RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359315.6

TPGS1-201, Transcript of tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TPGS1, Length 1,114 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1-201ENST00000359315 SHC3Q92529 594 aa28.42■■■□□ 2.14
TPGS1-201ENST00000359315 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP28.42■■■□□ 2.14
TPGS1-201ENST00000359315 LINC00597Q9H2U6 94 aa28.42■■■□□ 2.14
TPGS1-201ENST00000359315 CFAP97Q9P2B7 532 aa28.42■■■□□ 2.14
TPGS1-201ENST00000359315 DNAJC12Q9UKB3 198 aa28.42■■■□□ 2.14
TPGS1-201ENST00000359315 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP28.42■■■□□ 2.14
TPGS1-201ENST00000359315 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP28.42■■■□□ 2.14
TPGS1-201ENST00000359315 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa28.41■■■□□ 2.14
TPGS1-201ENST00000359315 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa28.41■■■□□ 2.14
TPGS1-201ENST00000359315 MDM4O15151 490 aa28.41■■■□□ 2.14
TPGS1-201ENST00000359315 CTHP32929 405 aa28.41■■■□□ 2.14
TPGS1-201ENST00000359315 PLA2G4AP47712 749 aa28.41■■■□□ 2.14
TPGS1-201ENST00000359315 CNGA2Q16280 664 aa28.41■■■□□ 2.14
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF852Q6ZMS4 543 aa28.41■■■□□ 2.14
TPGS1-201ENST00000359315 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa28.41■■■□□ 2.14
TPGS1-201ENST00000359315 BHLHA9Q7RTU4 235 aa28.41■■■□□ 2.14
TPGS1-201ENST00000359315 OSCP1Q8WVF1 389 aa28.41■■■□□ 2.14
TPGS1-201ENST00000359315 FAM3CQ92520 227 aa28.41■■■□□ 2.14
TPGS1-201ENST00000359315 FUCA2Q9BTY2 467 aa28.41■■■□□ 2.14
TPGS1-201ENST00000359315 ULBP1Q9BZM6 244 aa28.41■■■□□ 2.14
TPGS1-201ENST00000359315 CYLDQ9NQC7 956 aa28.41■■■□□ 2.14
TPGS1-201ENST00000359315 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP28.41■■■□□ 2.14
TPGS1-201ENST00000359315 SETSIPP0DME0 302 aa28.4■■■□□ 2.14
TPGS1-201ENST00000359315 RGS7P49802 495 aa28.4■■■□□ 2.14
TPGS1-201ENST00000359315 KLK7P49862 253 aa28.4■■■□□ 2.14
TPGS1-201ENST00000359315 ADIGQ0VDE8 80 aa28.4■■■□□ 2.14
TPGS1-201ENST00000359315 FZD5Q13467 585 aa28.4■■■□□ 2.14
TPGS1-201ENST00000359315 RUNX3Q13761 415 aa28.4■■■□□ 2.14
TPGS1-201ENST00000359315 EML3Q32P44 896 aa28.4■■■□□ 2.14
TPGS1-201ENST00000359315 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa28.4■■■□□ 2.14
TPGS1-201ENST00000359315 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP28.4■■■□□ 2.14
TPGS1-201ENST00000359315 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP28.4■■■□□ 2.14
TPGS1-201ENST00000359315 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP28.4■■■□□ 2.14
TPGS1-201ENST00000359315 NAGPAQ9UK23 515 aa28.4■■■□□ 2.14
TPGS1-201ENST00000359315 FHOD1Q9Y613 1164 aa28.4■■■□□ 2.14
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP28.4■■■□□ 2.14
TPGS1-201ENST00000359315 PIK3R2O00459 728 aa28.39■■■□□ 2.14
TPGS1-201ENST00000359315 RARGP13631 454 aa28.39■■■□□ 2.14
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF18P17022 549 aa28.39■■■□□ 2.14
TPGS1-201ENST00000359315 USP8P40818 1118 aa28.39■■■□□ 2.14
TPGS1-201ENST00000359315 SLC8A3P57103 927 aa28.39■■■□□ 2.14
TPGS1-201ENST00000359315 TCF15Q12870 199 aa28.39■■■□□ 2.14
TPGS1-201ENST00000359315 PMF1Q6P1K2 205 aa28.39■■■□□ 2.14
TPGS1-201ENST00000359315 DENND1BQ6P3S1 775 aa28.39■■■□□ 2.14
TPGS1-201ENST00000359315 SLC35F5Q8WV83 523 aa28.39■■■□□ 2.14
TPGS1-201ENST00000359315 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP28.38■■■□□ 2.13
TPGS1-201ENST00000359315 IRF1P10914 325 aa28.38■■■□□ 2.13
TPGS1-201ENST00000359315 IFNAR2P48551 515 aa28.38■■■□□ 2.13
TPGS1-201ENST00000359315 PDGFRLQ15198 375 aa28.38■■■□□ 2.13
TPGS1-201ENST00000359315 DTWD2Q8NBA8 298 aa28.38■■■□□ 2.13
TPGS1-201ENST00000359315 NACA2Q9H009 215 aa28.38■■■□□ 2.13
TPGS1-201ENST00000359315 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP28.38■■■□□ 2.13
TPGS1-201ENST00000359315 LRRC4Q9HBW1 653 aa28.38■■■□□ 2.13
TPGS1-201ENST00000359315 SYCE3A1L190 88 aa28.37■■■□□ 2.13
TPGS1-201ENST00000359315 MAN2B1O00754 1011 aa28.37■■■□□ 2.13
TPGS1-201ENST00000359315 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP28.37■■■□□ 2.13
TPGS1-201ENST00000359315 ATP1A3P13637 1013 aa28.37■■■□□ 2.13
TPGS1-201ENST00000359315 COPB1P53618 953 aaKnown RBP28.37■■■□□ 2.13
TPGS1-201ENST00000359315 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa28.37■■■□□ 2.13
TPGS1-201ENST00000359315 PM20D1Q6GTS8 502 aa28.37■■■□□ 2.13
TPGS1-201ENST00000359315 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP28.37■■■□□ 2.13
TPGS1-201ENST00000359315 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP28.37■■■□□ 2.13
TPGS1-201ENST00000359315 KCTD13Q8WZ19 329 aa28.37■■■□□ 2.13
TPGS1-201ENST00000359315 ECT2Q9H8V3 914 aa28.37■■■□□ 2.13
TPGS1-201ENST00000359315 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP28.37■■■□□ 2.13
TPGS1-201ENST00000359315 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP28.36■■■□□ 2.13
TPGS1-201ENST00000359315 THAP12O43422 761 aa28.36■■■□□ 2.13
TPGS1-201ENST00000359315 ZBED1O96006 694 aa28.36■■■□□ 2.13
TPGS1-201ENST00000359315 LCP1P13796 627 aa28.36■■■□□ 2.13
TPGS1-201ENST00000359315 GNA15P30679 374 aa28.36■■■□□ 2.13
TPGS1-201ENST00000359315 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP28.36■■■□□ 2.13
TPGS1-201ENST00000359315 STILQ15468 1287 aa28.36■■■□□ 2.13
TPGS1-201ENST00000359315 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP28.36■■■□□ 2.13
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF606Q8WXB4 792 aa28.36■■■□□ 2.13
TPGS1-201ENST00000359315 FAM81BQ96LP2 452 aa28.36■■■□□ 2.13
TPGS1-201ENST00000359315 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP28.36■■■□□ 2.13
TPGS1-201ENST00000359315 OSBPL6Q9BZF3 934 aa28.36■■■□□ 2.13
TPGS1-201ENST00000359315 EPHB6O15197 1021 aa28.35■■■□□ 2.13
TPGS1-201ENST00000359315 GPD2P43304 727 aa28.35■■■□□ 2.13
TPGS1-201ENST00000359315 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP28.35■■■□□ 2.132e-6■■■■□ 22.9
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TPGS1-201ENST00000359315 C10orf120Q5SQS8 335 aa28.35■■■□□ 2.13
TPGS1-201ENST00000359315 CLEC4CQ8WTT0 213 aa28.35■■■□□ 2.13
TPGS1-201ENST00000359315 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP28.35■■■□□ 2.13
TPGS1-201ENST00000359315 GANQ9H2C0 597 aa28.35■■■□□ 2.13
TPGS1-201ENST00000359315 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP28.35■■■□□ 2.13
TPGS1-201ENST00000359315 CLIC5Q9NZA1 410 aa28.35■■■□□ 2.13
TPGS1-201ENST00000359315 CYTH4Q9UIA0 394 aa28.35■■■□□ 2.13
TPGS1-201ENST00000359315 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP28.35■■■□□ 2.13
TPGS1-201ENST00000359315 MYO16Q9Y6X6 1858 aa28.35■■■□□ 2.13
TPGS1-201ENST00000359315 GREM1O60565 184 aa28.34■■■□□ 2.13
TPGS1-201ENST00000359315 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP28.34■■■□□ 2.13
TPGS1-201ENST00000359315 RAPGEF1Q13905 1077 aa28.34■■■□□ 2.13
TPGS1-201ENST00000359315 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP28.34■■■□□ 2.13
TPGS1-201ENST00000359315 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP28.34■■■□□ 2.13
TPGS1-201ENST00000359315 ATP2A3Q93084 1043 aa28.34■■■□□ 2.13
TPGS1-201ENST00000359315 CLDN23Q96B33 292 aa28.34■■■□□ 2.13
TPGS1-201ENST00000359315 MSANTD3Q96H12 275 aa28.34■■■□□ 2.13
TPGS1-201ENST00000359315 BPIFA3Q9BQP9 254 aa28.34■■■□□ 2.13
TPGS1-201ENST00000359315 KCNH6Q9H252 994 aa28.34■■■□□ 2.13
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