RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000321358.11

YBX1-201, Transcript of Y-box binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene YBX1, Length 1,514 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YBX1-201ENST00000321358 PARVAQ9NVD7 372 aa22.2■■□□□ 1.14
YBX1-201ENST00000321358 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa22.2■■□□□ 1.14
YBX1-201ENST00000321358 GMIPQ9P107 970 aa22.2■■□□□ 1.14
YBX1-201ENST00000321358 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
YBX1-201ENST00000321358 NENFQ9UMX5 172 aa22.2■■□□□ 1.14
YBX1-201ENST00000321358 SCINQ9Y6U3 715 aa22.2■■□□□ 1.14
YBX1-201ENST00000321358 RALAP11233 206 aa22.19■■□□□ 1.14
YBX1-201ENST00000321358 RRM1P23921 792 aa22.19■■□□□ 1.14
YBX1-201ENST00000321358 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP22.19■■□□□ 1.14
YBX1-201ENST00000321358 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
YBX1-201ENST00000321358 BTBD8Q5XKL5 378 aa22.19■■□□□ 1.14
YBX1-201ENST00000321358 OLFML1Q6UWY5 402 aa22.19■■□□□ 1.14
YBX1-201ENST00000321358 KIAA1328Q86T90 577 aa22.19■■□□□ 1.14
YBX1-201ENST00000321358 DNAAF5Q86Y56 855 aa22.19■■□□□ 1.14
YBX1-201ENST00000321358 C3orf20Q8ND61 904 aa22.19■■□□□ 1.14
YBX1-201ENST00000321358 CLEC4CQ8WTT0 213 aa22.19■■□□□ 1.14
YBX1-201ENST00000321358 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
YBX1-201ENST00000321358 MCRS1Q96EZ8 462 aa22.19■■□□□ 1.14
YBX1-201ENST00000321358 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
YBX1-201ENST00000321358 ATXN3LQ9H3M9 355 aa22.19■■□□□ 1.14
YBX1-201ENST00000321358 MYO1AQ9UBC5 1043 aa22.19■■□□□ 1.14
YBX1-201ENST00000321358 YJEFN3A6XGL0 299 aa22.18■■□□□ 1.14
YBX1-201ENST00000321358 E7ENQ6 273 aa22.18■■□□□ 1.14
YBX1-201ENST00000321358 CAPN9O14815 690 aa22.18■■□□□ 1.14
YBX1-201ENST00000321358 ZNF263O14978 683 aa22.18■■□□□ 1.14
YBX1-201ENST00000321358 HSF2BPO75031 334 aa22.18■■□□□ 1.14
YBX1-201ENST00000321358 LTFP02788 710 aa22.18■■□□□ 1.14
YBX1-201ENST00000321358 TMEM253P0C7T8 217 aa22.18■■□□□ 1.14
YBX1-201ENST00000321358 KRT3P12035 628 aa22.18■■□□□ 1.14
YBX1-201ENST00000321358 EPHA5P54756 1037 aa22.18■■□□□ 1.14
YBX1-201ENST00000321358 GSCP56915 257 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
YBX1-201ENST00000321358 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
YBX1-201ENST00000321358 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
YBX1-201ENST00000321358 DCUN1D2Q6PH85 259 aa22.18■■□□□ 1.14
YBX1-201ENST00000321358 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa22.18■■□□□ 1.14
YBX1-201ENST00000321358 TADA2BQ86TJ2 420 aa22.18■■□□□ 1.14
YBX1-201ENST00000321358 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
YBX1-201ENST00000321358 HLA-CQ95604 372 aa22.18■■□□□ 1.14
YBX1-201ENST00000321358 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
YBX1-201ENST00000321358 THAP2Q9H0W7 228 aa22.18■■□□□ 1.14
YBX1-201ENST00000321358 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
YBX1-201ENST00000321358 ABCC13Q9NSE7 274 aa22.18■■□□□ 1.14
YBX1-201ENST00000321358 ASNSD1Q9NWL6 643 aa22.18■■□□□ 1.14
YBX1-201ENST00000321358 CD207Q9UJ71 328 aa22.18■■□□□ 1.14
YBX1-201ENST00000321358 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
YBX1-201ENST00000321358 NCANO14594 1321 aa22.18■■□□□ 1.14
YBX1-201ENST00000321358 A0A1W2PQH9 124 aa22.17■■□□□ 1.14
YBX1-201ENST00000321358 LTBRP36941 435 aa22.17■■□□□ 1.14
YBX1-201ENST00000321358 MTHFRP42898 656 aa22.17■■□□□ 1.14
YBX1-201ENST00000321358 PLXNA3P51805 1871 aa22.17■■□□□ 1.14
YBX1-201ENST00000321358 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa22.17■■□□□ 1.14
YBX1-201ENST00000321358 BSPRYQ5W0U4 402 aa22.17■■□□□ 1.14
YBX1-201ENST00000321358 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
YBX1-201ENST00000321358 SLC26A9Q7LBE3 791 aa22.17■■□□□ 1.14
YBX1-201ENST00000321358 TMC8Q8IU68 726 aa22.17■■□□□ 1.14
YBX1-201ENST00000321358 ACRBPQ8NEB7 543 aa22.17■■□□□ 1.14
YBX1-201ENST00000321358 RNF139Q8WU17 664 aa22.17■■□□□ 1.14
YBX1-201ENST00000321358 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
YBX1-201ENST00000321358 LRRC3Q9BY71 257 aa22.17■■□□□ 1.14
YBX1-201ENST00000321358 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
YBX1-201ENST00000321358 POPDC2Q9HBU9 364 aa22.17■■□□□ 1.14
YBX1-201ENST00000321358 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
YBX1-201ENST00000321358 CLIC5Q9NZA1 410 aa22.17■■□□□ 1.14
YBX1-201ENST00000321358 ZNF840PA6NDX5 716 aa22.16■■□□□ 1.14
YBX1-201ENST00000321358 F11P03951 625 aa22.16■■□□□ 1.14
YBX1-201ENST00000321358 CCDC175P0C221 793 aa22.16■■□□□ 1.14
YBX1-201ENST00000321358 DESP17661 470 aa22.16■■□□□ 1.14
YBX1-201ENST00000321358 KCNA5P22460 613 aa22.16■■□□□ 1.14
YBX1-201ENST00000321358 MSLNLQ96KJ4 702 aa22.16■■□□□ 1.14
YBX1-201ENST00000321358 DESI2Q9BSY9 194 aa22.16■■□□□ 1.14
YBX1-201ENST00000321358 PACSIN1Q9BY11 444 aa22.16■■□□□ 1.14
YBX1-201ENST00000321358 NACA2Q9H009 215 aa22.16■■□□□ 1.14
YBX1-201ENST00000321358 S1PR5Q9H228 398 aa22.16■■□□□ 1.14
YBX1-201ENST00000321358 PTPRDP23468 1912 aa22.16■■□□□ 1.14
YBX1-201ENST00000321358 A0A1W2PRU2 124 aa22.16■■□□□ 1.14
YBX1-201ENST00000321358 SIGLEC16A6NMB1 481 aa22.16■■□□□ 1.14
YBX1-201ENST00000321358 GRAP2O75791 330 aa22.16■■□□□ 1.14
YBX1-201ENST00000321358 NTHL1P78549 312 aa22.16■■□□□ 1.14
YBX1-201ENST00000321358 CLUL1Q15846 466 aa22.16■■□□□ 1.14
YBX1-201ENST00000321358 HECTD3Q5T447 861 aa22.16■■□□□ 1.14
YBX1-201ENST00000321358 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa22.16■■□□□ 1.14
YBX1-201ENST00000321358 GAREM2Q75VX8 874 aa22.16■■□□□ 1.14
YBX1-201ENST00000321358 NECTIN4Q96NY8 510 aa22.16■■□□□ 1.14
YBX1-201ENST00000321358 KCNF1Q9H3M0 494 aa22.16■■□□□ 1.14
YBX1-201ENST00000321358 IL21Q9HBE4 155 aa22.16■■□□□ 1.14
YBX1-201ENST00000321358 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
YBX1-201ENST00000321358 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa22.16■■□□□ 1.14
YBX1-201ENST00000321358 ZMYM5Q9UJ78 669 aa22.16■■□□□ 1.14
YBX1-201ENST00000321358 COG5Q9UP83 839 aa22.16■■□□□ 1.14
YBX1-201ENST00000321358 H3BQ06 376 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
YBX1-201ENST00000321358 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
YBX1-201ENST00000321358 CYP1A2P05177 515 aa22.15■■□□□ 1.14
YBX1-201ENST00000321358 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa22.15■■□□□ 1.14
YBX1-201ENST00000321358 NCAM1P13591 858 aa22.15■■□□□ 1.14
YBX1-201ENST00000321358 FSHRP23945 695 aa22.15■■□□□ 1.14
YBX1-201ENST00000321358 VAV2P52735 878 aa22.15■■□□□ 1.14
YBX1-201ENST00000321358 KIF5AQ12840 1032 aa22.15■■□□□ 1.14
YBX1-201ENST00000321358 MAMLD1Q13495 774 aa22.15■■□□□ 1.14
YBX1-201ENST00000321358 SNX30Q5VWJ9 437 aa22.15■■□□□ 1.14
YBX1-201ENST00000321358 BEND5Q7L4P6 421 aa22.15■■□□□ 1.14
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