RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477612.5

COL9A3-211, Transcript of collagen type IX alpha 3 chain, humanhuman

TSL 3

Gene COL9A3, Length 635 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3-211ENST00000477612 CAMK4Q16566 473 aa22.95■■□□□ 1.26
COL9A3-211ENST00000477612 GAB4Q2WGN9 574 aa22.95■■□□□ 1.26
COL9A3-211ENST00000477612 FBXO43Q4G163 708 aa22.95■■□□□ 1.26
COL9A3-211ENST00000477612 KLHDC10Q6PID8 442 aa22.95■■□□□ 1.26
COL9A3-211ENST00000477612 CCDC186Q7Z3E2 898 aa22.95■■□□□ 1.26
COL9A3-211ENST00000477612 ANKRD52Q8NB46 1076 aa22.95■■□□□ 1.26
COL9A3-211ENST00000477612 TTC16Q8NEE8 873 aa22.95■■□□□ 1.26
COL9A3-211ENST00000477612 CD101Q93033 1021 aa22.95■■□□□ 1.26
COL9A3-211ENST00000477612 OTUB2Q96DC9 234 aa22.95■■□□□ 1.26
COL9A3-211ENST00000477612 CFAP54Q96N23 3096 aa22.95■■□□□ 1.26
COL9A3-211ENST00000477612 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
COL9A3-211ENST00000477612 CFAP97Q9P2B7 532 aa22.95■■□□□ 1.26
COL9A3-211ENST00000477612 TBC1D14Q9P2M4 693 aa22.95■■□□□ 1.26
COL9A3-211ENST00000477612 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa22.94■■□□□ 1.26
COL9A3-211ENST00000477612 K7ESF4 209 aa22.94■■□□□ 1.26
COL9A3-211ENST00000477612 TLR5O60602 858 aa22.94■■□□□ 1.26
COL9A3-211ENST00000477612 PSEN1P49768 467 aa22.94■■□□□ 1.26
COL9A3-211ENST00000477612 CETN1Q12798 172 aa22.94■■□□□ 1.26
COL9A3-211ENST00000477612 KCNH2Q12809 1159 aa22.94■■□□□ 1.26
COL9A3-211ENST00000477612 RAB41Q5JT25 222 aa22.94■■□□□ 1.26
COL9A3-211ENST00000477612 ATRIPQ8WXE1 791 aa22.94■■□□□ 1.26
COL9A3-211ENST00000477612 OSER1Q9NX31 292 aa22.94■■□□□ 1.26
COL9A3-211ENST00000477612 RWDD2AQ9UIY3 292 aa22.94■■□□□ 1.26
COL9A3-211ENST00000477612 KIAA1257Q9ULG3 409 aa22.94■■□□□ 1.26
COL9A3-211ENST00000477612 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa22.94■■□□□ 1.26
COL9A3-211ENST00000477612 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa22.93■■□□□ 1.26
COL9A3-211ENST00000477612 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
COL9A3-211ENST00000477612 EGFP01133 1207 aa22.93■■□□□ 1.26
COL9A3-211ENST00000477612 OPRD1P41143 372 aa22.93■■□□□ 1.26
COL9A3-211ENST00000477612 DHCR24Q15392 516 aa22.93■■□□□ 1.26
COL9A3-211ENST00000477612 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
COL9A3-211ENST00000477612 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
COL9A3-211ENST00000477612 NT5C1BQ96P26 610 aa22.93■■□□□ 1.26
COL9A3-211ENST00000477612 NMUR1Q9HB89 426 aa22.93■■□□□ 1.26
COL9A3-211ENST00000477612 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP22.93■■□□□ 1.26
COL9A3-211ENST00000477612 ZNF292O60281 2723 aa22.92■■□□□ 1.26
COL9A3-211ENST00000477612 CYP26A1O43174 497 aa22.92■■□□□ 1.26
COL9A3-211ENST00000477612 ATG13O75143 517 aa22.92■■□□□ 1.26
COL9A3-211ENST00000477612 CYP17A1P05093 508 aa22.92■■□□□ 1.26
COL9A3-211ENST00000477612 CCDC192P0DO97 292 aa22.92■■□□□ 1.26
COL9A3-211ENST00000477612 VDRP11473 427 aa22.92■■□□□ 1.26
COL9A3-211ENST00000477612 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
COL9A3-211ENST00000477612 LRMPQ12912 555 aa22.92■■□□□ 1.26
COL9A3-211ENST00000477612 RHBDF2Q6PJF5 856 aa22.92■■□□□ 1.26
COL9A3-211ENST00000477612 SCD5Q86SK9 330 aa22.92■■□□□ 1.26
COL9A3-211ENST00000477612 PIGZQ86VD9 579 aa22.92■■□□□ 1.26
COL9A3-211ENST00000477612 TTC30AQ86WT1 665 aa22.92■■□□□ 1.26
COL9A3-211ENST00000477612 EHBP1Q8NDI1 1231 aa22.92■■□□□ 1.26
COL9A3-211ENST00000477612 JAKMIP2Q96AA8 810 aa22.92■■□□□ 1.26
COL9A3-211ENST00000477612 MED15Q96RN5 788 aa22.92■■□□□ 1.26
COL9A3-211ENST00000477612 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
COL9A3-211ENST00000477612 EPC1Q9H2F5 836 aa22.92■■□□□ 1.26
COL9A3-211ENST00000477612 C2orf42Q9NWW7 574 aa22.92■■□□□ 1.26
COL9A3-211ENST00000477612 CLIC5Q9NZA1 410 aa22.92■■□□□ 1.26
COL9A3-211ENST00000477612 FRYLO94915 3013 aa22.92■■□□□ 1.26
COL9A3-211ENST00000477612 EML5Q05BV3 1969 aa22.91■■□□□ 1.26
COL9A3-211ENST00000477612 GREM1O60565 184 aa22.91■■□□□ 1.26
COL9A3-211ENST00000477612 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
COL9A3-211ENST00000477612 SGO2Q562F6 1265 aa22.91■■□□□ 1.26
COL9A3-211ENST00000477612 PKN3Q6P5Z2 889 aa22.91■■□□□ 1.26
COL9A3-211ENST00000477612 HTR3DQ70Z44 454 aa22.91■■□□□ 1.26
COL9A3-211ENST00000477612 MLKLQ8NB16 471 aa22.91■■□□□ 1.26
COL9A3-211ENST00000477612 CLSTN2Q9H4D0 955 aa22.91■■□□□ 1.26
COL9A3-211ENST00000477612 TSPAN16Q9UKR8 245 aa22.91■■□□□ 1.26
COL9A3-211ENST00000477612 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa22.91■■□□□ 1.26
COL9A3-211ENST00000477612 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP22.91■■□□□ 1.26
COL9A3-211ENST00000477612 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
COL9A3-211ENST00000477612 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
COL9A3-211ENST00000477612 A0A1W2PQH9 124 aa22.9■■□□□ 1.26
COL9A3-211ENST00000477612 RNF40O75150 1001 aa22.9■■□□□ 1.26
COL9A3-211ENST00000477612 TBX18O95935 607 aa22.9■■□□□ 1.26
COL9A3-211ENST00000477612 AFPP02771 609 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
COL9A3-211ENST00000477612 PAEPP09466 180 aa22.9■■□□□ 1.26
COL9A3-211ENST00000477612 RARGP13631 454 aa22.9■■□□□ 1.26
COL9A3-211ENST00000477612 SLC8A3P57103 927 aa22.9■■□□□ 1.26
COL9A3-211ENST00000477612 GCNT1Q02742 428 aa22.9■■□□□ 1.26
COL9A3-211ENST00000477612 PKDCCQ504Y2 493 aa22.9■■□□□ 1.26
COL9A3-211ENST00000477612 PM20D1Q6GTS8 502 aa22.9■■□□□ 1.26
COL9A3-211ENST00000477612 WBP2Q969T9 261 aa22.9■■□□□ 1.26
COL9A3-211ENST00000477612 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa22.89■■□□□ 1.26
COL9A3-211ENST00000477612 A0A0A0MRY4 1105 aa22.89■■□□□ 1.25
COL9A3-211ENST00000477612 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
COL9A3-211ENST00000477612 CNR2P34972 360 aa22.89■■□□□ 1.25
COL9A3-211ENST00000477612 BCAT1P54687 386 aa22.89■■□□□ 1.25
COL9A3-211ENST00000477612 PPM1KQ8N3J5 372 aa22.89■■□□□ 1.25
COL9A3-211ENST00000477612 CCDC26Q8TAB7 109 aa22.89■■□□□ 1.25
COL9A3-211ENST00000477612 NACA2Q9H009 215 aa22.89■■□□□ 1.25
COL9A3-211ENST00000477612 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa22.88■■□□□ 1.25
COL9A3-211ENST00000477612 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
COL9A3-211ENST00000477612 O00370 1275 aa22.88■■□□□ 1.25
COL9A3-211ENST00000477612 ADH1CP00326 375 aa22.88■■□□□ 1.25
COL9A3-211ENST00000477612 PLA2G4AP47712 749 aa22.88■■□□□ 1.25
COL9A3-211ENST00000477612 PDE4CQ08493 712 aa22.88■■□□□ 1.25
COL9A3-211ENST00000477612 BST2Q10589 180 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
COL9A3-211ENST00000477612 TMEM270Q6UE05 265 aa22.88■■□□□ 1.25
COL9A3-211ENST00000477612 LCLAT1Q6UWP7 414 aa22.88■■□□□ 1.25
COL9A3-211ENST00000477612 TADA2BQ86TJ2 420 aa22.88■■□□□ 1.25
COL9A3-211ENST00000477612 LONP2Q86WA8 852 aa22.88■■□□□ 1.25
COL9A3-211ENST00000477612 BBS7Q8IWZ6 715 aa22.88■■□□□ 1.25
COL9A3-211ENST00000477612 KAT5Q92993 513 aa22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.7 ms