RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476612.1

UBE2Q1-204, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 Q1, human

TSL 3

Gene UBE2Q1, Length 301 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBE2Q1-204	ENST00000476612	CSGALNACT1	Q8TDX6	532 aa		4.2	□□□□□ -1.74
UBE2Q1-204	ENST00000476612	SLC35F5	Q8WV83	523 aa		4.2	□□□□□ -1.74
UBE2Q1-204	ENST00000476612	OVCA2	Q8WZ82	227 aa		4.2	□□□□□ -1.74
UBE2Q1-204	ENST00000476612	FAXDC2	Q96IV6	333 aa		4.2	□□□□□ -1.74
UBE2Q1-204	ENST00000476612	GCNA	Q96QF7	691 aa		4.2	□□□□□ -1.74
UBE2Q1-204	ENST00000476612	TSG101	Q99816	390 aa		4.2	□□□□□ -1.74
UBE2Q1-204	ENST00000476612	CRACR2A	Q9BSW2	395 aa		4.2	□□□□□ -1.74
UBE2Q1-204	ENST00000476612	GTPBP4	Q9BZE4	634 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
UBE2Q1-204	ENST00000476612	UBXN6	Q9BZV1	441 aa		4.2	□□□□□ -1.74
UBE2Q1-204	ENST00000476612	KIF9	Q9HAQ2	790 aa		4.2	□□□□□ -1.74
UBE2Q1-204	ENST00000476612	METTL14	Q9HCE5	456 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
UBE2Q1-204	ENST00000476612	SIX2	Q9NPC8	291 aa		4.2	□□□□□ -1.74
UBE2Q1-204	ENST00000476612	CYLD	Q9NQC7	956 aa		4.2	□□□□□ -1.74
UBE2Q1-204	ENST00000476612	SAMSN1	Q9NSI8	373 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
UBE2Q1-204	ENST00000476612	MTPAP	Q9NVV4	582 aa	Known RBP eCLIP	4.2	□□□□□ -1.74
UBE2Q1-204	ENST00000476612	SPATA6	Q9NWH7	488 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
UBE2Q1-204	ENST00000476612	THG1L	Q9NWX6	298 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
UBE2Q1-204	ENST00000476612	COMMD8	Q9NX08	183 aa		4.2	□□□□□ -1.74
UBE2Q1-204	ENST00000476612	DUS2	Q9NX74	493 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
UBE2Q1-204	ENST00000476612	CFAP97	Q9P2B7	532 aa		4.2	□□□□□ -1.74
UBE2Q1-204	ENST00000476612	CYTH4	Q9UIA0	394 aa		4.2	□□□□□ -1.74
UBE2Q1-204	ENST00000476612	RWDD2A	Q9UIY3	292 aa		4.2	□□□□□ -1.74
UBE2Q1-204	ENST00000476612	ZMYM5	Q9UJ78	669 aa		4.2	□□□□□ -1.74
UBE2Q1-204	ENST00000476612	FBXO4	Q9UKT5	387 aa		4.2	□□□□□ -1.74
UBE2Q1-204	ENST00000476612	CLEC4E	Q9ULY5	219 aa		4.2	□□□□□ -1.74
UBE2Q1-204	ENST00000476612	MRPS17	Q9Y2R5	130 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
UBE2Q1-204	ENST00000476612	GVINP1	Q7Z2Y8	2422 aa		4.2	□□□□□ -1.74
UBE2Q1-204	ENST00000476612	E2F8	A0AVK6	867 aa		4.19	□□□□□ -1.74
UBE2Q1-204	ENST00000476612	YJEFN3	A6XGL0	299 aa		4.19	□□□□□ -1.74
UBE2Q1-204	ENST00000476612	CHURC1-FNTB	B4DL54	471 aa		4.19	□□□□□ -1.74
UBE2Q1-204	ENST00000476612		E7ENQ6	273 aa		4.19	□□□□□ -1.74
UBE2Q1-204	ENST00000476612	GFRA2	O00451	464 aa		4.19	□□□□□ -1.74
UBE2Q1-204	ENST00000476612	PIK3R2	O00459	728 aa		4.19	□□□□□ -1.74
UBE2Q1-204	ENST00000476612	NCAM2	O15394	837 aa		4.19	□□□□□ -1.74
UBE2Q1-204	ENST00000476612	P4HA2	O15460	535 aa		4.19	□□□□□ -1.74
UBE2Q1-204	ENST00000476612	STX10	O60499	249 aa		4.19	□□□□□ -1.74
UBE2Q1-204	ENST00000476612	GFRA3	O60609	400 aa		4.19	□□□□□ -1.74
UBE2Q1-204	ENST00000476612	ADAM23	O75077	832 aa		4.19	□□□□□ -1.74
UBE2Q1-204	ENST00000476612	RNF40	O75150	1001 aa		4.19	□□□□□ -1.74
UBE2Q1-204	ENST00000476612	STC2	O76061	302 aa		4.19	□□□□□ -1.74
UBE2Q1-204	ENST00000476612	PAPSS2	O95340	614 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
UBE2Q1-204	ENST00000476612	AFP	P02771	609 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
UBE2Q1-204	ENST00000476612	PAEP	P09466	180 aa		4.19	□□□□□ -1.74
UBE2Q1-204	ENST00000476612	CISD3	P0C7P0	127 aa		4.19	□□□□□ -1.74
UBE2Q1-204	ENST00000476612	PNMA6A	P0CW24	399 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
UBE2Q1-204	ENST00000476612	MBL2	P11226	248 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
UBE2Q1-204	ENST00000476612	VDR	P11473	427 aa		4.19	□□□□□ -1.74
UBE2Q1-204	ENST00000476612	RARG	P13631	454 aa		4.19	□□□□□ -1.74
UBE2Q1-204	ENST00000476612	PFKL	P17858	780 aa		4.19	□□□□□ -1.74
UBE2Q1-204	ENST00000476612	RFX1	P22670	979 aa		4.19	□□□□□ -1.74
UBE2Q1-204	ENST00000476612	BRD2	P25440	801 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
UBE2Q1-204	ENST00000476612	PON1	P27169	355 aa		4.19	□□□□□ -1.74
UBE2Q1-204	ENST00000476612	GPD2	P43304	727 aa		4.19	□□□□□ -1.74
UBE2Q1-204	ENST00000476612	KIR2DL1	P43626	348 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
UBE2Q1-204	ENST00000476612	RPL34	P49207	117 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
UBE2Q1-204	ENST00000476612	FNTB	P49356	437 aa		4.19	□□□□□ -1.74
UBE2Q1-204	ENST00000476612	TUB	P50607	506 aa		4.19	□□□□□ -1.74
UBE2Q1-204	ENST00000476612	STIM1	Q13586	685 aa		4.19	□□□□□ -1.74
UBE2Q1-204	ENST00000476612	TAF5	Q15542	800 aa		4.19	□□□□□ -1.74
UBE2Q1-204	ENST00000476612	CNGA2	Q16280	664 aa		4.19	□□□□□ -1.74
UBE2Q1-204	ENST00000476612	GOLGA7B	Q2TAP0	167 aa		4.19	□□□□□ -1.74
UBE2Q1-204	ENST00000476612	CCDC40	Q4G0X9	1142 aa		4.19	□□□□□ -1.74
UBE2Q1-204	ENST00000476612	HSP90AA4P	Q58FG1	418 aa		4.19	□□□□□ -1.74
UBE2Q1-204	ENST00000476612	CC2D1A	Q6P1N0	951 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
UBE2Q1-204	ENST00000476612	DENND1B	Q6P3S1	775 aa		4.19	□□□□□ -1.74
UBE2Q1-204	ENST00000476612	TMEM270	Q6UE05	265 aa		4.19	□□□□□ -1.74
UBE2Q1-204	ENST00000476612	LCLAT1	Q6UWP7	414 aa		4.19	□□□□□ -1.74
UBE2Q1-204	ENST00000476612	TMEM92	Q6UXU6	159 aa		4.19	□□□□□ -1.74
UBE2Q1-204	ENST00000476612	RBM43	Q6ZSC3	357 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
UBE2Q1-204	ENST00000476612	TOGARAM2	Q6ZUX3	1019 aa		4.19	□□□□□ -1.74
UBE2Q1-204	ENST00000476612	CCDC186	Q7Z3E2	898 aa		4.19	□□□□□ -1.74
UBE2Q1-204	ENST00000476612	MIB1	Q86YT6	1006 aa		4.19	□□□□□ -1.74
UBE2Q1-204	ENST00000476612	ETFBKMT	Q8IXQ9	262 aa		4.19	□□□□□ -1.74
UBE2Q1-204	ENST00000476612	PPM1K	Q8N3J5	372 aa		4.19	□□□□□ -1.74
UBE2Q1-204	ENST00000476612	ZNF276	Q8N554	614 aa		4.19	□□□□□ -1.74
UBE2Q1-204	ENST00000476612	WDTC1	Q8N5D0	677 aa		4.19	□□□□□ -1.74
UBE2Q1-204	ENST00000476612	NAT16	Q8N8M0	369 aa		4.19	□□□□□ -1.74
UBE2Q1-204	ENST00000476612	USP33	Q8TEY7	942 aa		4.19	□□□□□ -1.74
UBE2Q1-204	ENST00000476612	CLEC4C	Q8WTT0	213 aa		4.19	□□□□□ -1.74
UBE2Q1-204	ENST00000476612	CD101	Q93033	1021 aa		4.19	□□□□□ -1.74
UBE2Q1-204	ENST00000476612	MYEOV	Q96EZ4	313 aa		4.19	□□□□□ -1.74
UBE2Q1-204	ENST00000476612	CCDC34	Q96HJ3	373 aa		4.19	□□□□□ -1.74
UBE2Q1-204	ENST00000476612	SLITRK1	Q96PX8	696 aa		4.19	□□□□□ -1.74
UBE2Q1-204	ENST00000476612	ULBP1	Q9BZM6	244 aa		4.19	□□□□□ -1.74
UBE2Q1-204	ENST00000476612	IMPG2	Q9BZV3	1241 aa		4.19	□□□□□ -1.74
UBE2Q1-204	ENST00000476612	INTS2	Q9H0H0	1204 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
UBE2Q1-204	ENST00000476612	IRF2BPL	Q9H1B7	796 aa		4.19	□□□□□ -1.74
UBE2Q1-204	ENST00000476612	HSD3B7	Q9H2F3	369 aa		4.19	□□□□□ -1.74
UBE2Q1-204	ENST00000476612	FAM124B	Q9H5Z6	455 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
UBE2Q1-204	ENST00000476612	CD248	Q9HCU0	757 aa		4.19	□□□□□ -1.74
UBE2Q1-204	ENST00000476612	PNPLA8	Q9NP80	782 aa		4.19	□□□□□ -1.74
UBE2Q1-204	ENST00000476612	UBE2T	Q9NPD8	197 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
UBE2Q1-204	ENST00000476612	ZDHHC4	Q9NPG8	344 aa		4.19	□□□□□ -1.74
UBE2Q1-204	ENST00000476612	SPHK2	Q9NRA0	654 aa		4.19	□□□□□ -1.74
UBE2Q1-204	ENST00000476612	TJP2	Q9UDY2	1190 aa		4.19	□□□□□ -1.74
UBE2Q1-204	ENST00000476612	HOOK1	Q9UJC3	728 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
UBE2Q1-204	ENST00000476612	TSPAN16	Q9UKR8	245 aa		4.19	□□□□□ -1.74
UBE2Q1-204	ENST00000476612	PCDHB4	Q9Y5E5	795 aa		4.19	□□□□□ -1.74
UBE2Q1-204	ENST00000476612	UTP18	Q9Y5J1	556 aa	Known RBP eCLIP	4.19	□□□□□ -1.74
UBE2Q1-204	ENST00000476612	OTOGL	Q3ZCN5	2332 aa		4.19	□□□□□ -1.74

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