RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376152.2

PRAMEF15-201, Transcript of PRAME family member 15, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRAMEF15, Length 1,865 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF15-201ENST00000376152 SOD2P04179 222 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAMEF15-201ENST00000376152 CTNNA2P26232 953 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAMEF15-201ENST00000376152 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
PRAMEF15-201ENST00000376152 SCNN1AP37088 669 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAMEF15-201ENST00000376152 TKTL1P51854 596 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAMEF15-201ENST00000376152 ARPP19P56211 112 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAMEF15-201ENST00000376152 TAS2R40P59535 323 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAMEF15-201ENST00000376152 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
PRAMEF15-201ENST00000376152 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
PRAMEF15-201ENST00000376152 CFAP221Q4G0U5 840 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAMEF15-201ENST00000376152 RASIP1Q5U651 963 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAMEF15-201ENST00000376152 SLC26A9Q7LBE3 791 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAMEF15-201ENST00000376152 FIBCD1Q8N539 461 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAMEF15-201ENST00000376152 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAMEF15-201ENST00000376152 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAMEF15-201ENST00000376152 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
PRAMEF15-201ENST00000376152 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
PRAMEF15-201ENST00000376152 PIK3R5Q8WYR1 880 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAMEF15-201ENST00000376152 TMEM169Q96HH4 297 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAMEF15-201ENST00000376152 SGSM3Q96HU1 749 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAMEF15-201ENST00000376152 MS4A14Q96JA4 679 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAMEF15-201ENST00000376152 PGLYRP2Q96PD5 576 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAMEF15-201ENST00000376152 SLC9A7Q96T83 725 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAMEF15-201ENST00000376152 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAMEF15-201ENST00000376152 LRRC4Q9HBW1 653 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAMEF15-201ENST00000376152 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
PRAMEF15-201ENST00000376152 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAMEF15-201ENST00000376152 EHD2Q9NZN4 543 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAMEF15-201ENST00000376152 MTRRQ9UBK8 725 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAMEF15-201ENST00000376152 USTQ9Y2C2 406 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAMEF15-201ENST00000376152 INSL6Q9Y581 213 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAMEF15-201ENST00000376152 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa11.67□□□□□ -0.54
PRAMEF15-201ENST00000376152 LCHNA4D1U4 455 aa11.66□□□□□ -0.54
PRAMEF15-201ENST00000376152 H0YHG0 523 aa11.66□□□□□ -0.54
PRAMEF15-201ENST00000376152 CES2O00748 559 aa11.66□□□□□ -0.54
PRAMEF15-201ENST00000376152 TCF4P15884 667 aa11.66□□□□□ -0.54
PRAMEF15-201ENST00000376152 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
PRAMEF15-201ENST00000376152 PSMA2P25787 234 aa11.66□□□□□ -0.54
PRAMEF15-201ENST00000376152 LIG3P49916 1009 aa11.66□□□□□ -0.54
PRAMEF15-201ENST00000376152 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
PRAMEF15-201ENST00000376152 SARNPP82979 210 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
PRAMEF15-201ENST00000376152 GPR17Q13304 367 aa11.66□□□□□ -0.54
PRAMEF15-201ENST00000376152 PSMD5Q16401 504 aa11.66□□□□□ -0.54
PRAMEF15-201ENST00000376152 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
PRAMEF15-201ENST00000376152 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa11.66□□□□□ -0.54
PRAMEF15-201ENST00000376152 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
PRAMEF15-201ENST00000376152 TTC9BQ8N6N2 239 aa11.66□□□□□ -0.54
PRAMEF15-201ENST00000376152 ATAD1Q8NBU5 361 aa11.66□□□□□ -0.54
PRAMEF15-201ENST00000376152 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
PRAMEF15-201ENST00000376152 RXFP2Q8WXD0 754 aa11.66□□□□□ -0.54
PRAMEF15-201ENST00000376152 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
PRAMEF15-201ENST00000376152 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP11.66□□□□□ -0.54
PRAMEF15-201ENST00000376152 PBKQ96KB5 322 aa11.66□□□□□ -0.54
PRAMEF15-201ENST00000376152 RAD9AQ99638 391 aa11.66□□□□□ -0.54
PRAMEF15-201ENST00000376152 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
PRAMEF15-201ENST00000376152 ULBP1Q9BZM6 244 aa11.66□□□□□ -0.54
PRAMEF15-201ENST00000376152 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa11.66□□□□□ -0.54
PRAMEF15-201ENST00000376152 BACE2Q9Y5Z0 518 aa11.66□□□□□ -0.54
PRAMEF15-201ENST00000376152 CDY1Q9Y6F8 540 aa11.66□□□□□ -0.54
PRAMEF15-201ENST00000376152 MTMR11A4FU01 709 aa11.66□□□□□ -0.54
PRAMEF15-201ENST00000376152 CARNS1A5YM72 827 aa11.66□□□□□ -0.54
PRAMEF15-201ENST00000376152 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
PRAMEF15-201ENST00000376152 CPB1P15086 417 aa11.66□□□□□ -0.54
PRAMEF15-201ENST00000376152 PDGFRAP16234 1089 aa11.66□□□□□ -0.54
PRAMEF15-201ENST00000376152 RPL17P18621 184 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
PRAMEF15-201ENST00000376152 GPD1P21695 349 aa11.66□□□□□ -0.54
PRAMEF15-201ENST00000376152 GRIK1P39086 918 aa11.66□□□□□ -0.54
PRAMEF15-201ENST00000376152 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
PRAMEF15-201ENST00000376152 DSG1Q02413 1049 aa11.66□□□□□ -0.54
PRAMEF15-201ENST00000376152 SLC8B1Q6J4K2 584 aa11.66□□□□□ -0.54
PRAMEF15-201ENST00000376152 KIAA1841Q6NSI8 718 aa11.66□□□□□ -0.54
PRAMEF15-201ENST00000376152 WDR93Q6P2C0 686 aa11.66□□□□□ -0.54
PRAMEF15-201ENST00000376152 ARCQ7LC44 396 aa11.66□□□□□ -0.54
PRAMEF15-201ENST00000376152 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa11.66□□□□□ -0.54
PRAMEF15-201ENST00000376152 UBL4BQ8N7F7 174 aa11.66□□□□□ -0.54
PRAMEF15-201ENST00000376152 FBXO22Q8NEZ5 403 aa11.66□□□□□ -0.54
PRAMEF15-201ENST00000376152 RNF217Q8TC41 542 aa11.66□□□□□ -0.54
PRAMEF15-201ENST00000376152 LRCH3Q96II8 777 aa11.66□□□□□ -0.54
PRAMEF15-201ENST00000376152 PNPLA8Q9NP80 782 aa11.66□□□□□ -0.54
PRAMEF15-201ENST00000376152 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa11.65□□□□□ -0.54
PRAMEF15-201ENST00000376152 C2CD2LO14523 706 aa11.65□□□□□ -0.54
PRAMEF15-201ENST00000376152 DPYSL4O14531 572 aa11.65□□□□□ -0.54
PRAMEF15-201ENST00000376152 TNFRSF10BO14763 440 aa11.65□□□□□ -0.54
PRAMEF15-201ENST00000376152 TLL1O43897 1013 aa11.65□□□□□ -0.54
PRAMEF15-201ENST00000376152 RNF40O75150 1001 aa11.65□□□□□ -0.54
PRAMEF15-201ENST00000376152 LRCH4O75427 683 aa11.65□□□□□ -0.54
PRAMEF15-201ENST00000376152 FBXO21O94952 628 aa11.65□□□□□ -0.54
PRAMEF15-201ENST00000376152 FSBPO95073 299 aa11.65□□□□□ -0.54
PRAMEF15-201ENST00000376152 USP17L7P0C7H9 530 aa11.65□□□□□ -0.54
PRAMEF15-201ENST00000376152 PPM1AP35813 382 aa11.65□□□□□ -0.54
PRAMEF15-201ENST00000376152 MAGEA11P43364 429 aa11.65□□□□□ -0.54
PRAMEF15-201ENST00000376152 GLUD2P49448 558 aa11.65□□□□□ -0.54
PRAMEF15-201ENST00000376152 GPR15P49685 360 aa11.65□□□□□ -0.54
PRAMEF15-201ENST00000376152 DAOAP59103 153 aa11.65□□□□□ -0.54
PRAMEF15-201ENST00000376152 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
PRAMEF15-201ENST00000376152 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
PRAMEF15-201ENST00000376152 CCDC14Q49A88 953 aa11.65□□□□□ -0.54
PRAMEF15-201ENST00000376152 RAB6CQ53S08 254 aa11.65□□□□□ -0.54
PRAMEF15-201ENST00000376152 EFHC1Q5JVL4 640 aa11.65□□□□□ -0.54
PRAMEF15-201ENST00000376152 C9orf50Q5SZB4 431 aa11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.2 ms