RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485532.1

PRAME-212, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 709 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-212ENST00000485532 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP13.38□□□□□ -0.27
PRAME-212ENST00000485532 KAT7O95251 611 aa13.38□□□□□ -0.27
PRAME-212ENST00000485532 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP13.38□□□□□ -0.27
PRAME-212ENST00000485532 NR3C1P04150 777 aa13.38□□□□□ -0.27
PRAME-212ENST00000485532 ADH5P11766 374 aa13.38□□□□□ -0.27
PRAME-212ENST00000485532 GBP1P32455 592 aa13.38□□□□□ -0.27
PRAME-212ENST00000485532 NDST1P52848 882 aa13.38□□□□□ -0.27
PRAME-212ENST00000485532 MAP3K7CLP57077 242 aa13.38□□□□□ -0.27
PRAME-212ENST00000485532 CAMK4Q16566 473 aa13.38□□□□□ -0.27
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PRAME-212ENST00000485532 CEP135Q66GS9 1140 aa13.38□□□□□ -0.27
PRAME-212ENST00000485532 IL31Q6EBC2 164 aa13.38□□□□□ -0.27
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PRAME-212ENST00000485532 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP13.38□□□□□ -0.27
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PRAME-212ENST00000485532 SLC2A14Q8TDB8 520 aa13.38□□□□□ -0.27
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PRAME-212ENST00000485532 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP13.38□□□□□ -0.27
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PRAME-212ENST00000485532 CHD8Q9HCK8 2581 aa13.38□□□□□ -0.27
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PRAME-212ENST00000485532 TBX18O95935 607 aa13.37□□□□□ -0.27
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PRAME-212ENST00000485532 HECTD3Q5T447 861 aa13.37□□□□□ -0.27
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PRAME-212ENST00000485532 TWNKQ96RR1 684 aa13.37□□□□□ -0.27
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PRAME-212ENST00000485532 ADAM23O75077 832 aa13.36□□□□□ -0.27
PRAME-212ENST00000485532 CAVIN2O95810 425 aa13.36□□□□□ -0.27
PRAME-212ENST00000485532 ADH1CP00326 375 aa13.36□□□□□ -0.27
PRAME-212ENST00000485532 RPN1P04843 607 aaKnown RBP13.36□□□□□ -0.27
PRAME-212ENST00000485532 APODP05090 189 aa13.36□□□□□ -0.27
PRAME-212ENST00000485532 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa13.36□□□□□ -0.27
PRAME-212ENST00000485532 TRIM49P0CI25 452 aa13.36□□□□□ -0.27
PRAME-212ENST00000485532 TRIM49CP0CI26 452 aa13.36□□□□□ -0.27
PRAME-212ENST00000485532 PIK3CAP42336 1068 aa13.36□□□□□ -0.27
PRAME-212ENST00000485532 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP13.36□□□□□ -0.27
PRAME-212ENST00000485532 ASPAP45381 313 aa13.36□□□□□ -0.27
PRAME-212ENST00000485532 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa13.36□□□□□ -0.27
PRAME-212ENST00000485532 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP13.36□□□□□ -0.27
PRAME-212ENST00000485532 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP13.36□□□□□ -0.27
PRAME-212ENST00000485532 SNX30Q5VWJ9 437 aa13.36□□□□□ -0.27
PRAME-212ENST00000485532 PMS2CLQ68D20 193 aa13.36□□□□□ -0.27
PRAME-212ENST00000485532 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP13.36□□□□□ -0.27
PRAME-212ENST00000485532 TMEM25Q86YD3 366 aa13.36□□□□□ -0.27
PRAME-212ENST00000485532 TMC2Q8TDI7 906 aa13.36□□□□□ -0.27
PRAME-212ENST00000485532 OVCA2Q8WZ82 227 aa13.36□□□□□ -0.27
PRAME-212ENST00000485532 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP13.36□□□□□ -0.27
PRAME-212ENST00000485532 ERLEC1Q96DZ1 483 aa13.36□□□□□ -0.27
PRAME-212ENST00000485532 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP13.36□□□□□ -0.27
PRAME-212ENST00000485532 OSER1Q9NX31 292 aa13.36□□□□□ -0.27
PRAME-212ENST00000485532 CACNA1BQ00975 2339 aa13.36□□□□□ -0.27
PRAME-212ENST00000485532 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
PRAME-212ENST00000485532 FAM92AA1XBS5 289 aa13.35□□□□□ -0.27
PRAME-212ENST00000485532 MDM4O15151 490 aa13.35□□□□□ -0.27
PRAME-212ENST00000485532 TLR5O60602 858 aa13.35□□□□□ -0.27
PRAME-212ENST00000485532 TULP3O75386 442 aa13.35□□□□□ -0.27
PRAME-212ENST00000485532 ASS1P00966 412 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
PRAME-212ENST00000485532 GCLMP48507 274 aa13.35□□□□□ -0.27
PRAME-212ENST00000485532 VAMP7P51809 220 aa13.35□□□□□ -0.27
PRAME-212ENST00000485532 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
PRAME-212ENST00000485532 PNOCQ13519 176 aa13.35□□□□□ -0.27
PRAME-212ENST00000485532 RNF43Q68DV7 783 aa13.35□□□□□ -0.27
PRAME-212ENST00000485532 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa13.35□□□□□ -0.27
PRAME-212ENST00000485532 CRYBG2Q8N1P7 616 aa13.35□□□□□ -0.27
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