RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 BECN2A8MW95 431 aa22.06■■□□□ 1.12
ACTB-211ENST00000480301 TLR5O60602 858 aa22.06■■□□□ 1.12
ACTB-211ENST00000480301 SETSIPP0DME0 302 aa22.06■■□□□ 1.12
ACTB-211ENST00000480301 ARSAP15289 507 aa22.06■■□□□ 1.12
ACTB-211ENST00000480301 PLA2G4AP47712 749 aa22.06■■□□□ 1.12
ACTB-211ENST00000480301 FZD5Q13467 585 aa22.06■■□□□ 1.12
ACTB-211ENST00000480301 RUNX3Q13761 415 aa22.06■■□□□ 1.12
ACTB-211ENST00000480301 PDGFRLQ15198 375 aa22.06■■□□□ 1.12
ACTB-211ENST00000480301 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa22.06■■□□□ 1.12
ACTB-211ENST00000480301 FAM3CQ92520 227 aa22.06■■□□□ 1.12
ACTB-211ENST00000480301 LINC00597Q9H2U6 94 aa22.06■■□□□ 1.12
ACTB-211ENST00000480301 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP22.06■■□□□ 1.124e-25■□□□□ 10.3
ACTB-211ENST00000480301 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
ACTB-211ENST00000480301 DNAJC12Q9UKB3 198 aa22.06■■□□□ 1.12
ACTB-211ENST00000480301 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
ACTB-211ENST00000480301 WNT6Q9Y6F9 365 aa22.06■■□□□ 1.12
ACTB-211ENST00000480301 MUC6Q6W4X9 2439 aa22.05■■□□□ 1.12
ACTB-211ENST00000480301 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa22.05■■□□□ 1.12
ACTB-211ENST00000480301 PES1O00541 588 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
ACTB-211ENST00000480301 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
ACTB-211ENST00000480301 TBX18O95935 607 aa22.05■■□□□ 1.12
ACTB-211ENST00000480301 TKTL1P51854 596 aa22.05■■□□□ 1.12
ACTB-211ENST00000480301 EML3Q32P44 896 aa22.05■■□□□ 1.12
ACTB-211ENST00000480301 PM20D1Q6GTS8 502 aa22.05■■□□□ 1.12
ACTB-211ENST00000480301 SLC35F5Q8WV83 523 aa22.05■■□□□ 1.12
ACTB-211ENST00000480301 KCTD13Q8WZ19 329 aa22.05■■□□□ 1.12
ACTB-211ENST00000480301 SHC3Q92529 594 aa22.05■■□□□ 1.12
ACTB-211ENST00000480301 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
ACTB-211ENST00000480301 MSANTD3Q96H12 275 aa22.05■■□□□ 1.12
ACTB-211ENST00000480301 PRRX2Q99811 253 aa22.05■■□□□ 1.12
ACTB-211ENST00000480301 VPS16Q9H269 839 aa22.05■■□□□ 1.12
ACTB-211ENST00000480301 HSD3B7Q9H2F3 369 aa22.05■■□□□ 1.12
ACTB-211ENST00000480301 GABBR2O75899 941 aa22.04■■□□□ 1.12
ACTB-211ENST00000480301 RARGP13631 454 aa22.04■■□□□ 1.12
ACTB-211ENST00000480301 CTHP32929 405 aa22.04■■□□□ 1.12
ACTB-211ENST00000480301 IFNAR2P48551 515 aa22.04■■□□□ 1.12
ACTB-211ENST00000480301 PSEN1P49768 467 aa22.04■■□□□ 1.12
ACTB-211ENST00000480301 TCF15Q12870 199 aa22.04■■□□□ 1.12
ACTB-211ENST00000480301 ANO6Q4KMQ2 910 aa22.04■■□□□ 1.12
ACTB-211ENST00000480301 SMYD5Q6GMV2 418 aa22.04■■□□□ 1.12
ACTB-211ENST00000480301 TXNDC11Q6PKC3 985 aa22.04■■□□□ 1.12
ACTB-211ENST00000480301 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
ACTB-211ENST00000480301 ZNF276Q8N554 614 aa22.04■■□□□ 1.12
ACTB-211ENST00000480301 KIAA1958Q8N8K9 716 aa22.04■■□□□ 1.12
ACTB-211ENST00000480301 DTWD2Q8NBA8 298 aa22.04■■□□□ 1.12
ACTB-211ENST00000480301 CLDN23Q96B33 292 aa22.04■■□□□ 1.12
ACTB-211ENST00000480301 CHFRQ96EP1 664 aa22.04■■□□□ 1.12
ACTB-211ENST00000480301 ACP6Q9NPH0 428 aa22.04■■□□□ 1.12
ACTB-211ENST00000480301 CFAP97Q9P2B7 532 aa22.04■■□□□ 1.12
ACTB-211ENST00000480301 NAGPAQ9UK23 515 aa22.04■■□□□ 1.12
ACTB-211ENST00000480301 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
ACTB-211ENST00000480301 M0QYV0 167 aa22.03■■□□□ 1.12
ACTB-211ENST00000480301 ZBED1O96006 694 aa22.03■■□□□ 1.12
ACTB-211ENST00000480301 ZNF18P17022 549 aa22.03■■□□□ 1.12
ACTB-211ENST00000480301 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
ACTB-211ENST00000480301 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa22.03■■□□□ 1.12
ACTB-211ENST00000480301 PMF1Q6P1K2 205 aa22.03■■□□□ 1.12
ACTB-211ENST00000480301 KLHDC10Q6PID8 442 aa22.03■■□□□ 1.12
ACTB-211ENST00000480301 BHLHA9Q7RTU4 235 aa22.03■■□□□ 1.12
ACTB-211ENST00000480301 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP22.03■■□□□ 1.122e-24■□□□□ 9.3
ACTB-211ENST00000480301 ZNF606Q8WXB4 792 aa22.03■■□□□ 1.12
ACTB-211ENST00000480301 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
ACTB-211ENST00000480301 FUCA2Q9BTY2 467 aa22.03■■□□□ 1.12
ACTB-211ENST00000480301 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
ACTB-211ENST00000480301 ULBP1Q9BZM6 244 aa22.03■■□□□ 1.12
ACTB-211ENST00000480301 ECT2Q9H8V3 914 aa22.03■■□□□ 1.12
ACTB-211ENST00000480301 LRRC4Q9HBW1 653 aa22.03■■□□□ 1.12
ACTB-211ENST00000480301 CLIC5Q9NZA1 410 aa22.03■■□□□ 1.12
ACTB-211ENST00000480301 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
ACTB-211ENST00000480301 NUDT5Q9UKK9 219 aa22.03■■□□□ 1.12
ACTB-211ENST00000480301 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
ACTB-211ENST00000480301 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
ACTB-211ENST00000480301 PTMSP20962 102 aa22.02■■□□□ 1.12
ACTB-211ENST00000480301 GNA15P30679 374 aa22.02■■□□□ 1.12
ACTB-211ENST00000480301 USP8P40818 1118 aa22.02■■□□□ 1.12
ACTB-211ENST00000480301 GPD2P43304 727 aa22.02■■□□□ 1.12
ACTB-211ENST00000480301 RGS7P49802 495 aa22.02■■□□□ 1.12
ACTB-211ENST00000480301 COPB1P53618 953 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
ACTB-211ENST00000480301 ADIGQ0VDE8 80 aa22.02■■□□□ 1.12
ACTB-211ENST00000480301 C1orf228Q6PIY5 440 aa22.02■■□□□ 1.12
ACTB-211ENST00000480301 AOPEPQ8N6M6 819 aa22.02■■□□□ 1.12
ACTB-211ENST00000480301 WBP2Q969T9 261 aa22.02■■□□□ 1.12
ACTB-211ENST00000480301 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
ACTB-211ENST00000480301 NACA2Q9H009 215 aa22.02■■□□□ 1.12
ACTB-211ENST00000480301 HELZP42694 1942 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.11
ACTB-211ENST00000480301 E2F8A0AVK6 867 aa22.01■■□□□ 1.11
ACTB-211ENST00000480301 LRRC10BA6NIK2 292 aa22.01■■□□□ 1.11
ACTB-211ENST00000480301 MDM4O15151 490 aa22.01■■□□□ 1.11
ACTB-211ENST00000480301 NCAM2O15394 837 aa22.01■■□□□ 1.11
ACTB-211ENST00000480301 RALAP11233 206 aa22.01■■□□□ 1.11
ACTB-211ENST00000480301 MEA1Q16626 185 aa22.01■■□□□ 1.11
ACTB-211ENST00000480301 DENND1BQ6P3S1 775 aa22.01■■□□□ 1.11
ACTB-211ENST00000480301 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa22.01■■□□□ 1.11
ACTB-211ENST00000480301 SCML4Q8N228 414 aa22.01■■□□□ 1.11
ACTB-211ENST00000480301 ARHGAP18Q8N392 663 aa22.01■■□□□ 1.11
ACTB-211ENST00000480301 CPA6Q8N4T0 437 aa22.01■■□□□ 1.11
ACTB-211ENST00000480301 ATP2A3Q93084 1043 aa22.01■■□□□ 1.11
ACTB-211ENST00000480301 HSFY1Q96LI6 401 aa22.01■■□□□ 1.11
ACTB-211ENST00000480301 BPIFA3Q9BQP9 254 aa22.01■■□□□ 1.11
ACTB-211ENST00000480301 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
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