RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000354376.3

C9orf163-201, Transcript of chromosome 9 open reading frame 163, humanhuman

Gene C9orf163, Length 2,572 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf163-201ENST00000354376 FKBP1BP68106 108 aa23.53■■□□□ 1.36
C9orf163-201ENST00000354376 ROR1Q01973 937 aa23.53■■□□□ 1.36
C9orf163-201ENST00000354376 CCDC121Q6ZUS5 278 aa23.53■■□□□ 1.36
C9orf163-201ENST00000354376 IPPQ9Y573 584 aa23.53■■□□□ 1.36
C9orf163-201ENST00000354376 CLDN5O00501 218 aa23.52■■□□□ 1.36
C9orf163-201ENST00000354376 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
C9orf163-201ENST00000354376 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa23.52■■□□□ 1.36
C9orf163-201ENST00000354376 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
C9orf163-201ENST00000354376 TRABD2AQ86V40 505 aa23.52■■□□□ 1.36
C9orf163-201ENST00000354376 OSTM1Q86WC4 334 aa23.52■■□□□ 1.36
C9orf163-201ENST00000354376 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
C9orf163-201ENST00000354376 CXorf56Q9H5V9 222 aa23.52■■□□□ 1.36
C9orf163-201ENST00000354376 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
C9orf163-201ENST00000354376 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa23.52■■□□□ 1.36
C9orf163-201ENST00000354376 HAS3O00219 553 aa23.52■■□□□ 1.36
C9orf163-201ENST00000354376 WDR4P57081 412 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
C9orf163-201ENST00000354376 CCDC197Q8NCU1 140 aa23.52■■□□□ 1.36
C9orf163-201ENST00000354376 PYROXD1Q8WU10 500 aa23.52■■□□□ 1.36
C9orf163-201ENST00000354376 RABGEF1Q9UJ41 708 aa23.52■■□□□ 1.36
C9orf163-201ENST00000354376 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
C9orf163-201ENST00000354376 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa23.51■■□□□ 1.35
C9orf163-201ENST00000354376 RBL1P28749 1068 aa23.51■■□□□ 1.35
C9orf163-201ENST00000354376 FOXN2P32314 431 aa23.51■■□□□ 1.35
C9orf163-201ENST00000354376 NUGGCQ68CJ6 796 aa23.51■■□□□ 1.35
C9orf163-201ENST00000354376 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa23.51■■□□□ 1.35
C9orf163-201ENST00000354376 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP23.51■■□□□ 1.35
C9orf163-201ENST00000354376 USP29Q9HBJ7 922 aa23.51■■□□□ 1.35
C9orf163-201ENST00000354376 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa23.51■■□□□ 1.35
C9orf163-201ENST00000354376 GGA2Q9UJY4 613 aa23.51■■□□□ 1.35
C9orf163-201ENST00000354376 CHMP2BQ9UQN3 213 aa23.51■■□□□ 1.35
C9orf163-201ENST00000354376 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa23.51■■□□□ 1.35
C9orf163-201ENST00000354376 PYROXD2Q8N2H3 581 aa23.51■■□□□ 1.35
C9orf163-201ENST00000354376 TTC25Q96NG3 672 aa23.51■■□□□ 1.35
C9orf163-201ENST00000354376 KCNN4O15554 427 aa23.5■■□□□ 1.35
C9orf163-201ENST00000354376 BEST1O76090 585 aa23.5■■□□□ 1.35
C9orf163-201ENST00000354376 KRT15P19012 456 aa23.5■■□□□ 1.35
C9orf163-201ENST00000354376 ARL4CP56559 192 aa23.5■■□□□ 1.35
C9orf163-201ENST00000354376 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
C9orf163-201ENST00000354376 TTC39CQ8N584 583 aa23.5■■□□□ 1.35
C9orf163-201ENST00000354376 CCDC185Q8N715 623 aa23.5■■□□□ 1.35
C9orf163-201ENST00000354376 FBF1Q8TES7 1133 aa23.5■■□□□ 1.35
C9orf163-201ENST00000354376 CKAP2Q8WWK9 683 aa23.5■■□□□ 1.35
C9orf163-201ENST00000354376 CCT6BQ92526 530 aa23.5■■□□□ 1.35
C9orf163-201ENST00000354376 SPOCK2Q92563 424 aa23.5■■□□□ 1.35
C9orf163-201ENST00000354376 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
C9orf163-201ENST00000354376 GRID1Q9ULK0 1009 aa23.5■■□□□ 1.35
C9orf163-201ENST00000354376 STX2P32856 288 aa23.5■■□□□ 1.35
C9orf163-201ENST00000354376 STILQ15468 1287 aa23.5■■□□□ 1.35
C9orf163-201ENST00000354376 TRABDQ9H4I3 376 aa23.5■■□□□ 1.35
C9orf163-201ENST00000354376 DPYSL4O14531 572 aa23.49■■□□□ 1.35
C9orf163-201ENST00000354376 CTGFP29279 349 aa23.49■■□□□ 1.35
C9orf163-201ENST00000354376 SNX25Q9H3E2 840 aa23.49■■□□□ 1.35
C9orf163-201ENST00000354376 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
C9orf163-201ENST00000354376 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
C9orf163-201ENST00000354376 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
C9orf163-201ENST00000354376 ARHGAP17Q68EM7 881 aa23.49■■□□□ 1.35
C9orf163-201ENST00000354376 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
C9orf163-201ENST00000354376 PCGF5Q86SE9 256 aa23.49■■□□□ 1.35
C9orf163-201ENST00000354376 UNC93AQ86WB7 457 aa23.49■■□□□ 1.35
C9orf163-201ENST00000354376 ANKRD52Q8NB46 1076 aa23.49■■□□□ 1.35
C9orf163-201ENST00000354376 WNT8BQ93098 351 aa23.49■■□□□ 1.35
C9orf163-201ENST00000354376 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
C9orf163-201ENST00000354376 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
C9orf163-201ENST00000354376 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
C9orf163-201ENST00000354376 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
C9orf163-201ENST00000354376 C17orf102A2RUQ5 167 aa23.48■■□□□ 1.35
C9orf163-201ENST00000354376 PTGESO14684 152 aa23.48■■□□□ 1.35
C9orf163-201ENST00000354376 ELK3P41970 407 aa23.48■■□□□ 1.35
C9orf163-201ENST00000354376 BCAR1P56945 870 aa23.48■■□□□ 1.35
C9orf163-201ENST00000354376 LILRA4P59901 499 aa23.48■■□□□ 1.35
C9orf163-201ENST00000354376 GBE1Q04446 702 aa23.48■■□□□ 1.35
C9orf163-201ENST00000354376 BST2Q10589 180 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
C9orf163-201ENST00000354376 FAM228AQ86W67 206 aa23.48■■□□□ 1.35
C9orf163-201ENST00000354376 APPL2Q8NEU8 664 aa23.48■■□□□ 1.35
C9orf163-201ENST00000354376 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
C9orf163-201ENST00000354376 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
C9orf163-201ENST00000354376 SAMD15Q9P1V8 674 aa23.48■■□□□ 1.35
C9orf163-201ENST00000354376 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa23.48■■□□□ 1.35
C9orf163-201ENST00000354376 F5H423 210 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
C9orf163-201ENST00000354376 HGSO14964 777 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
C9orf163-201ENST00000354376 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
C9orf163-201ENST00000354376 NDUFV1P49821 464 aa23.48■■□□□ 1.35
C9orf163-201ENST00000354376 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
C9orf163-201ENST00000354376 BOLA3Q53S33 107 aa23.48■■□□□ 1.35
C9orf163-201ENST00000354376 CGB2Q6NT52 195 aa23.48■■□□□ 1.35
C9orf163-201ENST00000354376 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
C9orf163-201ENST00000354376 CCDC110Q8TBZ0 833 aa23.48■■□□□ 1.35
C9orf163-201ENST00000354376 USP6NLQ92738 828 aa23.48■■□□□ 1.35
C9orf163-201ENST00000354376 RAB6BQ9NRW1 208 aa23.48■■□□□ 1.35
C9orf163-201ENST00000354376 ABCF3Q9NUQ8 709 aa23.48■■□□□ 1.35
C9orf163-201ENST00000354376 ETNK2Q9NVF9 386 aa23.48■■□□□ 1.35
C9orf163-201ENST00000354376 COX16Q9P0S2 106 aa23.48■■□□□ 1.35
C9orf163-201ENST00000354376 APOL1O14791 398 aa23.47■■□□□ 1.35
C9orf163-201ENST00000354376 CLGNO14967 610 aa23.47■■□□□ 1.35
C9orf163-201ENST00000354376 SNX3O60493 162 aa23.47■■□□□ 1.35
C9orf163-201ENST00000354376 FSBPO95073 299 aa23.47■■□□□ 1.35
C9orf163-201ENST00000354376 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
C9orf163-201ENST00000354376 KIAA0319Q5VV43 1072 aa23.47■■□□□ 1.35
C9orf163-201ENST00000354376 SMYD5Q6GMV2 418 aa23.47■■□□□ 1.35
C9orf163-201ENST00000354376 FAM47EQ6ZV65 393 aa23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.4 ms