RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440825.6

FAAP20-210, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 3

Gene FAAP20, Length 855 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-210ENST00000440825 SEMA4AQ9H3S1 761 aa29.23■■■□□ 2.27
FAAP20-210ENST00000440825 C2orf42Q9NWW7 574 aa29.23■■■□□ 2.27
FAAP20-210ENST00000440825 OSER1Q9NX31 292 aa29.23■■■□□ 2.27
FAAP20-210ENST00000440825 NAGPAQ9UK23 515 aa29.23■■■□□ 2.27
FAAP20-210ENST00000440825 NUDT5Q9UKK9 219 aa29.23■■■□□ 2.27
FAAP20-210ENST00000440825 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa29.23■■■□□ 2.27
FAAP20-210ENST00000440825 CYP17A1P05093 508 aa29.22■■■□□ 2.27
FAAP20-210ENST00000440825 KIF11P52732 1056 aa29.22■■■□□ 2.27
FAAP20-210ENST00000440825 TMEM270Q6UE05 265 aa29.22■■■□□ 2.27
FAAP20-210ENST00000440825 RRAGAQ7L523 313 aa29.22■■■□□ 2.27
FAAP20-210ENST00000440825 KAT5Q92993 513 aa29.22■■■□□ 2.27
FAAP20-210ENST00000440825 HINFPQ9BQA5 517 aa29.22■■■□□ 2.27
FAAP20-210ENST00000440825 NMUR1Q9HB89 426 aa29.22■■■□□ 2.27
FAAP20-210ENST00000440825 HESX1Q9UBX0 185 aa29.22■■■□□ 2.27
FAAP20-210ENST00000440825 TSPAN16Q9UKR8 245 aa29.22■■■□□ 2.27
FAAP20-210ENST00000440825 P4HA2O15460 535 aa29.21■■■□□ 2.27
FAAP20-210ENST00000440825 RNF40O75150 1001 aa29.21■■■□□ 2.27
FAAP20-210ENST00000440825 RARGP13631 454 aa29.21■■■□□ 2.27
FAAP20-210ENST00000440825 DRD1P21728 446 aa29.21■■■□□ 2.27
FAAP20-210ENST00000440825 NRLP54845 237 aa29.21■■■□□ 2.27
FAAP20-210ENST00000440825 DHCR24Q15392 516 aa29.21■■■□□ 2.27
FAAP20-210ENST00000440825 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP29.21■■■□□ 2.27
FAAP20-210ENST00000440825 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP29.21■■■□□ 2.27
FAAP20-210ENST00000440825 PKN3Q6P5Z2 889 aa29.21■■■□□ 2.27
FAAP20-210ENST00000440825 MAMSTRQ6ZN01 415 aa29.21■■■□□ 2.27
FAAP20-210ENST00000440825 PIGZQ86VD9 579 aa29.21■■■□□ 2.27
FAAP20-210ENST00000440825 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa29.21■■■□□ 2.27
FAAP20-210ENST00000440825 ANKRD52Q8NB46 1076 aa29.21■■■□□ 2.27
FAAP20-210ENST00000440825 NUP62CLQ9H1M0 184 aa29.21■■■□□ 2.27
FAAP20-210ENST00000440825 E2F8A0AVK6 867 aa29.2■■■□□ 2.26
FAAP20-210ENST00000440825 MDM4O15151 490 aa29.2■■■□□ 2.26
FAAP20-210ENST00000440825 PMM2O15305 246 aa29.2■■■□□ 2.26
FAAP20-210ENST00000440825 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP29.2■■■□□ 2.26
FAAP20-210ENST00000440825 C10orf120Q5SQS8 335 aa29.2■■■□□ 2.26
FAAP20-210ENST00000440825 TTC30AQ86WT1 665 aa29.2■■■□□ 2.26
FAAP20-210ENST00000440825 ARHGEF19Q8IW93 802 aa29.2■■■□□ 2.26
FAAP20-210ENST00000440825 EHBP1Q8NDI1 1231 aa29.2■■■□□ 2.26
FAAP20-210ENST00000440825 UBA3Q8TBC4 463 aa29.2■■■□□ 2.26
FAAP20-210ENST00000440825 WBP2Q969T9 261 aa29.2■■■□□ 2.26
FAAP20-210ENST00000440825 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP29.2■■■□□ 2.26
FAAP20-210ENST00000440825 TBC1D14Q9P2M4 693 aa29.2■■■□□ 2.26
FAAP20-210ENST00000440825 VDRP11473 427 aa29.19■■■□□ 2.26
FAAP20-210ENST00000440825 TDGF1P13385 188 aa29.19■■■□□ 2.26
FAAP20-210ENST00000440825 MARSP56192 900 aaKnown RBP29.19■■■□□ 2.26
FAAP20-210ENST00000440825 BBS7Q8IWZ6 715 aa29.19■■■□□ 2.26
FAAP20-210ENST00000440825 UBR7Q8N806 425 aa29.19■■■□□ 2.26
FAAP20-210ENST00000440825 MLKLQ8NB16 471 aa29.19■■■□□ 2.26
FAAP20-210ENST00000440825 ZBTB44Q8NCP5 570 aa29.19■■■□□ 2.26
FAAP20-210ENST00000440825 LMO3Q8TAP4 145 aa29.19■■■□□ 2.26
FAAP20-210ENST00000440825 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP29.19■■■□□ 2.26
FAAP20-210ENST00000440825 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP29.19■■■□□ 2.26
FAAP20-210ENST00000440825 CYLDQ9NQC7 956 aa29.19■■■□□ 2.26
FAAP20-210ENST00000440825 FANCMQ8IYD8 2048 aa29.19■■■□□ 2.26
FAAP20-210ENST00000440825 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa29.18■■■□□ 2.26
FAAP20-210ENST00000440825 TULP2O00295 520 aa29.18■■■□□ 2.26
FAAP20-210ENST00000440825 ADH1CP00326 375 aa29.18■■■□□ 2.26
FAAP20-210ENST00000440825 FNTBP49356 437 aa29.18■■■□□ 2.26
FAAP20-210ENST00000440825 BCAT1P54687 386 aa29.18■■■□□ 2.26
FAAP20-210ENST00000440825 PDE4CQ08493 712 aa29.18■■■□□ 2.26
FAAP20-210ENST00000440825 GOLGA8FQ08AF8 430 aa29.18■■■□□ 2.26
FAAP20-210ENST00000440825 DMWDQ09019 674 aa29.18■■■□□ 2.26
FAAP20-210ENST00000440825 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa29.18■■■□□ 2.26
FAAP20-210ENST00000440825 CCDC186Q7Z3E2 898 aa29.18■■■□□ 2.26
FAAP20-210ENST00000440825 SCD5Q86SK9 330 aa29.18■■■□□ 2.26
FAAP20-210ENST00000440825 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP29.18■■■□□ 2.26
FAAP20-210ENST00000440825 ATG2BQ96BY7 2078 aa29.17■■■□□ 2.26
FAAP20-210ENST00000440825 RALAP11233 206 aa29.17■■■□□ 2.26
FAAP20-210ENST00000440825 ADH5P11766 374 aa29.17■■■□□ 2.26
FAAP20-210ENST00000440825 HOXC13P31276 330 aa29.17■■■□□ 2.26
FAAP20-210ENST00000440825 OPRD1P41143 372 aa29.17■■■□□ 2.26
FAAP20-210ENST00000440825 TKTL1P51854 596 aa29.17■■■□□ 2.26
FAAP20-210ENST00000440825 SEC13P55735 322 aa29.17■■■□□ 2.26
FAAP20-210ENST00000440825 LY6G5CQ5SRR4 150 aa29.17■■■□□ 2.26
FAAP20-210ENST00000440825 RHBDF2Q6PJF5 856 aa29.17■■■□□ 2.26
FAAP20-210ENST00000440825 KIAA1958Q8N8K9 716 aa29.17■■■□□ 2.26
FAAP20-210ENST00000440825 NELL1Q92832 810 aa29.17■■■□□ 2.26
FAAP20-210ENST00000440825 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP29.17■■■□□ 2.26
FAAP20-210ENST00000440825 DNMT3LQ9UJW3 386 aa29.17■■■□□ 2.26
FAAP20-210ENST00000440825 USP3Q9Y6I4 520 aa29.17■■■□□ 2.26
FAAP20-210ENST00000440825 ATG13O75143 517 aa29.16■■■□□ 2.26
FAAP20-210ENST00000440825 CALCAP01258 141 aa29.16■■■□□ 2.26
FAAP20-210ENST00000440825 PSEN1P49768 467 aa29.16■■■□□ 2.26
FAAP20-210ENST00000440825 BST2Q10589 180 aaKnown RBP29.16■■■□□ 2.26
FAAP20-210ENST00000440825 FBXO43Q4G163 708 aa29.16■■■□□ 2.26
FAAP20-210ENST00000440825 MIB1Q86YT6 1006 aa29.16■■■□□ 2.26
FAAP20-210ENST00000440825 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP29.16■■■□□ 2.26
FAAP20-210ENST00000440825 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa29.16■■■□□ 2.26
FAAP20-210ENST00000440825 MED15Q96RN5 788 aa29.16■■■□□ 2.26
FAAP20-210ENST00000440825 CRACR2AQ9BSW2 395 aa29.16■■■□□ 2.26
FAAP20-210ENST00000440825 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP29.16■■■□□ 2.26
FAAP20-210ENST00000440825 UBXN6Q9BZV1 441 aa29.16■■■□□ 2.26
FAAP20-210ENST00000440825 LRRC4Q9HBW1 653 aa29.16■■■□□ 2.26
FAAP20-210ENST00000440825 LMBRD1Q9NUN5 540 aa29.16■■■□□ 2.26
FAAP20-210ENST00000440825 RASAL2Q9UJF2 1139 aa29.16■■■□□ 2.26
FAAP20-210ENST00000440825 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP29.16■■■□□ 2.26
FAAP20-210ENST00000440825 KIAA1257Q9ULG3 409 aa29.16■■■□□ 2.26
FAAP20-210ENST00000440825 SLC8A2Q9UPR5 921 aa29.16■■■□□ 2.26
FAAP20-210ENST00000440825 K7ESF4 209 aa29.15■■■□□ 2.26
FAAP20-210ENST00000440825 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP29.15■■■□□ 2.26
FAAP20-210ENST00000440825 O00370 1275 aa29.15■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.1 ms