf119	Q9NWQ9	140 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	RNF7	Q9UBF6	113 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	NR2E3	Q9Y5X4	410 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	LRRFIP2	Q9Y608	721 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	ZHX2	Q9Y6X8	837 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNRNP40-205	ENST00000486941	DOCK1	Q14185	1865 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNRNP40-205	ENST00000486941	GPR75-ASB3	A0A0A6YYF3	556 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNRNP40-205	ENST00000486941		A0A1W2PPC1	479 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNRNP40-205	ENST00000486941	CDHR4	A6H8M9	788 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNRNP40-205	ENST00000486941	DDTL	A6NHG4	134 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SNRNP40-205	ENST00000486941	MAP4K4	O95819	1239 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SNRNP40-205	ENST00000486941	SBK3	P0C264	359 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNRNP40-205	ENST00000486941	CT47B1	P0C2W7	299 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SNRNP40-205	ENST00000486941	UBTFL1	P0CB47	393 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SNRNP40-205	ENST00000486941	OSM	P13725	252 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNRNP40-205	ENST00000486941	PHKA1	P46020	1223 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNRNP40-205	ENST00000486941	MGAT2	Q10469	447 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNRNP40-205	ENST00000486941	ANO4	Q32M45	955 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNRNP40-205	ENST00000486941	RAB11FIP1	Q6WKZ4	1283 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SNRNP40-205	ENST00000486941	ZNF788	Q6ZQV5	615 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNRNP40-205	ENST00000486941	TSHZ1	Q6ZSZ6	1077 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNRNP40-205	ENST00000486941	C1QL2	Q7Z5L3	287 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNRNP40-205	ENST00000486941	AFAP1L2	Q8N4X5	818 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNRNP40-205	ENST00000486941	U2AF1L4	Q8WU68	220 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SNRNP40-205	ENST00000486941	LRIG1	Q96JA1	1093 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNRNP40-205	ENST00000486941	ZNF778	Q96MU6	729 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNRNP40-205	ENST00000486941	SIL1	Q9H173	461 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNRNP40-205	ENST00000486941	PRO3102	Q9H379	93 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNRNP40-205	ENST00000486941	LRIT1	Q9P2V4	623 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNRNP40-205	ENST00000486941	GABRQ	Q9UN88	632 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNRNP40-205	ENST00000486941	APOBEC2	Q9Y235	224 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SNRNP40-205	ENST00000486941	MTO1	Q9Y2Z2	717 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SNRNP40-205	ENST00000486941	CUL9	Q8IWT3	2517 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNRNP40-205	ENST00000486941	RFX7	Q2KHR2	1363 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SNRNP40-205	ENST00000486941	ALPK3	Q96L96	1907 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SNRNP40-205	ENST00000486941	MROH7-TTC4	A0A0A0MT08	1334 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SNRNP40-205	ENST00000486941	ATAD5	Q96QE3	1844 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SNRNP40-205	ENST00000486941	TNPO2	O14787	897 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SNRNP40-205	ENST00000486941	PROP1	O75360	226 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SNRNP40-205	ENST00000486941	PRKD3	O94806	890 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SNRNP40-205	ENST00000486941	TFRC	P02786	760 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SNRNP40-205	ENST00000486941	ERBB2	P04626	1255 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SNRNP40-205	ENST00000486941	LDHC	P07864	332 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SNRNP40-205	ENST00000486941	GATA3	P23771	443 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SNRNP40-205	ENST00000486941	ADORA1	P30542	326 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SNRNP40-205	ENST00000486941	BTD	P43251	543 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SNRNP40-205	ENST00000486941	ABCG1	P45844	678 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SNRNP40-205	ENST00000486941	RHBDL3	P58872	404 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SNRNP40-205	ENST00000486941	TIMM10	P62072	90 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SNRNP40-205	ENST00000486941	STAT4	Q14765	748 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SNRNP40-205	ENST00000486941	FAM110C	Q1W6H9	321 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SNRNP40-205	ENST00000486941	GADL1	Q6ZQY3	521 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SNRNP40-205	ENST00000486941	DZIP1	Q86YF9	867 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SNRNP40-205	ENST00000486941	SMCR8	Q8TEV9	937 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SNRNP40-205	ENST00000486941	COA7	Q96BR5	231 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SNRNP40-205	ENST00000486941	API5	Q9BZZ5	524 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SNRNP40-205	ENST00000486941	REXO4	Q9GZR2	422 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SNRNP40-205	ENST00000486941	OSBPL5	Q9H0X9	879 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SNRNP40-205	ENST00000486941	DDX4	Q9NQI0	724 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SNRNP40-205	ENST00000486941	SMC4	Q9NTJ3	1288 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SNRNP40-205	ENST00000486941	CCM2L	Q9NUG4	571 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SNRNP40-205	ENST00000486941	SLC17A6	Q9P2U8	582 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SNRNP40-205	ENST00000486941	ABCF2	Q9UG63	623 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SNRNP40-205	ENST00000486941	AGTPBP1	Q9UPW5	1226 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SNRNP40-205	ENST00000486941	RANBP2	P49792	3224 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SNRNP40-205	ENST00000486941	LOC285556	D6RIA3	1793 aa		4.81	□□□□□ -1.64

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