RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409945.1

USP40-202, Transcript of ubiquitin specific peptidase 40, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene USP40, Length 1,946 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP40-202ENST00000409945 AFMIDQ63HM1 303 aa7.23□□□□□ -1.25
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USP40-202ENST00000409945 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP7.22□□□□□ -1.25
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USP40-202ENST00000409945 PRSS29PA6NIE9 313 aa7.21□□□□□ -1.26
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USP40-202ENST00000409945 MEGF9Q9H1U4 602 aa7.21□□□□□ -1.26
USP40-202ENST00000409945 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa7.21□□□□□ -1.26
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USP40-202ENST00000409945 JUNP05412 331 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
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USP40-202ENST00000409945 MCCP23508 829 aa7.2□□□□□ -1.26
USP40-202ENST00000409945 ADORA2AP29274 412 aa7.2□□□□□ -1.26
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