RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317243.9

ZNF554-201, Transcript of zinc finger protein 554, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZNF554, Length 2,736 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF554-201ENST00000317243 TGFB3P10600 412 aa20.22■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 CETN2P41208 172 aa20.22■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 IREB2P48200 963 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 MBTD1Q05BQ5 628 aa20.22■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 RELL1Q8IUW5 271 aa20.22■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 C1orf127Q8N9H9 656 aa20.22■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 SLITRK1Q96PX8 696 aa20.22■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 TAS2R1Q9NYW7 299 aa20.22■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 PHF24Q9UPV7 400 aa20.22■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 PSTPIP1O43586 416 aa20.22■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 LIASO43766 372 aa20.22■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 IL1R2P27930 398 aa20.22■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 MPZL3Q6UWV2 235 aa20.22■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 ERO1BQ86YB8 467 aa20.22■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 TRIM11Q96F44 468 aa20.22■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 IFT122Q9HBG6 1241 aa20.22■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa20.22■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 ZWINTO95229 277 aa20.21■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 ITGB3P05106 788 aa20.21■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 INSRRP14616 1297 aa20.21■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 EFNA5P52803 228 aa20.21■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 MYBPC3Q14896 1274 aa20.21■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 JADE1Q6IE81 842 aa20.21■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 IZUMO2Q6UXV1 221 aa20.21■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP20.21■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 KATNAL2Q8IYT4 538 aa20.21■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 NSL1Q96IY1 281 aa20.21■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 CPXM1Q96SM3 734 aa20.21■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 TMEM121Q9BTD3 319 aa20.21■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 ZNF408Q9H9D4 720 aa20.21■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 GALNT8Q9NY28 637 aa20.21■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 ATXN10Q9UBB4 475 aa20.21■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa20.21■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 LACTBL1A8MY62 500 aa20.21■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 CCNFP41002 786 aa20.21■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 SYCP2LQ5T4T6 812 aa20.21■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 EXD1Q8NHP7 514 aa20.21■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 ZNF212Q9UDV6 495 aa20.21■□□□□ 0.83
ZNF554-201ENST00000317243 TRIP11Q15643 1979 aa20.2■□□□□ 0.82
ZNF554-201ENST00000317243 SGK1O00141 431 aa20.2■□□□□ 0.82
ZNF554-201ENST00000317243 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
ZNF554-201ENST00000317243 PROZP22891 400 aa20.2■□□□□ 0.82
ZNF554-201ENST00000317243 SSTR1P30872 391 aa20.2■□□□□ 0.82
ZNF554-201ENST00000317243 CPA2P48052 419 aa20.2■□□□□ 0.82
ZNF554-201ENST00000317243 TMEM62Q0P6H9 643 aa20.2■□□□□ 0.82
ZNF554-201ENST00000317243 LIN52Q52LA3 116 aa20.2■□□□□ 0.82
ZNF554-201ENST00000317243 SPDYAQ5MJ70 313 aa20.2■□□□□ 0.82
ZNF554-201ENST00000317243 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa20.2■□□□□ 0.82
ZNF554-201ENST00000317243 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
ZNF554-201ENST00000317243 PCSK1NQ9UHG2 260 aa20.2■□□□□ 0.82
ZNF554-201ENST00000317243 GINS2Q9Y248 185 aa20.2■□□□□ 0.82
ZNF554-201ENST00000317243 C2orf71A6NGG8 1288 aa20.2■□□□□ 0.82
ZNF554-201ENST00000317243 TYROBPO43914 113 aa20.2■□□□□ 0.82
ZNF554-201ENST00000317243 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP20.2■□□□□ 0.82
ZNF554-201ENST00000317243 SERPINB3P29508 390 aa20.2■□□□□ 0.82
ZNF554-201ENST00000317243 ZBTB16Q05516 673 aa20.2■□□□□ 0.82
ZNF554-201ENST00000317243 ENPEPQ07075 957 aa20.2■□□□□ 0.82
ZNF554-201ENST00000317243 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
ZNF554-201ENST00000317243 TRIM72Q6ZMU5 477 aa20.2■□□□□ 0.82
ZNF554-201ENST00000317243 LRRN4Q8WUT4 740 aa20.2■□□□□ 0.82
ZNF554-201ENST00000317243 TTC25Q96NG3 672 aa20.2■□□□□ 0.82
ZNF554-201ENST00000317243 FZD8Q9H461 694 aa20.2■□□□□ 0.82
ZNF554-201ENST00000317243 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
ZNF554-201ENST00000317243 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
ZNF554-201ENST00000317243 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
ZNF554-201ENST00000317243 ACKR2O00590 384 aa20.19■□□□□ 0.82
ZNF554-201ENST00000317243 TFDP1Q14186 410 aa20.19■□□□□ 0.82
ZNF554-201ENST00000317243 GSTA3Q16772 222 aa20.19■□□□□ 0.82
ZNF554-201ENST00000317243 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa20.19■□□□□ 0.82
ZNF554-201ENST00000317243 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa20.19■□□□□ 0.82
ZNF554-201ENST00000317243 ARHGAP18Q8N392 663 aa20.19■□□□□ 0.82
ZNF554-201ENST00000317243 UBA3Q8TBC4 463 aa20.19■□□□□ 0.82
ZNF554-201ENST00000317243 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
ZNF554-201ENST00000317243 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
ZNF554-201ENST00000317243 SCINQ9Y6U3 715 aa20.19■□□□□ 0.82
ZNF554-201ENST00000317243 ADCYAP1R1P41586 468 aa20.19■□□□□ 0.82
ZNF554-201ENST00000317243 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
ZNF554-201ENST00000317243 ARMCX2Q7L311 632 aa20.19■□□□□ 0.82
ZNF554-201ENST00000317243 TTC7BQ86TV6 843 aa20.19■□□□□ 0.82
ZNF554-201ENST00000317243 NCSTNQ92542 709 aa20.19■□□□□ 0.82
ZNF554-201ENST00000317243 IP6K2Q9UHH9 426 aa20.19■□□□□ 0.82
ZNF554-201ENST00000317243 C22orf31O95567 290 aa20.18■□□□□ 0.82
ZNF554-201ENST00000317243 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP20.18■□□□□ 0.82
ZNF554-201ENST00000317243 INHBCP55103 352 aa20.18■□□□□ 0.82
ZNF554-201ENST00000317243 GDF10P55107 478 aa20.18■□□□□ 0.82
ZNF554-201ENST00000317243 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa20.18■□□□□ 0.82
ZNF554-201ENST00000317243 CENPUQ71F23 418 aa20.18■□□□□ 0.82
ZNF554-201ENST00000317243 ELOVL4Q9GZR5 314 aa20.18■□□□□ 0.82
ZNF554-201ENST00000317243 AKT3Q9Y243 479 aa20.18■□□□□ 0.82
ZNF554-201ENST00000317243 HTTP42858 3142 aa20.18■□□□□ 0.82
ZNF554-201ENST00000317243 GRAP2O75791 330 aa20.18■□□□□ 0.82
ZNF554-201ENST00000317243 ERBB2P04626 1255 aa20.18■□□□□ 0.82
ZNF554-201ENST00000317243 STAG3L1P0CL83 205 aa20.18■□□□□ 0.82
ZNF554-201ENST00000317243 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.5 ms