RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392011.6

SH3BP4-202, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,194 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-202ENST00000392011 WDR59Q6PJI9 974 aa17.8■□□□□ 0.44
SH3BP4-202ENST00000392011 RRM2BQ7LG56 351 aa17.8■□□□□ 0.44
SH3BP4-202ENST00000392011 STRA8Q7Z7C7 330 aa17.8■□□□□ 0.44
SH3BP4-202ENST00000392011 VSIG10LQ86VR7 867 aa17.8■□□□□ 0.44
SH3BP4-202ENST00000392011 COLEC11Q9BWP8 271 aa17.8■□□□□ 0.44
SH3BP4-202ENST00000392011 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP17.8■□□□□ 0.44
SH3BP4-202ENST00000392011 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP17.8■□□□□ 0.44
SH3BP4-202ENST00000392011 ELK3P41970 407 aa17.79■□□□□ 0.44
SH3BP4-202ENST00000392011 MMP14P50281 582 aa17.79■□□□□ 0.44
SH3BP4-202ENST00000392011 NUDT2P50583 147 aa17.79■□□□□ 0.44
SH3BP4-202ENST00000392011 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP17.79■□□□□ 0.44
SH3BP4-202ENST00000392011 ARHGAP18Q8N392 663 aa17.79■□□□□ 0.44
SH3BP4-202ENST00000392011 FOPNLQ96NB1 174 aa17.79■□□□□ 0.44
SH3BP4-202ENST00000392011 WDR18Q9BV38 432 aa17.79■□□□□ 0.44
SH3BP4-202ENST00000392011 CYP4F12Q9HCS2 524 aa17.79■□□□□ 0.44
SH3BP4-202ENST00000392011 RNF19AQ9NV58 838 aa17.79■□□□□ 0.44
SH3BP4-202ENST00000392011 PCDHB8Q9UN66 801 aa17.79■□□□□ 0.44
SH3BP4-202ENST00000392011 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa17.79■□□□□ 0.44
SH3BP4-202ENST00000392011 LACTBL1A8MY62 500 aa17.79■□□□□ 0.44
SH3BP4-202ENST00000392011 PDHXO00330 501 aa17.79■□□□□ 0.44
SH3BP4-202ENST00000392011 OAZ1P54368 228 aa17.79■□□□□ 0.44
SH3BP4-202ENST00000392011 AADACL2Q6P093 401 aa17.79■□□□□ 0.44
SH3BP4-202ENST00000392011 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa17.79■□□□□ 0.44
SH3BP4-202ENST00000392011 EPS8L1Q8TE68 723 aa17.79■□□□□ 0.44
SH3BP4-202ENST00000392011 VCPIP1Q96JH7 1222 aa17.79■□□□□ 0.44
SH3BP4-202ENST00000392011 CHST7Q9NS84 486 aa17.79■□□□□ 0.44
SH3BP4-202ENST00000392011 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP17.79■□□□□ 0.44
SH3BP4-202ENST00000392011 ITGA11Q9UKX5 1188 aa17.79■□□□□ 0.44
SH3BP4-202ENST00000392011 DNPEPQ9ULA0 475 aa17.79■□□□□ 0.44
SH3BP4-202ENST00000392011 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP17.79■□□□□ 0.44
SH3BP4-202ENST00000392011 CXCL11O14625 94 aa17.79■□□□□ 0.44
SH3BP4-202ENST00000392011 FKBP1CQ5VVH2 108 aa17.79■□□□□ 0.44
SH3BP4-202ENST00000392011 MRNIPQ6NTE8 343 aa17.79■□□□□ 0.44
SH3BP4-202ENST00000392011 CLEC4FQ8N1N0 589 aa17.79■□□□□ 0.44
SH3BP4-202ENST00000392011 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP17.79■□□□□ 0.44
SH3BP4-202ENST00000392011 DNAJC18Q9H819 358 aa17.79■□□□□ 0.44
SH3BP4-202ENST00000392011 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP17.79■□□□□ 0.44
SH3BP4-202ENST00000392011 DCDC2Q9UHG0 476 aa17.79■□□□□ 0.44
SH3BP4-202ENST00000392011 SLC24A2Q9UI40 661 aa17.79■□□□□ 0.44
SH3BP4-202ENST00000392011 CRLS1Q9UJA2 301 aa17.79■□□□□ 0.44
SH3BP4-202ENST00000392011 TIMM44O43615 452 aa17.79■□□□□ 0.44
SH3BP4-202ENST00000392011 TPST1O60507 370 aa17.79■□□□□ 0.44
SH3BP4-202ENST00000392011 POMCP01189 267 aa17.79■□□□□ 0.44
SH3BP4-202ENST00000392011 SCTRP47872 440 aa17.79■□□□□ 0.44
SH3BP4-202ENST00000392011 POU4F1Q01851 419 aa17.79■□□□□ 0.44
SH3BP4-202ENST00000392011 ZNF844Q08AG5 666 aa17.79■□□□□ 0.44
SH3BP4-202ENST00000392011 AGAP9Q5VTM2 703 aa17.79■□□□□ 0.44
SH3BP4-202ENST00000392011 YAF2Q8IY57 180 aa17.79■□□□□ 0.44
SH3BP4-202ENST00000392011 ASB7Q9H672 318 aa17.79■□□□□ 0.44
SH3BP4-202ENST00000392011 RCCD1A6NED2 376 aa17.78■□□□□ 0.44
SH3BP4-202ENST00000392011 F8VP50 259 aa17.78■□□□□ 0.44
SH3BP4-202ENST00000392011 AQP5P55064 265 aa17.78■□□□□ 0.44
SH3BP4-202ENST00000392011 LRRC74AQ0VAA2 488 aa17.78■□□□□ 0.44
SH3BP4-202ENST00000392011 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP17.78■□□□□ 0.44
SH3BP4-202ENST00000392011 C16orf87Q6PH81 154 aa17.78■□□□□ 0.44
SH3BP4-202ENST00000392011 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP17.78■□□□□ 0.44
SH3BP4-202ENST00000392011 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP17.78■□□□□ 0.44
SH3BP4-202ENST00000392011 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa17.78■□□□□ 0.44
SH3BP4-202ENST00000392011 CFAP99D6REC4 459 aa17.78■□□□□ 0.44
SH3BP4-202ENST00000392011 PTPRAP18433 802 aa17.78■□□□□ 0.44
SH3BP4-202ENST00000392011 BGNP21810 368 aa17.78■□□□□ 0.44
SH3BP4-202ENST00000392011 SREBF2Q12772 1141 aa17.78■□□□□ 0.44
SH3BP4-202ENST00000392011 CTXN3Q4LDR2 81 aa17.78■□□□□ 0.44
SH3BP4-202ENST00000392011 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP17.78■□□□□ 0.44
SH3BP4-202ENST00000392011 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP17.78■□□□□ 0.44
SH3BP4-202ENST00000392011 PKD2L2Q9NZM6 624 aa17.78■□□□□ 0.44
SH3BP4-202ENST00000392011 SHOC2Q9UQ13 582 aa17.78■□□□□ 0.44
SH3BP4-202ENST00000392011 KCNA3P22001 575 aa17.78■□□□□ 0.44
SH3BP4-202ENST00000392011 LHX1P48742 406 aa17.78■□□□□ 0.44
SH3BP4-202ENST00000392011 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP17.78■□□□□ 0.44
SH3BP4-202ENST00000392011 CD248Q9HCU0 757 aa17.78■□□□□ 0.44
SH3BP4-202ENST00000392011 UBOX5O94941 541 aa17.78■□□□□ 0.44
SH3BP4-202ENST00000392011 APOA4P06727 396 aa17.78■□□□□ 0.44
SH3BP4-202ENST00000392011 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP17.78■□□□□ 0.44
SH3BP4-202ENST00000392011 C3orf20Q8ND61 904 aa17.78■□□□□ 0.44
SH3BP4-202ENST00000392011 SYT15Q9BQS2 421 aa17.78■□□□□ 0.44
SH3BP4-202ENST00000392011 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa17.78■□□□□ 0.44
SH3BP4-202ENST00000392011 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP17.77■□□□□ 0.44
SH3BP4-202ENST00000392011 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP17.77■□□□□ 0.44
SH3BP4-202ENST00000392011 PLIN5Q00G26 463 aa17.77■□□□□ 0.44
SH3BP4-202ENST00000392011 ADIGQ0VDE8 80 aa17.77■□□□□ 0.44
SH3BP4-202ENST00000392011 SNX31Q8N9S9 440 aa17.77■□□□□ 0.44
SH3BP4-202ENST00000392011 TUBGCP3Q96CW5 907 aa17.77■□□□□ 0.44
SH3BP4-202ENST00000392011 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP17.77■□□□□ 0.44
SH3BP4-202ENST00000392011 SLC12A8A0AV02 714 aa17.77■□□□□ 0.44
SH3BP4-202ENST00000392011 F5H5T6 163 aa17.77■□□□□ 0.44
SH3BP4-202ENST00000392011 MICAL2O94851 1124 aa17.77■□□□□ 0.44
SH3BP4-202ENST00000392011 ADORA2AP29274 412 aa17.77■□□□□ 0.44
SH3BP4-202ENST00000392011 SERPINB5P36952 375 aa17.77■□□□□ 0.44
SH3BP4-202ENST00000392011 FLOT2Q14254 428 aa17.77■□□□□ 0.44
SH3BP4-202ENST00000392011 MTFR1Q15390 333 aa17.77■□□□□ 0.44
SH3BP4-202ENST00000392011 TAGAPQ8N103 731 aa17.77■□□□□ 0.44
SH3BP4-202ENST00000392011 ADAM32Q8TC27 787 aa17.77■□□□□ 0.44
SH3BP4-202ENST00000392011 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP17.77■□□□□ 0.44
SH3BP4-202ENST00000392011 C10orf88Q9H8K7 445 aa17.77■□□□□ 0.44
SH3BP4-202ENST00000392011 KCNK1O00180 336 aa17.77■□□□□ 0.44
SH3BP4-202ENST00000392011 FBXO21O94952 628 aa17.77■□□□□ 0.44
SH3BP4-202ENST00000392011 FKBP9O95302 570 aa17.77■□□□□ 0.44
SH3BP4-202ENST00000392011 NQO1P15559 274 aaKnown RBP17.77■□□□□ 0.44
SH3BP4-202ENST00000392011 AMPD1P23109 780 aa17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.7 ms