RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320031.12

ITGA3-202, Transcript of integrin subunit alpha 3, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene ITGA3, Length 4,888 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3-202ENST00000320031 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP17.09■□□□□ 0.33
ITGA3-202ENST00000320031 ZNF263O14978 683 aa17.09■□□□□ 0.33
ITGA3-202ENST00000320031 NDUFS3O75489 264 aa17.09■□□□□ 0.33
ITGA3-202ENST00000320031 NFICP08651 508 aa17.09■□□□□ 0.33
ITGA3-202ENST00000320031 GHRP10912 638 aa17.09■□□□□ 0.33
ITGA3-202ENST00000320031 MAMLD1Q13495 774 aa17.09■□□□□ 0.33
ITGA3-202ENST00000320031 SMARCD1Q96GM5 515 aa17.09■□□□□ 0.33
ITGA3-202ENST00000320031 WNK4Q96J92 1243 aa17.09■□□□□ 0.33
ITGA3-202ENST00000320031 MANSC1Q9H8J5 431 aa17.09■□□□□ 0.33
ITGA3-202ENST00000320031 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa17.09■□□□□ 0.33
ITGA3-202ENST00000320031 A0A0B4J269 797 aa17.09■□□□□ 0.33
ITGA3-202ENST00000320031 GNGT2O14610 69 aa17.09■□□□□ 0.33
ITGA3-202ENST00000320031 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa17.09■□□□□ 0.33
ITGA3-202ENST00000320031 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa17.09■□□□□ 0.33
ITGA3-202ENST00000320031 GFAPP14136 432 aa17.09■□□□□ 0.33
ITGA3-202ENST00000320031 ADIGQ0VDE8 80 aa17.09■□□□□ 0.33
ITGA3-202ENST00000320031 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP17.09■□□□□ 0.33
ITGA3-202ENST00000320031 MROH9Q5TGP6 573 aa17.09■□□□□ 0.33
ITGA3-202ENST00000320031 SLC2A14Q8TDB8 520 aa17.09■□□□□ 0.33
ITGA3-202ENST00000320031 SMYD3Q9H7B4 428 aa17.09■□□□□ 0.33
ITGA3-202ENST00000320031 FAM8A1Q9UBU6 413 aa17.09■□□□□ 0.33
ITGA3-202ENST00000320031 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa17.09■□□□□ 0.33
ITGA3-202ENST00000320031 COL1A2P08123 1366 aa17.09■□□□□ 0.33
ITGA3-202ENST00000320031 MYL2P10916 166 aa17.08■□□□□ 0.33
ITGA3-202ENST00000320031 TNFRSF8P28908 595 aa17.08■□□□□ 0.33
ITGA3-202ENST00000320031 E2F7Q96AV8 911 aa17.08■□□□□ 0.33
ITGA3-202ENST00000320031 GPR20Q99678 358 aa17.08■□□□□ 0.33
ITGA3-202ENST00000320031 LRRC40Q9H9A6 602 aa17.08■□□□□ 0.33
ITGA3-202ENST00000320031 ACP6Q9NPH0 428 aa17.08■□□□□ 0.33
ITGA3-202ENST00000320031 OPLAHO14841 1288 aa17.08■□□□□ 0.32
ITGA3-202ENST00000320031 TLR2O60603 784 aa17.08■□□□□ 0.32
ITGA3-202ENST00000320031 MIPP30301 263 aa17.08■□□□□ 0.32
ITGA3-202ENST00000320031 SLC25A41Q8N5S1 370 aa17.08■□□□□ 0.32
ITGA3-202ENST00000320031 OR5B17Q8NGF7 314 aa17.08■□□□□ 0.32
ITGA3-202ENST00000320031 PPTC7Q8NI37 304 aa17.08■□□□□ 0.32
ITGA3-202ENST00000320031 GIPC2Q8TF65 315 aa17.08■□□□□ 0.32
ITGA3-202ENST00000320031 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP17.08■□□□□ 0.32
ITGA3-202ENST00000320031 MRGBPQ9NV56 204 aa17.08■□□□□ 0.32
ITGA3-202ENST00000320031 POMCP01189 267 aa17.08■□□□□ 0.32
ITGA3-202ENST00000320031 SERPINB4P48594 390 aa17.08■□□□□ 0.32
ITGA3-202ENST00000320031 NR2C2P49116 596 aa17.08■□□□□ 0.32
ITGA3-202ENST00000320031 BEX3Q00994 111 aa17.08■□□□□ 0.32
ITGA3-202ENST00000320031 CRYMQ14894 314 aa17.08■□□□□ 0.32
ITGA3-202ENST00000320031 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP17.08■□□□□ 0.32
ITGA3-202ENST00000320031 CYB5D1Q6P9G0 228 aa17.08■□□□□ 0.32
ITGA3-202ENST00000320031 KCNV2Q8TDN2 545 aa17.08■□□□□ 0.32
ITGA3-202ENST00000320031 E5RJQ4 531 aa17.08■□□□□ 0.32
ITGA3-202ENST00000320031 RIPK2O43353 540 aa17.08■□□□□ 0.32
ITGA3-202ENST00000320031 TRPA1O75762 1119 aa17.08■□□□□ 0.32
ITGA3-202ENST00000320031 ASS1P00966 412 aaKnown RBP17.08■□□□□ 0.32
ITGA3-202ENST00000320031 TNFSF9P41273 254 aa17.08■□□□□ 0.32
ITGA3-202ENST00000320031 FAM161BQ96MY7 647 aa17.08■□□□□ 0.32
ITGA3-202ENST00000320031 LAMB4A4D0S4 1761 aa17.07■□□□□ 0.32
ITGA3-202ENST00000320031 CABYRO75952 493 aa17.07■□□□□ 0.32
ITGA3-202ENST00000320031 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP17.07■□□□□ 0.32
ITGA3-202ENST00000320031 IMPG1Q17R60 797 aa17.07■□□□□ 0.32
ITGA3-202ENST00000320031 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa17.07■□□□□ 0.32
ITGA3-202ENST00000320031 F5H5T6 163 aa17.07■□□□□ 0.32
ITGA3-202ENST00000320031 H0Y3Z8 333 aa17.07■□□□□ 0.32
ITGA3-202ENST00000320031 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa17.07■□□□□ 0.32
ITGA3-202ENST00000320031 APOC2P02655 101 aa17.07■□□□□ 0.32
ITGA3-202ENST00000320031 APOA4P06727 396 aa17.07■□□□□ 0.32
ITGA3-202ENST00000320031 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP17.07■□□□□ 0.32
ITGA3-202ENST00000320031 DENND1BQ6P3S1 775 aa17.07■□□□□ 0.32
ITGA3-202ENST00000320031 SCUBE3Q8IX30 993 aa17.07■□□□□ 0.32
ITGA3-202ENST00000320031 HASPINQ8TF76 798 aa17.07■□□□□ 0.32
ITGA3-202ENST00000320031 HES6Q96HZ4 224 aa17.07■□□□□ 0.32
ITGA3-202ENST00000320031 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa17.07■□□□□ 0.32
ITGA3-202ENST00000320031 L3MBTL1Q9Y468 752 aa17.07■□□□□ 0.32
ITGA3-202ENST00000320031 NUP188Q5SRE5 1749 aa17.07■□□□□ 0.32
ITGA3-202ENST00000320031 CCT8L1PA6NM43 557 aa17.07■□□□□ 0.32
ITGA3-202ENST00000320031 PMPCBO75439 489 aa17.07■□□□□ 0.32
ITGA3-202ENST00000320031 ALDH2P05091 517 aa17.07■□□□□ 0.32
ITGA3-202ENST00000320031 AMPD2Q01433 879 aa17.07■□□□□ 0.32
ITGA3-202ENST00000320031 SLC26A11Q86WA9 606 aa17.07■□□□□ 0.32
ITGA3-202ENST00000320031 MIB1Q86YT6 1006 aa17.07■□□□□ 0.32
ITGA3-202ENST00000320031 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP17.07■□□□□ 0.32
ITGA3-202ENST00000320031 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa17.07■□□□□ 0.32
ITGA3-202ENST00000320031 PAFAH2Q99487 392 aa17.07■□□□□ 0.32
ITGA3-202ENST00000320031 BRD8Q9H0E9 1235 aa17.07■□□□□ 0.32
ITGA3-202ENST00000320031 F8VP50 259 aa17.07■□□□□ 0.32
ITGA3-202ENST00000320031 PYGLP06737 847 aa17.07■□□□□ 0.32
ITGA3-202ENST00000320031 PDHA1P08559 390 aa17.07■□□□□ 0.32
ITGA3-202ENST00000320031 IRF1P10914 325 aa17.07■□□□□ 0.32
ITGA3-202ENST00000320031 CNTFP26441 200 aa17.07■□□□□ 0.32
ITGA3-202ENST00000320031 RABGAP1LQ5R372 815 aa17.07■□□□□ 0.32
ITGA3-202ENST00000320031 HIPK4Q8NE63 616 aa17.07■□□□□ 0.32
ITGA3-202ENST00000320031 APBB2Q92870 758 aa17.07■□□□□ 0.32
ITGA3-202ENST00000320031 ELOVL4Q9GZR5 314 aa17.07■□□□□ 0.32
ITGA3-202ENST00000320031 FBXO44Q9H4M3 255 aa17.07■□□□□ 0.32
ITGA3-202ENST00000320031 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP17.07■□□□□ 0.32
ITGA3-202ENST00000320031 ABCF3Q9NUQ8 709 aa17.07■□□□□ 0.32
ITGA3-202ENST00000320031 HACD3Q9P035 362 aa17.07■□□□□ 0.32
ITGA3-202ENST00000320031 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP17.07■□□□□ 0.32
ITGA3-202ENST00000320031 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP17.06■□□□□ 0.32
ITGA3-202ENST00000320031 NOMO3P69849 1222 aa17.06■□□□□ 0.32
ITGA3-202ENST00000320031 HSDL1Q3SXM5 330 aa17.06■□□□□ 0.32
ITGA3-202ENST00000320031 DUSP28Q4G0W2 176 aa17.06■□□□□ 0.32
ITGA3-202ENST00000320031 APBA2Q99767 749 aa17.06■□□□□ 0.32
ITGA3-202ENST00000320031 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.2 ms