RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475959.1

GTPBP1-208, Transcript of GTP binding protein 1, human

TSL 2

Gene GTPBP1, Length 475 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GTPBP1-208	ENST00000475959	CYP17A1	P05093	508 aa		11.71	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	PAEP	P09466	180 aa		11.71	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	HOXC13	P31276	330 aa		11.71	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	PLA2G5	P39877	138 aa		11.71	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	PLA2G4A	P47712	749 aa		11.71	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	PPP3CC	P48454	512 aa		11.71	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	RGS7	P49802	495 aa		11.71	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	KLK7	P49862	253 aa		11.71	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	TUB	P50607	506 aa		11.71	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	PLCB2	Q00722	1185 aa		11.71	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	TYRO3	Q06418	890 aa		11.71	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	BST2	Q10589	180 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	KCNMA1	Q12791	1236 aa		11.71	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	CETN1	Q12798	172 aa		11.71	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	RUNX3	Q13761	415 aa		11.71	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	GAS6	Q14393	721 aa		11.71	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	NCAPH	Q15003	741 aa		11.71	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	KRT31	Q15323	416 aa		11.71	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	ANGPT1	Q15389	498 aa		11.71	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	ARHGAP44	Q17R89	818 aa		11.71	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	EXOC3L4	Q17RC7	722 aa		11.71	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	ITPRIPL2	Q3MIP1	535 aa		11.71	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	VWA3B	Q502W6	1294 aa		11.71	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	TCP11X2	Q5H9J9	407 aa		11.71	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	HECTD3	Q5T447	861 aa		11.71	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	GBP6	Q6ZN66	633 aa		11.71	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	FAM114A1	Q8IWE2	563 aa		11.71	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	MAML2	Q8IZL2	1156 aa	Predicted RBP	11.71	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	ENOX1	Q8TC92	643 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	CLEC4C	Q8WTT0	213 aa		11.71	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	EZH1	Q92800	747 aa	Predicted RBP	11.71	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	CLDN23	Q96B33	292 aa		11.71	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	KCNH6	Q9H252	994 aa		11.71	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	NDST4	Q9H3R1	872 aa		11.71	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	FBXO44	Q9H4M3	255 aa		11.71	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	ECT2	Q9H8V3	914 aa		11.71	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	CYLD	Q9NQC7	956 aa		11.71	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	MTPAP	Q9NVV4	582 aa	Known RBP eCLIP	11.71	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	C2orf42	Q9NWW7	574 aa		11.71	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	THG1L	Q9NWX6	298 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	COMMD8	Q9NX08	183 aa		11.71	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	DUS2	Q9NX74	493 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	APEX2	Q9UBZ4	518 aa		11.71	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	FHOD1	Q9Y613	1164 aa		11.71	□□□□□ -0.53
GTPBP1-208	ENST00000475959	CACNA1H	O95180	2353 aa		11.71	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	GTPBP10	A4D1E9	387 aa	Known RBP	11.7	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	CHRNB1	P11230	501 aa		11.7	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	RARG	P13631	454 aa		11.7	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	KRT5	P13647	590 aa		11.7	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	PFKL	P17858	780 aa		11.7	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	GJA4	P35212	333 aa		11.7	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	IFNAR2	P48551	515 aa		11.7	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	TKTL1	P51854	596 aa		11.7	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	PTPN5	P54829	565 aa		11.7	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	MESP2	Q0VG99	397 aa		11.7	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	PDGFRL	Q15198	375 aa		11.7	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	FSTL4	Q6MZW2	842 aa		11.7	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	PMF1	Q6P1K2	205 aa		11.7	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	CC2D1A	Q6P1N0	951 aa	Predicted RBP	11.7	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	DENND1B	Q6P3S1	775 aa		11.7	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	PKN3	Q6P5Z2	889 aa		11.7	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	LCLAT1	Q6UWP7	414 aa		11.7	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	C12orf40	Q86WS4	652 aa		11.7	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	AOPEP	Q8N6M6	819 aa		11.7	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	SHC3	Q92529	594 aa		11.7	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	P2RY11	Q96G91	374 aa		11.7	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	OSBPL6	Q9BZF3	934 aa		11.7	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	C8orf33	Q9H7E9	229 aa	Predicted RBP	11.7	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	FBRSL1	Q9HCM7	1045 aa	Known RBP	11.7	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	TLR8	Q9NR97	1041 aa	Known RBP	11.7	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	FANCL	Q9NW38	375 aa		11.7	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	TJP2	Q9UDY2	1190 aa		11.7	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	CYTH4	Q9UIA0	394 aa		11.7	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	NAGPA	Q9UK23	515 aa		11.7	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	MAN2B1	O00754	1011 aa		11.69	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	EPHB6	O15197	1021 aa		11.69	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	SETSIP	P0DME0	302 aa		11.69	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	LCP1	P13796	627 aa		11.69	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	EEF1G	P26641	437 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	PDE6C	P51160	858 aa		11.69	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	MYL5	Q02045	173 aa		11.69	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	MTAP	Q13126	283 aa		11.69	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	CCIN	Q13939	588 aa		11.69	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	ANO6	Q4KMQ2	910 aa		11.69	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	SASS6	Q6UVJ0	657 aa		11.69	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	APTX	Q7Z2E3	356 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	RALGPS2	Q86X27	583 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	SFTPA1	Q8IWL2	248 aa		11.69	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	BBS7	Q8IWZ6	715 aa		11.69	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	ATP2A3	Q93084	1043 aa		11.69	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	FUCA2	Q9BTY2	467 aa		11.69	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	LSM14B	Q9BX40	385 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	KLF16	Q9BXK1	252 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	VPS16	Q9H269	839 aa		11.69	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	CHRD	Q9H2X0	955 aa		11.69	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	ANO10	Q9NW15	660 aa		11.69	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	HESX1	Q9UBX0	185 aa		11.69	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	RASAL2	Q9UJF2	1139 aa		11.69	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	DNAJC12	Q9UKB3	198 aa		11.69	□□□□□ -0.54
GTPBP1-208	ENST00000475959	ARIH1	Q9Y4X5	557 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54

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