RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465576.1

CLRN1-AS1-201, CLRN1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CLRN1-AS1, Length 2,045 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 MAGEA11P43364 429 aa6.72□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 DAOAP59103 153 aa6.72□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 TAS2R40P59535 323 aa6.72□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 DCAF6Q58WW2 860 aa6.72□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa6.72□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 CCDC181Q5TID7 509 aa6.72□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 HFE2Q6ZVN8 426 aa6.72□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 NUP93Q8N1F7 819 aa6.72□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 ZNF461Q8TAF7 563 aa6.72□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa6.72□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 FNIP1Q8TF40 1166 aa6.72□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 ALG3Q92685 438 aa6.72□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 GOLGA1Q92805 767 aa6.72□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 CD101Q93033 1021 aa6.72□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 MS4A14Q96JA4 679 aa6.72□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 TCF25Q9BQ70 676 aa6.72□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 CNPY3Q9BT09 278 aa6.72□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 ZBP1Q9H171 429 aa6.72□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 CYP4F11Q9HBI6 524 aa6.72□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 ASNSD1Q9NWL6 643 aa6.72□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 STK39Q9UEW8 545 aa6.72□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 LCMT1Q9UIC8 334 aa6.72□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP6.72□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 MYO7AQ13402 2215 aa6.72□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa6.72□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa6.71□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 CCDC66A2RUB6 948 aa6.71□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 H0YGN5 161 aa6.71□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 PRRG1O14668 218 aa6.71□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 TNFRSF10BO14763 440 aa6.71□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 TEX28O15482 410 aa6.71□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 CEP104O60308 925 aa6.71□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 LRCH4O75427 683 aa6.71□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 LTFP02788 710 aa6.71□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 CNPP09543 421 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 SPATA31D3P0C874 917 aa6.71□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 NCAM1P13591 858 aa6.71□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 ATF2P15336 505 aa6.71□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 PRLRP16471 622 aa6.71□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 ELF1P32519 619 aa6.71□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 SCNN1AP37088 669 aa6.71□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 PBX2P40425 430 aa6.71□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 MATKP42679 507 aa6.71□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 ERVFC1P60507 584 aa6.71□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 TUBB2AQ13885 445 aa6.71□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 LLGL1Q15334 1064 aa6.71□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 SMTNL2Q2TAL5 461 aa6.71□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 CCDC14Q49A88 953 aa6.71□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 ODF2Q5BJF6 829 aa6.71□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 PLPP4Q5VZY2 271 aa6.71□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 SCYL2Q6P3W7 929 aa6.71□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa6.71□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa6.71□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 RHOT1Q8IXI2 618 aa6.71□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 DEFB106AQ8N104 65 aa6.71□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 NIPA2Q8N8Q9 360 aa6.71□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 MNS1Q8NEH6 495 aa6.71□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 GIPC2Q8TF65 315 aa6.71□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 FAM172AQ8WUF8 416 aa6.71□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 EDEM1Q92611 657 aa6.71□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 C8orf48Q96LL4 319 aa6.71□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 TUBB2BQ9BVA1 445 aa6.71□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 CARD6Q9BX69 1037 aa6.71□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 ZWILCHQ9H900 591 aa6.71□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 L2HGDHQ9H9P8 463 aa6.71□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 CERS4Q9HA82 394 aa6.71□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 POPDC2Q9HBU9 364 aa6.71□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP6.71□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 KLHL11Q9NVR0 708 aa6.71□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP6.71□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa6.71□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 EHD2Q9NZN4 543 aa6.71□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 COX16Q9P0S2 106 aa6.71□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 PCSK1NQ9UHG2 260 aa6.71□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa6.71□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 RWDD3Q9Y3V2 267 aa6.71□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa6.71□□□□□ -1.33
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 GBF1Q92538 1859 aa6.71□□□□□ -1.34
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 DPYSL4O14531 572 aa6.71□□□□□ -1.34
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 DAB1O75553 588 aa6.71□□□□□ -1.34
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 ABLIM3O94929 683 aa6.71□□□□□ -1.34
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 SEC24AO95486 1093 aa6.71□□□□□ -1.34
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 GLI1P08151 1106 aa6.71□□□□□ -1.34
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 DNAJB1P25685 340 aa6.71□□□□□ -1.34
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 CTNNA2P26232 953 aa6.71□□□□□ -1.34
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 MIPP30301 263 aa6.71□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 74.8 ms