RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000342084.8

PTPRR-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene PTPRR, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-202ENST00000342084 ATP5HO75947 161 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 HAUS5O94927 633 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 C1QAP02745 245 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 VTNP04004 478 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 KITP10721 976 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 MYL2P10916 166 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 ETV4P43268 484 aa7.57□□□□□ -1.2
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PTPRR-202ENST00000342084 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
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PTPRR-202ENST00000342084 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
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PTPRR-202ENST00000342084 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 FGD4Q96M96 766 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 TRIM55Q9BYV6 548 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 SLC13A1Q9BZW2 595 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 FZD8Q9H461 694 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 RNPEPQ9H4A4 650 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
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PTPRR-202ENST00000342084 FAM49BQ9NUQ9 324 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
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PTPRR-202ENST00000342084 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa7.57□□□□□ -1.2
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PTPRR-202ENST00000342084 PPEF2O14830 753 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 KRT36O76013 467 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 APRTP07741 180 aa7.57□□□□□ -1.2
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PTPRR-202ENST00000342084 PDHA1P08559 390 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 CSH1P0DML2 217 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 CSH2P0DML3 217 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 CALB2P22676 271 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 IL4RP24394 825 aa7.57□□□□□ -1.2
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PTPRR-202ENST00000342084 SERPINB4P48594 390 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 IRX4P78413 519 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
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PTPRR-202ENST00000342084 CCDC14Q49A88 953 aa7.57□□□□□ -1.2
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PTPRR-202ENST00000342084 TMCO4Q5TGY1 634 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 MOB2Q70IA6 237 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 RIOX2Q8IUF8 465 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 UNC5BQ8IZJ1 945 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 PQLC3Q8N755 202 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 PLD5Q8N7P1 536 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 MAB21L3Q8N8X9 362 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP7.57□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 PCDH19Q8TAB3 1148 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 DTX3LQ8TDB6 740 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 FNIP1Q8TF40 1166 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 SKA1Q96BD8 255 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 HPDLQ96IR7 371 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 FAM167AQ96KS9 214 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 ACAP3Q96P50 834 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 RNF157Q96PX1 679 aa7.57□□□□□ -1.2
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PTPRR-202ENST00000342084 B3GNT5Q9BYG0 378 aa7.57□□□□□ -1.2
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PTPRR-202ENST00000342084 MIS12Q9H081 205 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 VPS11Q9H270 941 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 RSAD1Q9HA92 442 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 USP29Q9HBJ7 922 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 POPDC2Q9HBU9 364 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 TXNRD2Q9NNW7 524 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 ASNSD1Q9NWL6 643 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 EFR3BQ9Y2G0 817 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 KAT6AQ92794 2004 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 COPEO14579 308 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 PRPSAP2O60256 369 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 CNMDO75829 334 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 NEBLO76041 1014 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 METTL18O95568 372 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 DLDP09622 509 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
PTPRR-202ENST00000342084 DHRS4L1P0CG22 281 aa7.56□□□□□ -1.2
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