RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395788.3

C6orf48-208, Transcript of chromosome 6 open reading frame 48, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene C6orf48, Length 815 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf48-208ENST00000395788 PDCL3Q9H2J4 239 aa6.36□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa6.36□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 FAM105AQ9NUU6 356 aa6.36□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP6.36□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 WDR35Q9P2L0 1181 aa6.36□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 ANAPC7Q9UJX3 599 aa6.36□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 STRIP2Q9ULQ0 834 aa6.36□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa6.36□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 CITO14578 2027 aa6.36□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 A0A0U1RQF3 1178 aa6.35□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 SIGLEC16A6NMB1 481 aa6.35□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 KPNA7A9QM74 516 aa6.35□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 GABRDO14764 452 aa6.35□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 FSCN2O14926 492 aa6.35□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 PSTPIP1O43586 416 aa6.35□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 MGEA5O60502 916 aa6.35□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 ERLIN1O75477 346 aa6.35□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 FGGP02679 453 aa6.35□□□□□ -1.39
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C6orf48-208ENST00000395788 CD19P15391 556 aa6.35□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 WARSP23381 471 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 PAX3P23760 479 aa6.35□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 MARCKSL1P49006 195 aa6.35□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP6.35□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 TAF6P49848 677 aa6.35□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 CDK7P50613 346 aa6.35□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 RWDD2BP57060 319 aa6.35□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 LILRA4P59901 499 aa6.35□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 FAM189BP81408 668 aa6.35□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa6.35□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 SV2CQ496J9 727 aa6.35□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 ZNF394Q53GI3 561 aa6.35□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 SGO2Q562F6 1265 aa6.35□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 GLRA4Q5JXX5 417 aa6.35□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 CCDC70Q6NSX1 233 aa6.35□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 LLGL2Q6P1M3 1020 aa6.35□□□□□ -1.39
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C6orf48-208ENST00000395788 TMEM110Q86TL2 294 aa6.35□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 ERICH1Q86X53 443 aa6.35□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 XYLT1Q86Y38 959 aa6.35□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 KATNAL2Q8IYT4 538 aa6.35□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 HACE1Q8IYU2 909 aa6.35□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa6.35□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP6.35□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 PLPP7Q8NBV4 271 aa6.35□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 SPATA18Q8TC71 538 aa6.35□□□□□ -1.39
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C6orf48-208ENST00000395788 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 SLC35F5Q8WV83 523 aa6.35□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP6.35□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 C18orf8Q96DM3 657 aa6.35□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 C7orf69Q9H7B7 122 aa6.35□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 ARFGAP3Q9NP61 516 aa6.35□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 SLC38A7Q9NVC3 462 aa6.35□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 STIM2Q9P246 746 aa6.35□□□□□ -1.39
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C6orf48-208ENST00000395788 CEP83Q9Y592 693 aa6.35□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 SNX9Q9Y5X1 595 aa6.35□□□□□ -1.39
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C6orf48-208ENST00000395788 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 A0A1W2PQY0 241 aa6.34□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 MEIS3P2A8K0S8 358 aa6.34□□□□□ -1.39
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C6orf48-208ENST00000395788 RAD51CO43502 376 aa6.34□□□□□ -1.39
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C6orf48-208ENST00000395788 RRP9O43818 475 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
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C6orf48-208ENST00000395788 GLI1P08151 1106 aa6.34□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 CTSHP09668 335 aa6.34□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 MYBL2P10244 700 aa6.34□□□□□ -1.39
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C6orf48-208ENST00000395788 SKIP12755 728 aa6.34□□□□□ -1.39
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C6orf48-208ENST00000395788 CD52P31358 61 aa6.34□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 GRK4P32298 578 aa6.34□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 RPL9P32969 192 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 PTPN7P35236 360 aa6.34□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 SCNN1AP37088 669 aa6.34□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 THPOP40225 353 aa6.34□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 DNA2P51530 1060 aa6.34□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 DRG2P55039 364 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 TAS2R40P59535 323 aa6.34□□□□□ -1.39
C6orf48-208ENST00000395788 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
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