RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461017.1

RABGEF1-206, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene RABGEF1, Length 711 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-206ENST00000461017 PFKPQ01813 784 aa7.4□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 PDE4CQ08493 712 aa7.4□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 MESP2Q0VG99 397 aa7.4□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 RUNX3Q13761 415 aa7.4□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 MTF1Q14872 753 aa7.4□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 EML3Q32P44 896 aa7.4□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa7.4□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 RAB41Q5JT25 222 aa7.4□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 PKN3Q6P5Z2 889 aa7.4□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 TMEM270Q6UE05 265 aa7.4□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 PIGZQ86VD9 579 aa7.4□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 SFTPA1Q8IWL2 248 aa7.4□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 FAM3CQ92520 227 aa7.4□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 IRF7Q92985 503 aa7.4□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 E2F7Q96AV8 911 aa7.4□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 CLDN23Q96B33 292 aa7.4□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 NT5C1BQ96P26 610 aa7.4□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 GBP4Q96PP9 640 aa7.4□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 HSD3B7Q9H2F3 369 aa7.4□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 THAP9Q9H5L6 903 aa7.4□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 TSPAN16Q9UKR8 245 aa7.4□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa7.4□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 CNTN6Q9UQ52 1028 aa7.4□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 SCML2Q9UQR0 700 aa7.4□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa7.4□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa7.4□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 PIAS3Q9Y6X2 628 aa7.4□□□□□ -1.22
RABGEF1-206ENST00000461017 SDK1Q7Z5N4 2213 aa7.4□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 ABCA7Q8IZY2 2146 aa7.39□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 CEP192Q8TEP8 1941 aa7.39□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 ATP8B3O60423 1300 aa7.39□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 SOBPA7XYQ1 873 aa7.39□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa7.39□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 CKMP06732 381 aa7.39□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 VDRP11473 427 aa7.39□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 CTHP32929 405 aa7.39□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 RGS7P49802 495 aa7.39□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 NCAPHQ15003 741 aa7.39□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 PON2Q15165 354 aa7.39□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 ANGPT1Q15389 498 aa7.39□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 ARHGAP44Q17R89 818 aa7.39□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa7.39□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 PMF1Q6P1K2 205 aa7.39□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 TRIM65Q6PJ69 517 aa7.39□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF852Q6ZMS4 543 aa7.39□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 C12orf40Q86WS4 652 aa7.39□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 YAF2Q8IY57 180 aa7.39□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa7.39□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 ANKRD52Q8NB46 1076 aa7.39□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 CCDC150Q8NCX0 1101 aa7.39□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa7.39□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 CLEC4CQ8WTT0 213 aa7.39□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 OSCP1Q8WVF1 389 aa7.39□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 OVCA2Q8WZ82 227 aa7.39□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 SLITRK1Q96PX8 696 aa7.39□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa7.39□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 ULBP1Q9BZM6 244 aa7.39□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 ECT2Q9H8V3 914 aa7.39□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 LMAN1LQ9HAT1 526 aa7.39□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 COMMD8Q9NX08 183 aa7.39□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 TAB2Q9NYJ8 693 aa7.39□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 TJP2Q9UDY2 1190 aa7.39□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 CYTH4Q9UIA0 394 aa7.39□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa7.39□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 FRYLO94915 3013 aa7.39□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 SPAG17Q6Q759 2223 aa7.39□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 KCNJ18B7U540 433 aa7.38□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 TLR5O60602 858 aa7.38□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 EGFP01133 1207 aa7.38□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 IRF1P10914 325 aa7.38□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 TDGF1P13385 188 aa7.38□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 RARGP13631 454 aa7.38□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 CD19P15391 556 aa7.38□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 GJA4P35212 333 aa7.38□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 PLA2G5P39877 138 aa7.38□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 OPRD1P41143 372 aa7.38□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC6A11P48066 632 aa7.38□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 PPP3CCP48454 512 aa7.38□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 GALK1P51570 392 aa7.38□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 GCNT1Q02742 428 aa7.38□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 DMWDQ09019 674 aa7.38□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 KCNJ12Q14500 433 aa7.38□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 CNGA2Q16280 664 aa7.38□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 MAN2A1Q16706 1144 aa7.38□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 EXOC3L4Q17RC7 722 aa7.38□□□□□ -1.23
RABGEF1-206ENST00000461017 VWA3BQ502W6 1294 aa7.38□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.6 ms