RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464833.1

CHRD-211, Transcript of chordin, humanhuman

TSL 5

Gene CHRD, Length 1,340 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRD-211ENST00000464833 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP29.03■■■□□ 2.24
CHRD-211ENST00000464833 PSEN1P49768 467 aa29.03■■■□□ 2.24
CHRD-211ENST00000464833 SLC7A9P82251 487 aa29.03■■■□□ 2.24
CHRD-211ENST00000464833 PDCLQ13371 301 aa29.03■■■□□ 2.24
CHRD-211ENST00000464833 TAF3Q5VWG9 929 aa29.03■■■□□ 2.24
CHRD-211ENST00000464833 ZNF677Q86XU0 584 aa29.03■■■□□ 2.24
CHRD-211ENST00000464833 MFSD6LQ8IWD5 586 aa29.03■■■□□ 2.24
CHRD-211ENST00000464833 SLC20A1Q8WUM9 679 aa29.03■■■□□ 2.24
CHRD-211ENST00000464833 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP29.03■■■□□ 2.24
CHRD-211ENST00000464833 NUP58Q9BVL2 599 aa29.03■■■□□ 2.24
CHRD-211ENST00000464833 KIF9Q9HAQ2 790 aa29.03■■■□□ 2.24
CHRD-211ENST00000464833 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP29.03■■■□□ 2.24
CHRD-211ENST00000464833 NAGPAQ9UK23 515 aa29.03■■■□□ 2.24
CHRD-211ENST00000464833 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa29.03■■■□□ 2.24
CHRD-211ENST00000464833 PIK3R2O00459 728 aa29.02■■■□□ 2.24
CHRD-211ENST00000464833 NARSO43776 548 aaKnown RBP29.02■■■□□ 2.24
CHRD-211ENST00000464833 MMEP08473 750 aa29.02■■■□□ 2.24
CHRD-211ENST00000464833 ACADSBP45954 432 aa29.02■■■□□ 2.24
CHRD-211ENST00000464833 DAOAP59103 153 aa29.02■■■□□ 2.24
CHRD-211ENST00000464833 CDR2Q01850 454 aa29.02■■■□□ 2.24
CHRD-211ENST00000464833 SARM1Q6SZW1 724 aa29.02■■■□□ 2.24
CHRD-211ENST00000464833 TMEM110Q86TL2 294 aa29.02■■■□□ 2.24
CHRD-211ENST00000464833 UBALD2Q8IYN6 164 aa29.02■■■□□ 2.24
CHRD-211ENST00000464833 ARHGAP18Q8N392 663 aa29.02■■■□□ 2.24
CHRD-211ENST00000464833 ZNF276Q8N554 614 aa29.02■■■□□ 2.24
CHRD-211ENST00000464833 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP29.02■■■□□ 2.24
CHRD-211ENST00000464833 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa29.02■■■□□ 2.24
CHRD-211ENST00000464833 ST7Q9NRC1 585 aa29.02■■■□□ 2.24
CHRD-211ENST00000464833 CLIC5Q9NZA1 410 aa29.02■■■□□ 2.24
CHRD-211ENST00000464833 ITIH6Q6UXX5 1313 aa29.02■■■□□ 2.24
CHRD-211ENST00000464833 LRRC53A6NM62 1247 aa29.01■■■□□ 2.23
CHRD-211ENST00000464833 PI4K2BG5E9Z4 385 aa29.01■■■□□ 2.23
CHRD-211ENST00000464833 DPYSL4O14531 572 aa29.01■■■□□ 2.23
CHRD-211ENST00000464833 TLR5O60602 858 aa29.01■■■□□ 2.23
CHRD-211ENST00000464833 SRFP11831 508 aa29.01■■■□□ 2.23
CHRD-211ENST00000464833 CHRNB2P17787 502 aa29.01■■■□□ 2.23
CHRD-211ENST00000464833 PSMC3P17980 439 aa29.01■■■□□ 2.23
CHRD-211ENST00000464833 ZXDAP98168 799 aa29.01■■■□□ 2.23
CHRD-211ENST00000464833 GRM2Q14416 872 aa29.01■■■□□ 2.23
CHRD-211ENST00000464833 RIN3Q8TB24 985 aa29.01■■■□□ 2.23
CHRD-211ENST00000464833 CPXM1Q96SM3 734 aa29.01■■■□□ 2.23
CHRD-211ENST00000464833 ANP32EQ9BTT0 268 aa29.01■■■□□ 2.23
CHRD-211ENST00000464833 CEP83Q9Y592 693 aa29.01■■■□□ 2.23
CHRD-211ENST00000464833 A0A1W2PQJ5 194 aa29■■■□□ 2.23
CHRD-211ENST00000464833 YJEFN3A6XGL0 299 aa29■■■□□ 2.23
CHRD-211ENST00000464833 E7ENQ6 273 aa29■■■□□ 2.23
CHRD-211ENST00000464833 FBXO21O94952 628 aa29■■■□□ 2.23
CHRD-211ENST00000464833 RARGP13631 454 aa29■■■□□ 2.23
CHRD-211ENST00000464833 ALADP13716 330 aa29■■■□□ 2.23
CHRD-211ENST00000464833 TCF3P15923 654 aa29■■■□□ 2.23
CHRD-211ENST00000464833 FERP16591 822 aa29■■■□□ 2.23
CHRD-211ENST00000464833 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP29■■■□□ 2.23
CHRD-211ENST00000464833 ZXDBP98169 803 aa29■■■□□ 2.23
CHRD-211ENST00000464833 FMO1Q01740 532 aa29■■■□□ 2.23
CHRD-211ENST00000464833 ARID5AQ03989 594 aa29■■■□□ 2.23
CHRD-211ENST00000464833 FCHO2Q0JRZ9 810 aa29■■■□□ 2.23
CHRD-211ENST00000464833 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa29■■■□□ 2.23
CHRD-211ENST00000464833 FMNL3Q8IVF7 1028 aa29■■■□□ 2.23
CHRD-211ENST00000464833 TMEM35BQ8NCS4 154 aa29■■■□□ 2.23
CHRD-211ENST00000464833 CLEC4CQ8WTT0 213 aa29■■■□□ 2.23
CHRD-211ENST00000464833 IRGQQ8WZA9 623 aa29■■■□□ 2.23
CHRD-211ENST00000464833 IQCDQ96DY2 449 aa29■■■□□ 2.23
CHRD-211ENST00000464833 PDCL3Q9H2J4 239 aa29■■■□□ 2.23
CHRD-211ENST00000464833 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa29■■■□□ 2.23
CHRD-211ENST00000464833 TECTAO75443 2155 aa28.99■■■□□ 2.23
CHRD-211ENST00000464833 E5RJQ4 531 aa28.99■■■□□ 2.23
CHRD-211ENST00000464833 AP5Z1O43299 807 aa28.99■■■□□ 2.23
CHRD-211ENST00000464833 LSM8O95777 96 aaKnown RBP28.99■■■□□ 2.23
CHRD-211ENST00000464833 USP4Q13107 963 aa28.99■■■□□ 2.23
CHRD-211ENST00000464833 ZNF77Q15935 545 aa28.99■■■□□ 2.23
CHRD-211ENST00000464833 KLHDC10Q6PID8 442 aa28.99■■■□□ 2.23
CHRD-211ENST00000464833 BPIFB1Q8TDL5 484 aa28.99■■■□□ 2.23
CHRD-211ENST00000464833 EDAQ92838 391 aa28.99■■■□□ 2.23
CHRD-211ENST00000464833 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa28.99■■■□□ 2.23
CHRD-211ENST00000464833 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP28.99■■■□□ 2.23
CHRD-211ENST00000464833 NOX5Q96PH1 765 aa28.99■■■□□ 2.23
CHRD-211ENST00000464833 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP28.99■■■□□ 2.23
CHRD-211ENST00000464833 MIS12Q9H081 205 aa28.99■■■□□ 2.23
CHRD-211ENST00000464833 TJP2Q9UDY2 1190 aa28.99■■■□□ 2.23
CHRD-211ENST00000464833 CPQQ9Y646 472 aa28.99■■■□□ 2.23
CHRD-211ENST00000464833 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP28.98■■■□□ 2.23
CHRD-211ENST00000464833 TBX18O95935 607 aa28.98■■■□□ 2.23
CHRD-211ENST00000464833 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP28.98■■■□□ 2.23
CHRD-211ENST00000464833 RALAP11233 206 aa28.98■■■□□ 2.23
CHRD-211ENST00000464833 GPC5P78333 572 aa28.98■■■□□ 2.23
CHRD-211ENST00000464833 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP28.98■■■□□ 2.23
CHRD-211ENST00000464833 SCUBE3Q8IX30 993 aa28.98■■■□□ 2.23
CHRD-211ENST00000464833 SH3RF2Q8TEC5 729 aa28.98■■■□□ 2.23
CHRD-211ENST00000464833 AIPL1Q9NZN9 384 aa28.98■■■□□ 2.23
CHRD-211ENST00000464833 DLL1O00548 723 aa28.97■■■□□ 2.23
CHRD-211ENST00000464833 CCDC172P0C7W6 258 aa28.97■■■□□ 2.23
CHRD-211ENST00000464833 NOMO3P69849 1222 aa28.97■■■□□ 2.23
CHRD-211ENST00000464833 PTPN20Q4JDL3 420 aa28.97■■■□□ 2.23
CHRD-211ENST00000464833 BSPRYQ5W0U4 402 aa28.97■■■□□ 2.23
CHRD-211ENST00000464833 HFE2Q6ZVN8 426 aa28.97■■■□□ 2.23
CHRD-211ENST00000464833 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP28.97■■■□□ 2.23
CHRD-211ENST00000464833 SMPD4Q9NXE4 827 aa28.97■■■□□ 2.23
CHRD-211ENST00000464833 NUDT5Q9UKK9 219 aa28.97■■■□□ 2.23
CHRD-211ENST00000464833 CAPN11Q9UMQ6 739 aa28.97■■■□□ 2.23
CHRD-211ENST00000464833 COL4A2P08572 1712 aa28.97■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23 ms