RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367364.5

PTPRC-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 1,017 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-202ENST00000367364 SLC11A2P49281 568 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-202ENST00000367364 WNT3P56703 355 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-202ENST00000367364 NFATC4Q14934 902 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-202ENST00000367364 PTCHD3Q3KNS1 767 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-202ENST00000367364 MGAT5BQ3V5L5 792 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-202ENST00000367364 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-202ENST00000367364 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-202ENST00000367364 TMEM63BQ5T3F8 832 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-202ENST00000367364 SYDE2Q5VT97 1194 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-202ENST00000367364 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-202ENST00000367364 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-202ENST00000367364 KAZALD1Q96I82 304 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-202ENST00000367364 HS6ST2Q96MM7 605 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-202ENST00000367364 SCNM1Q9BWG6 230 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-202ENST00000367364 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-202ENST00000367364 SNX15Q9NRS6 342 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-202ENST00000367364 TRHDEQ9UKU6 1024 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-202ENST00000367364 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-202ENST00000367364 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-202ENST00000367364 CFHR3Q02985 330 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-202ENST00000367364 KEAP1Q14145 624 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-202ENST00000367364 NECAB2Q7Z6G3 386 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-202ENST00000367364 GAS2L3Q86XJ1 694 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-202ENST00000367364 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-202ENST00000367364 FBXL14Q8N1E6 418 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-202ENST00000367364 NEUROG1Q92886 237 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-202ENST00000367364 ATP2A3Q93084 1043 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-202ENST00000367364 MLXIPLQ9NP71 852 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-202ENST00000367364 TMEM45AQ9NWC5 275 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-202ENST00000367364 PCDHA6Q9UN73 950 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-202ENST00000367364 PCDHA12Q9UN75 941 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-202ENST00000367364 COG5Q9UP83 839 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-202ENST00000367364 CLIC1O00299 241 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRC-202ENST00000367364 SPTLC2O15270 562 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRC-202ENST00000367364 CAMTA2O94983 1202 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRC-202ENST00000367364 TACR3P29371 465 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRC-202ENST00000367364 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
PTPRC-202ENST00000367364 PRKAG1P54619 331 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRC-202ENST00000367364 PPATQ06203 517 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRC-202ENST00000367364 MFSD13AQ14CX5 517 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRC-202ENST00000367364 LCE1FQ5T754 118 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRC-202ENST00000367364 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
PTPRC-202ENST00000367364 BPIFB1Q8TDL5 484 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRC-202ENST00000367364 MED30Q96HR3 178 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRC-202ENST00000367364 PCDHA7Q9UN72 937 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRC-202ENST00000367364 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP4.9□□□□□ -1.63
PTPRC-202ENST00000367364 SHTN1A0MZ66 631 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-202ENST00000367364 H3BUI4 141 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-202ENST00000367364 GABRDO14764 452 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-202ENST00000367364 INPPL1O15357 1258 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-202ENST00000367364 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-202ENST00000367364 P2RX3P56373 397 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-202ENST00000367364 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-202ENST00000367364 CERCAMQ5T4B2 595 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-202ENST00000367364 DCAF12L1Q5VU92 463 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-202ENST00000367364 DENND2CQ68D51 928 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-202ENST00000367364 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-202ENST00000367364 MIER2Q8N344 545 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-202ENST00000367364 IQCF1Q8N6M8 205 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-202ENST00000367364 PPP2R3CQ969Q6 453 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-202ENST00000367364 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-202ENST00000367364 SLC35A4Q96G79 324 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-202ENST00000367364 WDYHV1Q96HA8 205 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-202ENST00000367364 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-202ENST00000367364 TM2D2Q9BX73 214 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-202ENST00000367364 DECR2Q9NUI1 292 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-202ENST00000367364 MSRB1Q9NZV6 116 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-202ENST00000367364 MGAT4CQ9UBM8 478 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-202ENST00000367364 MED16Q9Y2X0 877 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-202ENST00000367364 LINC01565O15544 149 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRC-202ENST00000367364 CREB1P16220 341 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRC-202ENST00000367364 BCAT1P54687 386 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRC-202ENST00000367364 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
PTPRC-202ENST00000367364 KRT71Q3SY84 523 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRC-202ENST00000367364 PDXDC1Q6P996 788 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRC-202ENST00000367364 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
PTPRC-202ENST00000367364 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
PTPRC-202ENST00000367364 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
PTPRC-202ENST00000367364 TUBB6Q9BUF5 446 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRC-202ENST00000367364 CD93Q9NPY3 652 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRC-202ENST00000367364 A0A1W2PPC1 479 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-202ENST00000367364 RRHO14718 337 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-202ENST00000367364 TMPRSS11DO60235 418 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-202ENST00000367364 DTNBO60941 627 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-202ENST00000367364 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-202ENST00000367364 POLD2P49005 469 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-202ENST00000367364 RRP1P56182 461 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-202ENST00000367364 LTBQ06643 244 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-202ENST00000367364 CCNIQ14094 377 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-202ENST00000367364 USP45Q70EL2 814 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-202ENST00000367364 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-202ENST00000367364 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-202ENST00000367364 HIC2Q96JB3 615 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-202ENST00000367364 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-202ENST00000367364 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-202ENST00000367364 PLAUP00749 431 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-202ENST00000367364 HSD3B2P26439 372 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-202ENST00000367364 PLA1AQ53H76 456 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-202ENST00000367364 FAM57BQ71RH2 274 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-202ENST00000367364 TMEM199Q8N511 208 aa4.86□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.7 ms