RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361726.6

GJB1-201, Transcript of gap junction protein beta 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GJB1, Length 1,637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1-201ENST00000361726 E7ENQ6 273 aa14.7□□□□□ -0.06
GJB1-201ENST00000361726 H7C4K7 107 aa14.7□□□□□ -0.06
GJB1-201ENST00000361726 PRPSAP2O60256 369 aa14.7□□□□□ -0.06
GJB1-201ENST00000361726 EFEMP2O95967 443 aa14.7□□□□□ -0.06
GJB1-201ENST00000361726 ZBED1O96006 694 aa14.7□□□□□ -0.06
GJB1-201ENST00000361726 GLI1P08151 1106 aa14.7□□□□□ -0.06
GJB1-201ENST00000361726 KRT10P13645 584 aa14.7□□□□□ -0.06
GJB1-201ENST00000361726 CPB1P15086 417 aa14.7□□□□□ -0.06
GJB1-201ENST00000361726 CETN2P41208 172 aa14.7□□□□□ -0.06
GJB1-201ENST00000361726 SULT1E1P49888 294 aa14.7□□□□□ -0.06
GJB1-201ENST00000361726 CLCN6P51797 869 aa14.7□□□□□ -0.06
GJB1-201ENST00000361726 HDAC4P56524 1084 aa14.7□□□□□ -0.06
GJB1-201ENST00000361726 RBM10P98175 930 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
GJB1-201ENST00000361726 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
GJB1-201ENST00000361726 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP14.7□□□□□ -0.06
GJB1-201ENST00000361726 DCAF6Q58WW2 860 aa14.7□□□□□ -0.06
GJB1-201ENST00000361726 KAZNQ674X7 775 aa14.7□□□□□ -0.06
GJB1-201ENST00000361726 WDR93Q6P2C0 686 aa14.7□□□□□ -0.06
GJB1-201ENST00000361726 SCYL2Q6P3W7 929 aa14.7□□□□□ -0.06
GJB1-201ENST00000361726 ANKS3Q6ZW76 656 aa14.7□□□□□ -0.06
GJB1-201ENST00000361726 BHLHA9Q7RTU4 235 aa14.7□□□□□ -0.06
GJB1-201ENST00000361726 SCN4BQ8IWT1 228 aa14.7□□□□□ -0.06
GJB1-201ENST00000361726 C7orf61Q8IZ16 206 aa14.7□□□□□ -0.06
GJB1-201ENST00000361726 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP14.7□□□□□ -0.06
GJB1-201ENST00000361726 ZNF558Q96NG5 402 aa14.7□□□□□ -0.06
GJB1-201ENST00000361726 SLC2A13Q96QE2 648 aa14.7□□□□□ -0.06
GJB1-201ENST00000361726 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
GJB1-201ENST00000361726 STIM2Q9P246 746 aa14.7□□□□□ -0.06
GJB1-201ENST00000361726 AMACRQ9UHK6 382 aa14.7□□□□□ -0.06
GJB1-201ENST00000361726 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa14.7□□□□□ -0.06
GJB1-201ENST00000361726 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa14.7□□□□□ -0.06
GJB1-201ENST00000361726 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
GJB1-201ENST00000361726 CCDC85CA6NKD9 419 aa14.7□□□□□ -0.06
GJB1-201ENST00000361726 TBC1D4O60343 1298 aa14.7□□□□□ -0.06
GJB1-201ENST00000361726 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
GJB1-201ENST00000361726 NOS2P35228 1153 aa14.7□□□□□ -0.06
GJB1-201ENST00000361726 PTPN7P35236 360 aa14.7□□□□□ -0.06
GJB1-201ENST00000361726 CDKN2BP42772 138 aa14.7□□□□□ -0.06
GJB1-201ENST00000361726 GPR15P49685 360 aa14.7□□□□□ -0.06
GJB1-201ENST00000361726 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
GJB1-201ENST00000361726 COPS2P61201 443 aa14.7□□□□□ -0.06
GJB1-201ENST00000361726 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
GJB1-201ENST00000361726 FPGSQ05932 587 aa14.7□□□□□ -0.06
GJB1-201ENST00000361726 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
GJB1-201ENST00000361726 CYP1B1Q16678 543 aa14.7□□□□□ -0.06
GJB1-201ENST00000361726 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
GJB1-201ENST00000361726 TFDP3Q5H9I0 405 aa14.7□□□□□ -0.06
GJB1-201ENST00000361726 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
GJB1-201ENST00000361726 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
GJB1-201ENST00000361726 TTC9BQ8N6N2 239 aa14.7□□□□□ -0.06
GJB1-201ENST00000361726 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa14.7□□□□□ -0.06
GJB1-201ENST00000361726 SCAMP5Q8TAC9 235 aa14.7□□□□□ -0.06
GJB1-201ENST00000361726 MAIP1Q8WWC4 291 aa14.7□□□□□ -0.06
GJB1-201ENST00000361726 C1orf54Q8WWF1 131 aa14.7□□□□□ -0.06
GJB1-201ENST00000361726 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
GJB1-201ENST00000361726 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
GJB1-201ENST00000361726 YME1L1Q96TA2 773 aa14.7□□□□□ -0.06
GJB1-201ENST00000361726 POPDC2Q9HBU9 364 aa14.7□□□□□ -0.06
GJB1-201ENST00000361726 CHST7Q9NS84 486 aa14.7□□□□□ -0.06
GJB1-201ENST00000361726 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP14.7□□□□□ -0.067e-13■□□□□ 8.8
GJB1-201ENST00000361726 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa14.7□□□□□ -0.06
GJB1-201ENST00000361726 TNFRSF10BO14763 440 aa14.69□□□□□ -0.06
GJB1-201ENST00000361726 TTI1O43156 1089 aa14.69□□□□□ -0.06
GJB1-201ENST00000361726 LTFP02788 710 aa14.69□□□□□ -0.06
GJB1-201ENST00000361726 FYNP06241 537 aa14.69□□□□□ -0.06
GJB1-201ENST00000361726 CD48P09326 243 aa14.69□□□□□ -0.06
GJB1-201ENST00000361726 KDELR1P24390 212 aa14.69□□□□□ -0.06
GJB1-201ENST00000361726 SLC5A3P53794 718 aa14.69□□□□□ -0.06
GJB1-201ENST00000361726 ADCY2Q08462 1091 aa14.69□□□□□ -0.06
GJB1-201ENST00000361726 BRD3Q15059 726 aa14.69□□□□□ -0.06
GJB1-201ENST00000361726 PPP2R5EQ16537 467 aa14.69□□□□□ -0.06
GJB1-201ENST00000361726 USP41Q3LFD5 358 aa14.69□□□□□ -0.06
GJB1-201ENST00000361726 SLC25A52Q3SY17 297 aa14.69□□□□□ -0.06
GJB1-201ENST00000361726 SYPL2Q5VXT5 272 aa14.69□□□□□ -0.06
GJB1-201ENST00000361726 PM20D1Q6GTS8 502 aa14.69□□□□□ -0.06
GJB1-201ENST00000361726 TTC27Q6P3X3 843 aa14.69□□□□□ -0.06
GJB1-201ENST00000361726 ZNF365Q70YC5 407 aa14.69□□□□□ -0.06
GJB1-201ENST00000361726 STRADAQ7RTN6 431 aa14.69□□□□□ -0.06
GJB1-201ENST00000361726 SLC39A11Q8N1S5 342 aa14.69□□□□□ -0.06
GJB1-201ENST00000361726 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
GJB1-201ENST00000361726 ATAD1Q8NBU5 361 aa14.69□□□□□ -0.06
GJB1-201ENST00000361726 KCTD6Q8NC69 237 aa14.69□□□□□ -0.06
GJB1-201ENST00000361726 STKLD1Q8NE28 680 aa14.69□□□□□ -0.06
GJB1-201ENST00000361726 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
GJB1-201ENST00000361726 CCDC26Q8TAB7 109 aa14.69□□□□□ -0.06
GJB1-201ENST00000361726 ATG4AQ8WYN0 398 aa14.69□□□□□ -0.06
GJB1-201ENST00000361726 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
GJB1-201ENST00000361726 IRGQQ8WZA9 623 aa14.69□□□□□ -0.06
GJB1-201ENST00000361726 RUBCNQ92622 972 aa14.69□□□□□ -0.06
GJB1-201ENST00000361726 NCAPGQ9BPX3 1015 aa14.69□□□□□ -0.06
GJB1-201ENST00000361726 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
GJB1-201ENST00000361726 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP14.69□□□□□ -0.06
GJB1-201ENST00000361726 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa14.69□□□□□ -0.06
GJB1-201ENST00000361726 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa14.69□□□□□ -0.06
GJB1-201ENST00000361726 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
GJB1-201ENST00000361726 MTMR11A4FU01 709 aa14.68□□□□□ -0.06
GJB1-201ENST00000361726 TRIM66O15016 1216 aa14.68□□□□□ -0.06
GJB1-201ENST00000361726 VNN2O95498 520 aa14.68□□□□□ -0.06
GJB1-201ENST00000361726 FGBP02675 491 aa14.68□□□□□ -0.06
GJB1-201ENST00000361726 TUBBP07437 444 aa14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.5 ms