RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418331.6

PTPRJ-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRJ, Length 5,122 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF280DQ6N043 979 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRJ-201ENST00000418331 C3orf20Q8ND61 904 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRJ-201ENST00000418331 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
PTPRJ-201ENST00000418331 SLC12A8A0AV02 714 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRJ-201ENST00000418331 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
PTPRJ-201ENST00000418331 CCND1P24385 295 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRJ-201ENST00000418331 AVPR1AP37288 418 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRJ-201ENST00000418331 KCNK10P57789 538 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRJ-201ENST00000418331 SEPT8Q92599 483 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRJ-201ENST00000418331 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
PTPRJ-201ENST00000418331 SEMA4AQ9H3S1 761 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRJ-201ENST00000418331 FZD1Q9UP38 647 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRJ-201ENST00000418331 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRJ-201ENST00000418331 PJA2O43164 708 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRJ-201ENST00000418331 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
PTPRJ-201ENST00000418331 SUPT7LO94864 414 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRJ-201ENST00000418331 PYGMP11217 842 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRJ-201ENST00000418331 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
PTPRJ-201ENST00000418331 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
PTPRJ-201ENST00000418331 WNK4Q96J92 1243 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRJ-201ENST00000418331 TBCBQ99426 244 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRJ-201ENST00000418331 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
PTPRJ-201ENST00000418331 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRJ-201ENST00000418331 SLC24A2Q9UI40 661 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRJ-201ENST00000418331 TEKT2Q9UIF3 430 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRJ-201ENST00000418331 LACTBL1A8MY62 500 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRJ-201ENST00000418331 TRIP10Q15642 601 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRJ-201ENST00000418331 ERMARDQ5T6L9 678 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRJ-201ENST00000418331 UGT3A1Q6NUS8 523 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRJ-201ENST00000418331 VSIG10LQ86VR7 867 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRJ-201ENST00000418331 STARD7Q9NQZ5 370 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRJ-201ENST00000418331 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRJ-201ENST00000418331 TISP43B9A030 160 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRJ-201ENST00000418331 LAYNQ6UX15 382 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRJ-201ENST00000418331 SIK3Q9Y2K2 1263 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRJ-201ENST00000418331 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRJ-201ENST00000418331 PPP3CCP48454 512 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRJ-201ENST00000418331 CDH8P55286 799 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRJ-201ENST00000418331 OXCT1P55809 520 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRJ-201ENST00000418331 TTLL9Q3SXZ7 439 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRJ-201ENST00000418331 NT5DC3Q86UY8 548 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRJ-201ENST00000418331 GLIS3Q8NEA6 775 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRJ-201ENST00000418331 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
PTPRJ-201ENST00000418331 HEY2Q9UBP5 337 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRJ-201ENST00000418331 C5orf58C9J3I9 102 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRJ-201ENST00000418331 PIK3CDO00329 1044 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRJ-201ENST00000418331 CKMP06732 381 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRJ-201ENST00000418331 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
PTPRJ-201ENST00000418331 NLRP9Q7RTR0 991 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRJ-201ENST00000418331 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
PTPRJ-201ENST00000418331 CHST12Q9NRB3 414 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRJ-201ENST00000418331 CES2O00748 559 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRJ-201ENST00000418331 CASP5P51878 434 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRJ-201ENST00000418331 OVOS1Q6IE37 1185 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRJ-201ENST00000418331 PKN3Q6P5Z2 889 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRJ-201ENST00000418331 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
PTPRJ-201ENST00000418331 DACH2Q96NX9 599 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRJ-201ENST00000418331 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa22.11■■□□□ 1.13
PTPRJ-201ENST00000418331 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
PTPRJ-201ENST00000418331 POMCP01189 267 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRJ-201ENST00000418331 COPAP53621 1224 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRJ-201ENST00000418331 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
PTPRJ-201ENST00000418331 SHOC2Q9UQ13 582 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRJ-201ENST00000418331 NCAM2O15394 837 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRJ-201ENST00000418331 PAEPP09466 180 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRJ-201ENST00000418331 SOX11P35716 441 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRJ-201ENST00000418331 ERVK-9P63128 1117 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRJ-201ENST00000418331 MFSD10Q14728 455 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRJ-201ENST00000418331 TAF2Q6P1X5 1199 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRJ-201ENST00000418331 TLK2Q86UE8 772 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF410Q86VK4 478 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRJ-201ENST00000418331 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRJ-201ENST00000418331 CDCA5Q96FF9 252 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRJ-201ENST00000418331 IL1RL2Q9HB29 575 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRJ-201ENST00000418331 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
PTPRJ-201ENST00000418331 MICAL2O94851 1124 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRJ-201ENST00000418331 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
PTPRJ-201ENST00000418331 TMEM132BQ14DG7 1078 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRJ-201ENST00000418331 STRA8Q7Z7C7 330 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRJ-201ENST00000418331 PORCNQ9H237 461 aa22.1■■□□□ 1.13
PTPRJ-201ENST00000418331 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa22.09■■□□□ 1.13
PTPRJ-201ENST00000418331 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
PTPRJ-201ENST00000418331 CYP3A7P24462 503 aa22.09■■□□□ 1.13
PTPRJ-201ENST00000418331 TARSP26639 723 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
PTPRJ-201ENST00000418331 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
PTPRJ-201ENST00000418331 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa22.09■■□□□ 1.13
PTPRJ-201ENST00000418331 PGBD3Q8N328 593 aa22.09■■□□□ 1.13
PTPRJ-201ENST00000418331 FICDQ9BVA6 458 aa22.09■■□□□ 1.13
PTPRJ-201ENST00000418331 RAB27AP51159 221 aa22.09■■□□□ 1.13
PTPRJ-201ENST00000418331 ADIGQ0VDE8 80 aa22.09■■□□□ 1.13
PTPRJ-201ENST00000418331 NT5DC4Q86YG4 428 aa22.09■■□□□ 1.13
PTPRJ-201ENST00000418331 EDEM1Q92611 657 aa22.09■■□□□ 1.13
PTPRJ-201ENST00000418331 WWOXQ9NZC7 414 aa22.09■■□□□ 1.13
PTPRJ-201ENST00000418331 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa22.09■■□□□ 1.13
PTPRJ-201ENST00000418331 KLRC4O43908 158 aa22.09■■□□□ 1.13
PTPRJ-201ENST00000418331 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
PTPRJ-201ENST00000418331 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
PTPRJ-201ENST00000418331 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
PTPRJ-201ENST00000418331 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP22.09■■□□□ 1.13
PTPRJ-201ENST00000418331 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.9 ms