RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470095.5

HPS1-209, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene HPS1, Length 801 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-209ENST00000470095 GIPC2Q8TF65 315 aa14.91□□□□□ -0.02
HPS1-209ENST00000470095 GDPD5Q8WTR4 605 aa14.91□□□□□ -0.02
HPS1-209ENST00000470095 RXFP2Q8WXD0 754 aa14.91□□□□□ -0.02
HPS1-209ENST00000470095 ARNTL2Q8WYA1 636 aa14.91□□□□□ -0.02
HPS1-209ENST00000470095 CD101Q93033 1021 aa14.91□□□□□ -0.02
HPS1-209ENST00000470095 FAM149B1Q96BN6 582 aa14.91□□□□□ -0.02
HPS1-209ENST00000470095 TIFAQ96CG3 184 aa14.91□□□□□ -0.02
HPS1-209ENST00000470095 TTLL2Q9BWV7 592 aa14.91□□□□□ -0.02
HPS1-209ENST00000470095 LMAN2LQ9H0V9 348 aa14.91□□□□□ -0.02
HPS1-209ENST00000470095 SLC28A3Q9HAS3 691 aa14.91□□□□□ -0.02
HPS1-209ENST00000470095 LCMT1Q9UIC8 334 aa14.91□□□□□ -0.02
HPS1-209ENST00000470095 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
HPS1-209ENST00000470095 SCML2Q9UQR0 700 aa14.91□□□□□ -0.02
HPS1-209ENST00000470095 JRKLQ9Y4A0 524 aa14.91□□□□□ -0.02
HPS1-209ENST00000470095 CTAGE9A4FU28 777 aa14.9□□□□□ -0.02
HPS1-209ENST00000470095 ENC1O14682 589 aa14.9□□□□□ -0.02
HPS1-209ENST00000470095 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
HPS1-209ENST00000470095 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
HPS1-209ENST00000470095 LTFP02788 710 aa14.9□□□□□ -0.02
HPS1-209ENST00000470095 SPATA31D3P0C874 917 aa14.9□□□□□ -0.02
HPS1-209ENST00000470095 PDGFRAP16234 1089 aa14.9□□□□□ -0.02
HPS1-209ENST00000470095 KLRC2P26717 231 aa14.9□□□□□ -0.02
HPS1-209ENST00000470095 SLC1A1P43005 524 aa14.9□□□□□ -0.02
HPS1-209ENST00000470095 PGFP49763 221 aa14.9□□□□□ -0.02
HPS1-209ENST00000470095 CLCN4P51793 760 aa14.9□□□□□ -0.02
HPS1-209ENST00000470095 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
HPS1-209ENST00000470095 AMPD2Q01433 879 aa14.9□□□□□ -0.02
HPS1-209ENST00000470095 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
HPS1-209ENST00000470095 CCDC14Q49A88 953 aa14.9□□□□□ -0.02
HPS1-209ENST00000470095 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
HPS1-209ENST00000470095 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa14.9□□□□□ -0.02
HPS1-209ENST00000470095 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa14.9□□□□□ -0.02
HPS1-209ENST00000470095 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa14.9□□□□□ -0.02
HPS1-209ENST00000470095 DEFB106AQ8N104 65 aa14.9□□□□□ -0.02
HPS1-209ENST00000470095 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa14.9□□□□□ -0.02
HPS1-209ENST00000470095 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa14.9□□□□□ -0.02
HPS1-209ENST00000470095 ZNF592Q92610 1267 aa14.9□□□□□ -0.02
HPS1-209ENST00000470095 CNPY3Q9BT09 278 aa14.9□□□□□ -0.02
HPS1-209ENST00000470095 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
HPS1-209ENST00000470095 ADAM33Q9BZ11 813 aa14.9□□□□□ -0.02
HPS1-209ENST00000470095 FBXO44Q9H4M3 255 aa14.9□□□□□ -0.02
HPS1-209ENST00000470095 COMMD8Q9NX08 183 aa14.9□□□□□ -0.02
HPS1-209ENST00000470095 AMFRQ9UKV5 643 aa14.9□□□□□ -0.02
HPS1-209ENST00000470095 PRRG1O14668 218 aa14.89□□□□□ -0.03
HPS1-209ENST00000470095 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
HPS1-209ENST00000470095 LPXNO60711 386 aa14.89□□□□□ -0.03
HPS1-209ENST00000470095 GLUD1P00367 558 aa14.89□□□□□ -0.03
HPS1-209ENST00000470095 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
HPS1-209ENST00000470095 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
HPS1-209ENST00000470095 YWHAQP27348 245 aa14.89□□□□□ -0.03
HPS1-209ENST00000470095 ELF1P32519 619 aa14.89□□□□□ -0.03
HPS1-209ENST00000470095 MATKP42679 507 aa14.89□□□□□ -0.03
HPS1-209ENST00000470095 PTPN9P43378 593 aa14.89□□□□□ -0.03
HPS1-209ENST00000470095 MARCKSL1P49006 195 aa14.89□□□□□ -0.03
HPS1-209ENST00000470095 TAS2R40P59535 323 aa14.89□□□□□ -0.03
HPS1-209ENST00000470095 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
HPS1-209ENST00000470095 TWF1Q12792 350 aa14.89□□□□□ -0.03
HPS1-209ENST00000470095 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
HPS1-209ENST00000470095 SYPL2Q5VXT5 272 aa14.89□□□□□ -0.03
HPS1-209ENST00000470095 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
HPS1-209ENST00000470095 BEND5Q7L4P6 421 aa14.89□□□□□ -0.03
HPS1-209ENST00000470095 KREMEN2Q8NCW0 462 aa14.89□□□□□ -0.03
HPS1-209ENST00000470095 KIF18AQ8NI77 898 aa14.89□□□□□ -0.03
HPS1-209ENST00000470095 SLC7A14Q8TBB6 771 aa14.89□□□□□ -0.03
HPS1-209ENST00000470095 SLC22A17Q8WUG5 538 aa14.89□□□□□ -0.03
HPS1-209ENST00000470095 FBXO32Q969P5 355 aa14.89□□□□□ -0.03
HPS1-209ENST00000470095 HES6Q96HZ4 224 aa14.89□□□□□ -0.03
HPS1-209ENST00000470095 CFAP57Q96MR6 1250 aa14.89□□□□□ -0.03
HPS1-209ENST00000470095 NMUR1Q9HB89 426 aa14.89□□□□□ -0.03
HPS1-209ENST00000470095 POPDC2Q9HBU9 364 aa14.89□□□□□ -0.03
HPS1-209ENST00000470095 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP14.89□□□□□ -0.03
HPS1-209ENST00000470095 GMIPQ9P107 970 aa14.89□□□□□ -0.03
HPS1-209ENST00000470095 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa14.89□□□□□ -0.03
HPS1-209ENST00000470095 A0A1W2PQH9 124 aa14.88□□□□□ -0.03
HPS1-209ENST00000470095 SPOPO43791 374 aa14.88□□□□□ -0.03
HPS1-209ENST00000470095 LRCH4O75427 683 aa14.88□□□□□ -0.03
HPS1-209ENST00000470095 C1RP00736 705 aa14.88□□□□□ -0.03
HPS1-209ENST00000470095 TCF4P15884 667 aa14.88□□□□□ -0.03
HPS1-209ENST00000470095 CTNNA2P26232 953 aa14.88□□□□□ -0.03
HPS1-209ENST00000470095 SDC4P31431 198 aa14.88□□□□□ -0.03
HPS1-209ENST00000470095 NOS2P35228 1153 aa14.88□□□□□ -0.03
HPS1-209ENST00000470095 ALDH1A3P47895 512 aa14.88□□□□□ -0.03
HPS1-209ENST00000470095 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP14.88□□□□□ -0.03
HPS1-209ENST00000470095 TAF10Q12962 218 aa14.88□□□□□ -0.03
HPS1-209ENST00000470095 RAB6CQ53S08 254 aa14.88□□□□□ -0.03
HPS1-209ENST00000470095 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa14.88□□□□□ -0.03
HPS1-209ENST00000470095 BSPRYQ5W0U4 402 aa14.88□□□□□ -0.03
HPS1-209ENST00000470095 BNIPLQ7Z465 357 aa14.88□□□□□ -0.03
HPS1-209ENST00000470095 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa14.88□□□□□ -0.03
HPS1-209ENST00000470095 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
HPS1-209ENST00000470095 KRT35Q92764 455 aa14.88□□□□□ -0.03
HPS1-209ENST00000470095 NT5C3BQ969T7 300 aa14.88□□□□□ -0.03
HPS1-209ENST00000470095 NPY6RQ99463 290 aa14.88□□□□□ -0.03
HPS1-209ENST00000470095 RAB6CQ9H0N0 254 aa14.88□□□□□ -0.03
HPS1-209ENST00000470095 OSER1Q9NX31 292 aa14.88□□□□□ -0.03
HPS1-209ENST00000470095 USTQ9Y2C2 406 aa14.88□□□□□ -0.03
HPS1-209ENST00000470095 OBSL1O75147 1896 aa14.87□□□□□ -0.03
HPS1-209ENST00000470095 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
HPS1-209ENST00000470095 RFXAPO00287 272 aa14.87□□□□□ -0.03
HPS1-209ENST00000470095 C8AP07357 584 aa14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.6 ms