RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475335.5

SIKE1-208, Transcript of suppressor of IKBKE 1, humanhuman

TSL 2

Gene SIKE1, Length 470 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIKE1-208ENST00000475335 MIIPQ5JXC2 388 aa22.15■■□□□ 1.14
SIKE1-208ENST00000475335 LCLAT1Q6UWP7 414 aa22.15■■□□□ 1.14
SIKE1-208ENST00000475335 BHLHA9Q7RTU4 235 aa22.15■■□□□ 1.14
SIKE1-208ENST00000475335 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
SIKE1-208ENST00000475335 TTC16Q8NEE8 873 aa22.15■■□□□ 1.14
SIKE1-208ENST00000475335 ATP2A3Q93084 1043 aa22.15■■□□□ 1.14
SIKE1-208ENST00000475335 WBP2Q969T9 261 aa22.15■■□□□ 1.14
SIKE1-208ENST00000475335 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
SIKE1-208ENST00000475335 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
SIKE1-208ENST00000475335 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP22.15■■□□□ 1.14
SIKE1-208ENST00000475335 KIAA1257Q9ULG3 409 aa22.15■■□□□ 1.14
SIKE1-208ENST00000475335 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
SIKE1-208ENST00000475335 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
SIKE1-208ENST00000475335 GREM1O60565 184 aa22.14■■□□□ 1.13
SIKE1-208ENST00000475335 TBX18O95935 607 aa22.14■■□□□ 1.13
SIKE1-208ENST00000475335 GJA4P35212 333 aa22.14■■□□□ 1.13
SIKE1-208ENST00000475335 NBL1P41271 181 aa22.14■■□□□ 1.13
SIKE1-208ENST00000475335 BST2Q10589 180 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
SIKE1-208ENST00000475335 MTAPQ13126 283 aa22.14■■□□□ 1.13
SIKE1-208ENST00000475335 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP22.14■■□□□ 1.13
SIKE1-208ENST00000475335 CPA6Q8N4T0 437 aa22.14■■□□□ 1.13
SIKE1-208ENST00000475335 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
SIKE1-208ENST00000475335 LMAN1LQ9HAT1 526 aa22.14■■□□□ 1.13
SIKE1-208ENST00000475335 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
SIKE1-208ENST00000475335 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
SIKE1-208ENST00000475335 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP22.14■■□□□ 1.13
SIKE1-208ENST00000475335 MYH10P35580 1976 aa22.13■■□□□ 1.13
SIKE1-208ENST00000475335 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
SIKE1-208ENST00000475335 MBD3O95983 291 aa22.13■■□□□ 1.13
SIKE1-208ENST00000475335 SLC9A1P19634 815 aa22.13■■□□□ 1.13
SIKE1-208ENST00000475335 BRD2P25440 801 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
SIKE1-208ENST00000475335 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
SIKE1-208ENST00000475335 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
SIKE1-208ENST00000475335 PLA2G4AP47712 749 aa22.13■■□□□ 1.13
SIKE1-208ENST00000475335 MAN2A1Q16706 1144 aa22.13■■□□□ 1.13
SIKE1-208ENST00000475335 TMEM196Q5HYL7 178 aa22.13■■□□□ 1.13
SIKE1-208ENST00000475335 FSTL4Q6MZW2 842 aa22.13■■□□□ 1.13
SIKE1-208ENST00000475335 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa22.13■■□□□ 1.13
SIKE1-208ENST00000475335 GJB7Q6PEY0 223 aa22.13■■□□□ 1.13
SIKE1-208ENST00000475335 MAMSTRQ6ZN01 415 aa22.13■■□□□ 1.13
SIKE1-208ENST00000475335 Q6ZS52 159 aa22.13■■□□□ 1.13
SIKE1-208ENST00000475335 IER2Q9BTL4 223 aa22.13■■□□□ 1.13
SIKE1-208ENST00000475335 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
SIKE1-208ENST00000475335 SIX2Q9NPC8 291 aa22.13■■□□□ 1.13
SIKE1-208ENST00000475335 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
SIKE1-208ENST00000475335 PROB1E7EW31 1015 aa22.12■■□□□ 1.13
SIKE1-208ENST00000475335 GABBR2O75899 941 aa22.12■■□□□ 1.13
SIKE1-208ENST00000475335 CYP17A1P05093 508 aa22.12■■□□□ 1.13
SIKE1-208ENST00000475335 SP9P0CG40 484 aa22.12■■□□□ 1.13
SIKE1-208ENST00000475335 SETSIPP0DME0 302 aa22.12■■□□□ 1.13
SIKE1-208ENST00000475335 TDGF1P13385 188 aa22.12■■□□□ 1.13
SIKE1-208ENST00000475335 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
SIKE1-208ENST00000475335 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa22.12■■□□□ 1.13
SIKE1-208ENST00000475335 PM20D1Q6GTS8 502 aa22.12■■□□□ 1.13
SIKE1-208ENST00000475335 KLHDC10Q6PID8 442 aa22.12■■□□□ 1.13
SIKE1-208ENST00000475335 GBP6Q6ZN66 633 aa22.12■■□□□ 1.13
SIKE1-208ENST00000475335 FAM114A1Q8IWE2 563 aa22.12■■□□□ 1.13
SIKE1-208ENST00000475335 ZNF276Q8N554 614 aa22.12■■□□□ 1.13
SIKE1-208ENST00000475335 UBA3Q8TBC4 463 aa22.12■■□□□ 1.13
SIKE1-208ENST00000475335 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
SIKE1-208ENST00000475335 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
SIKE1-208ENST00000475335 CLIC5Q9NZA1 410 aa22.12■■□□□ 1.13
SIKE1-208ENST00000475335 HESX1Q9UBX0 185 aa22.12■■□□□ 1.13
SIKE1-208ENST00000475335 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
SIKE1-208ENST00000475335 E2F8A0AVK6 867 aa22.11■■□□□ 1.13
SIKE1-208ENST00000475335 RARGP13631 454 aa22.11■■□□□ 1.13
SIKE1-208ENST00000475335 PON1P27169 355 aa22.11■■□□□ 1.13
SIKE1-208ENST00000475335 LRRC32Q14392 662 aa22.11■■□□□ 1.13
SIKE1-208ENST00000475335 CNGA2Q16280 664 aa22.11■■□□□ 1.13
SIKE1-208ENST00000475335 EXOC3L4Q17RC7 722 aa22.11■■□□□ 1.13
SIKE1-208ENST00000475335 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
SIKE1-208ENST00000475335 CREBRFQ8IUR6 639 aa22.11■■□□□ 1.13
SIKE1-208ENST00000475335 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
SIKE1-208ENST00000475335 KCTD13Q8WZ19 329 aa22.11■■□□□ 1.13
SIKE1-208ENST00000475335 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
SIKE1-208ENST00000475335 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa22.11■■□□□ 1.13
SIKE1-208ENST00000475335 APEX2Q9UBZ4 518 aa22.11■■□□□ 1.13
SIKE1-208ENST00000475335 NAGPAQ9UK23 515 aa22.11■■□□□ 1.13
SIKE1-208ENST00000475335 FBXO4Q9UKT5 387 aa22.11■■□□□ 1.13
SIKE1-208ENST00000475335 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa22.11■■□□□ 1.13
SIKE1-208ENST00000475335 BECN2A8MW95 431 aa22.1■■□□□ 1.13
SIKE1-208ENST00000475335 MDM4O15151 490 aa22.1■■□□□ 1.13
SIKE1-208ENST00000475335 NFATC1O95644 943 aa22.1■■□□□ 1.13
SIKE1-208ENST00000475335 PSEN1P49768 467 aa22.1■■□□□ 1.13
SIKE1-208ENST00000475335 TKTL1P51854 596 aa22.1■■□□□ 1.13
SIKE1-208ENST00000475335 SLC8A3P57103 927 aa22.1■■□□□ 1.13
SIKE1-208ENST00000475335 VWA3BQ502W6 1294 aa22.1■■□□□ 1.13
SIKE1-208ENST00000475335 DGKKQ5KSL6 1271 aa22.1■■□□□ 1.13
SIKE1-208ENST00000475335 CCDC183Q5T5S1 534 aa22.1■■□□□ 1.13
SIKE1-208ENST00000475335 CDKAL1Q5VV42 579 aa22.1■■□□□ 1.13
SIKE1-208ENST00000475335 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa22.1■■□□□ 1.13
SIKE1-208ENST00000475335 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa22.1■■□□□ 1.13
SIKE1-208ENST00000475335 SLC35F5Q8WV83 523 aa22.1■■□□□ 1.13
SIKE1-208ENST00000475335 NELL1Q92832 810 aa22.1■■□□□ 1.13
SIKE1-208ENST00000475335 ULBP1Q9BZM6 244 aa22.1■■□□□ 1.13
SIKE1-208ENST00000475335 NDST4Q9H3R1 872 aa22.1■■□□□ 1.13
SIKE1-208ENST00000475335 NUDT5Q9UKK9 219 aa22.1■■□□□ 1.13
SIKE1-208ENST00000475335 KCNJ18B7U540 433 aa22.09■■□□□ 1.13
SIKE1-208ENST00000475335 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
SIKE1-208ENST00000475335 LAMTOR5O43504 91 aa22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.3 ms