RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000337004.8

PTDSS1-201, Transcript of phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTDSS1, Length 2,366 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1-201ENST00000337004 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
PTDSS1-201ENST00000337004 KLC2Q9H0B6 622 aa22.36■■□□□ 1.17
PTDSS1-201ENST00000337004 MINDY3Q9H8M7 445 aa22.36■■□□□ 1.17
PTDSS1-201ENST00000337004 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
PTDSS1-201ENST00000337004 ZNF180Q9UJW8 692 aa22.36■■□□□ 1.17
PTDSS1-201ENST00000337004 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa22.36■■□□□ 1.17
PTDSS1-201ENST00000337004 TRIM49D1C9J1S8 452 aa22.36■■□□□ 1.17
PTDSS1-201ENST00000337004 H0Y3Z8 333 aa22.36■■□□□ 1.17
PTDSS1-201ENST00000337004 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
PTDSS1-201ENST00000337004 CLCN3P51790 818 aa22.36■■□□□ 1.17
PTDSS1-201ENST00000337004 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
PTDSS1-201ENST00000337004 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
PTDSS1-201ENST00000337004 CCDC62Q6P9F0 684 aa22.36■■□□□ 1.17
PTDSS1-201ENST00000337004 ILDR2Q71H61 639 aa22.36■■□□□ 1.17
PTDSS1-201ENST00000337004 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
PTDSS1-201ENST00000337004 TRIM42Q8IWZ5 723 aa22.36■■□□□ 1.17
PTDSS1-201ENST00000337004 PPM1NQ8N819 430 aa22.36■■□□□ 1.17
PTDSS1-201ENST00000337004 CFAP61Q8NHU2 1237 aa22.36■■□□□ 1.17
PTDSS1-201ENST00000337004 RTP4Q96DX8 246 aa22.36■■□□□ 1.17
PTDSS1-201ENST00000337004 HPDLQ96IR7 371 aa22.36■■□□□ 1.17
PTDSS1-201ENST00000337004 ASB7Q9H672 318 aa22.36■■□□□ 1.17
PTDSS1-201ENST00000337004 KIAA1257Q9ULG3 409 aa22.36■■□□□ 1.17
PTDSS1-201ENST00000337004 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
PTDSS1-201ENST00000337004 GSC2O15499 205 aa22.35■■□□□ 1.17
PTDSS1-201ENST00000337004 HBP1O60381 514 aa22.35■■□□□ 1.17
PTDSS1-201ENST00000337004 TGM2P21980 687 aa22.35■■□□□ 1.17
PTDSS1-201ENST00000337004 BCAR1P56945 870 aa22.35■■□□□ 1.17
PTDSS1-201ENST00000337004 CDO1Q16878 200 aa22.35■■□□□ 1.17
PTDSS1-201ENST00000337004 CXorf38Q8TB03 319 aa22.35■■□□□ 1.17
PTDSS1-201ENST00000337004 APBB2Q92870 758 aa22.35■■□□□ 1.17
PTDSS1-201ENST00000337004 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
PTDSS1-201ENST00000337004 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa22.35■■□□□ 1.17
PTDSS1-201ENST00000337004 APOL1O14791 398 aa22.35■■□□□ 1.17
PTDSS1-201ENST00000337004 FAM155BO75949 473 aa22.35■■□□□ 1.17
PTDSS1-201ENST00000337004 ZBED1O96006 694 aa22.35■■□□□ 1.17
PTDSS1-201ENST00000337004 MCF2P10911 925 aa22.35■■□□□ 1.17
PTDSS1-201ENST00000337004 OSBPP22059 807 aa22.35■■□□□ 1.17
PTDSS1-201ENST00000337004 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
PTDSS1-201ENST00000337004 BLMHQ13867 455 aa22.35■■□□□ 1.17
PTDSS1-201ENST00000337004 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa22.35■■□□□ 1.17
PTDSS1-201ENST00000337004 NFKBIZQ9BYH8 718 aa22.35■■□□□ 1.17
PTDSS1-201ENST00000337004 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
PTDSS1-201ENST00000337004 GGA3Q9NZ52 723 aa22.35■■□□□ 1.17
PTDSS1-201ENST00000337004 TTLL3Q9Y4R7 772 aa22.35■■□□□ 1.17
PTDSS1-201ENST00000337004 E5RJQ4 531 aa22.34■■□□□ 1.17
PTDSS1-201ENST00000337004 IQCF3P0C7M6 154 aa22.34■■□□□ 1.17
PTDSS1-201ENST00000337004 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
PTDSS1-201ENST00000337004 TRNP1Q6NT89 227 aa22.34■■□□□ 1.17
PTDSS1-201ENST00000337004 SCYL2Q6P3W7 929 aa22.34■■□□□ 1.17
PTDSS1-201ENST00000337004 LCLAT1Q6UWP7 414 aa22.34■■□□□ 1.17
PTDSS1-201ENST00000337004 VPS52Q8N1B4 723 aa22.34■■□□□ 1.17
PTDSS1-201ENST00000337004 TMEM130Q8N3G9 435 aa22.34■■□□□ 1.17
PTDSS1-201ENST00000337004 MCUR1Q96AQ8 359 aa22.34■■□□□ 1.17
PTDSS1-201ENST00000337004 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
PTDSS1-201ENST00000337004 HEY1Q9Y5J3 304 aa22.34■■□□□ 1.17
PTDSS1-201ENST00000337004 I3L4J1 428 aa22.34■■□□□ 1.17
PTDSS1-201ENST00000337004 PIK3R2O00459 728 aa22.34■■□□□ 1.17
PTDSS1-201ENST00000337004 MYL2P10916 166 aa22.34■■□□□ 1.17
PTDSS1-201ENST00000337004 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
PTDSS1-201ENST00000337004 RBL1P28749 1068 aa22.34■■□□□ 1.17
PTDSS1-201ENST00000337004 NDST1P52848 882 aa22.34■■□□□ 1.17
PTDSS1-201ENST00000337004 RAB6CQ53S08 254 aa22.34■■□□□ 1.17
PTDSS1-201ENST00000337004 TTC39CQ8N584 583 aa22.34■■□□□ 1.17
PTDSS1-201ENST00000337004 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
PTDSS1-201ENST00000337004 RAB6CQ9H0N0 254 aa22.34■■□□□ 1.17
PTDSS1-201ENST00000337004 STOML1Q9UBI4 398 aa22.34■■□□□ 1.17
PTDSS1-201ENST00000337004 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
PTDSS1-201ENST00000337004 GRAP2O75791 330 aa22.33■■□□□ 1.17
PTDSS1-201ENST00000337004 IL4RP24394 825 aa22.33■■□□□ 1.17
PTDSS1-201ENST00000337004 PRKCHP24723 683 aa22.33■■□□□ 1.17
PTDSS1-201ENST00000337004 PHKA2P46019 1235 aa22.33■■□□□ 1.17
PTDSS1-201ENST00000337004 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa22.33■■□□□ 1.17
PTDSS1-201ENST00000337004 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
PTDSS1-201ENST00000337004 CMPK2Q5EBM0 449 aa22.33■■□□□ 1.17
PTDSS1-201ENST00000337004 TRIM68Q6AZZ1 485 aa22.33■■□□□ 1.17
PTDSS1-201ENST00000337004 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa22.33■■□□□ 1.17
PTDSS1-201ENST00000337004 LRRC39Q96DD0 335 aa22.33■■□□□ 1.17
PTDSS1-201ENST00000337004 POPDC2Q9HBU9 364 aa22.33■■□□□ 1.17
PTDSS1-201ENST00000337004 ETNK2Q9NVF9 386 aa22.33■■□□□ 1.17
PTDSS1-201ENST00000337004 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP22.33■■□□□ 1.17
PTDSS1-201ENST00000337004 TSPAN16Q9UKR8 245 aa22.33■■□□□ 1.17
PTDSS1-201ENST00000337004 PLLPQ9Y342 182 aa22.33■■□□□ 1.17
PTDSS1-201ENST00000337004 LOC285556D6RIA3 1793 aa22.33■■□□□ 1.16
PTDSS1-201ENST00000337004 C1QAP02745 245 aa22.33■■□□□ 1.16
PTDSS1-201ENST00000337004 APRTP07741 180 aa22.33■■□□□ 1.16
PTDSS1-201ENST00000337004 GSTA2P09210 222 aa22.33■■□□□ 1.16
PTDSS1-201ENST00000337004 DESP17661 470 aa22.33■■□□□ 1.16
PTDSS1-201ENST00000337004 PAX7P23759 505 aa22.33■■□□□ 1.16
PTDSS1-201ENST00000337004 CDC25CP30307 473 aa22.33■■□□□ 1.16
PTDSS1-201ENST00000337004 INCA1Q0VD86 236 aa22.33■■□□□ 1.16
PTDSS1-201ENST00000337004 CCDC14Q49A88 953 aa22.33■■□□□ 1.16
PTDSS1-201ENST00000337004 ATG16L1Q676U5 607 aa22.33■■□□□ 1.16
PTDSS1-201ENST00000337004 RFWD3Q6PCD5 774 aa22.33■■□□□ 1.16
PTDSS1-201ENST00000337004 TRPM4Q8TD43 1214 aa22.33■■□□□ 1.16
PTDSS1-201ENST00000337004 TEKT4Q8WW24 435 aa22.33■■□□□ 1.16
PTDSS1-201ENST00000337004 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.16
PTDSS1-201ENST00000337004 USP2O75604 605 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
PTDSS1-201ENST00000337004 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP22.32■■□□□ 1.16
PTDSS1-201ENST00000337004 ATP6V1C1P21283 382 aa22.32■■□□□ 1.16
PTDSS1-201ENST00000337004 MAGEA6P43360 314 aa22.32■■□□□ 1.16
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