RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311008.15

SPNS1-201, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS1, Length 2,208 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-201ENST00000311008 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
SPNS1-201ENST00000311008 LRRC52Q8N7C0 313 aa20.37■□□□□ 0.85
SPNS1-201ENST00000311008 KLC2Q9H0B6 622 aa20.37■□□□□ 0.85
SPNS1-201ENST00000311008 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa20.37■□□□□ 0.85
SPNS1-201ENST00000311008 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP20.37■□□□□ 0.85
SPNS1-201ENST00000311008 ADORA2AP29274 412 aa20.37■□□□□ 0.85
SPNS1-201ENST00000311008 MAGEA6P43360 314 aa20.37■□□□□ 0.85
SPNS1-201ENST00000311008 PMF1Q6P1K2 205 aa20.37■□□□□ 0.85
SPNS1-201ENST00000311008 SCYL2Q6P3W7 929 aa20.37■□□□□ 0.85
SPNS1-201ENST00000311008 C1orf228Q6PIY5 440 aa20.37■□□□□ 0.85
SPNS1-201ENST00000311008 C12orf29Q8N999 325 aa20.37■□□□□ 0.85
SPNS1-201ENST00000311008 TCP10LQ8TDR4 215 aa20.37■□□□□ 0.85
SPNS1-201ENST00000311008 FAM172AQ8WUF8 416 aa20.37■□□□□ 0.85
SPNS1-201ENST00000311008 SLC35F5Q8WV83 523 aa20.37■□□□□ 0.85
SPNS1-201ENST00000311008 SPOCK2Q92563 424 aa20.37■□□□□ 0.85
SPNS1-201ENST00000311008 PCDH18Q9HCL0 1135 aa20.37■□□□□ 0.85
SPNS1-201ENST00000311008 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
SPNS1-201ENST00000311008 RAB6BQ9NRW1 208 aa20.37■□□□□ 0.85
SPNS1-201ENST00000311008 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
SPNS1-201ENST00000311008 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa20.36■□□□□ 0.85
SPNS1-201ENST00000311008 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa20.36■□□□□ 0.85
SPNS1-201ENST00000311008 KCNN4O15554 427 aa20.36■□□□□ 0.85
SPNS1-201ENST00000311008 ZBED1O96006 694 aa20.36■□□□□ 0.85
SPNS1-201ENST00000311008 GSTA2P09210 222 aa20.36■□□□□ 0.85
SPNS1-201ENST00000311008 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
SPNS1-201ENST00000311008 IL4RP24394 825 aa20.36■□□□□ 0.85
SPNS1-201ENST00000311008 ATP11AP98196 1134 aa20.36■□□□□ 0.85
SPNS1-201ENST00000311008 PTK7Q13308 1070 aa20.36■□□□□ 0.85
SPNS1-201ENST00000311008 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP20.36■□□□□ 0.854e-7■■■■■ 29.2
SPNS1-201ENST00000311008 BEST2Q8NFU1 509 aa20.36■□□□□ 0.85
SPNS1-201ENST00000311008 APBB2Q92870 758 aa20.36■□□□□ 0.85
SPNS1-201ENST00000311008 LRRC39Q96DD0 335 aa20.36■□□□□ 0.85
SPNS1-201ENST00000311008 DNAI2Q9GZS0 605 aa20.36■□□□□ 0.85
SPNS1-201ENST00000311008 MYLK2Q9H1R3 596 aa20.36■□□□□ 0.85
SPNS1-201ENST00000311008 CYLDQ9NQC7 956 aa20.36■□□□□ 0.85
SPNS1-201ENST00000311008 RNF181Q9P0P0 153 aa20.36■□□□□ 0.85
SPNS1-201ENST00000311008 KBTBD13C9JR72 458 aa20.35■□□□□ 0.85
SPNS1-201ENST00000311008 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
SPNS1-201ENST00000311008 GRAP2O75791 330 aa20.35■□□□□ 0.85
SPNS1-201ENST00000311008 SCNN1AP37088 669 aa20.35■□□□□ 0.85
SPNS1-201ENST00000311008 RGS7P49802 495 aa20.35■□□□□ 0.85
SPNS1-201ENST00000311008 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP20.35■□□□□ 0.85
SPNS1-201ENST00000311008 ARHGAP17Q68EM7 881 aa20.35■□□□□ 0.85
SPNS1-201ENST00000311008 ARCQ7LC44 396 aa20.35■□□□□ 0.85
SPNS1-201ENST00000311008 OTOAQ7RTW8 1153 aa20.35■□□□□ 0.85
SPNS1-201ENST00000311008 TTC30AQ86WT1 665 aa20.35■□□□□ 0.85
SPNS1-201ENST00000311008 C10orf82Q8WW14 230 aa20.35■□□□□ 0.85
SPNS1-201ENST00000311008 ERP27Q96DN0 273 aa20.35■□□□□ 0.85
SPNS1-201ENST00000311008 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
SPNS1-201ENST00000311008 CHKBQ9Y259 395 aa20.35■□□□□ 0.85
SPNS1-201ENST00000311008 SNX9Q9Y5X1 595 aa20.35■□□□□ 0.85
SPNS1-201ENST00000311008 PIK3R2O00459 728 aa20.35■□□□□ 0.85
SPNS1-201ENST00000311008 CAPN15O75808 1086 aa20.35■□□□□ 0.85
SPNS1-201ENST00000311008 FAM155BO75949 473 aa20.35■□□□□ 0.85
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SPNS1-201ENST00000311008 ADRA1DP25100 572 aa20.35■□□□□ 0.85
SPNS1-201ENST00000311008 ADCYAP1R1P41586 468 aa20.35■□□□□ 0.85
SPNS1-201ENST00000311008 PTPN9P43378 593 aa20.35■□□□□ 0.85
SPNS1-201ENST00000311008 RASSF2P50749 326 aa20.35■□□□□ 0.85
SPNS1-201ENST00000311008 SLC18A2Q05940 514 aa20.35■□□□□ 0.85
SPNS1-201ENST00000311008 PARP6Q2NL67 630 aa20.35■□□□□ 0.85
SPNS1-201ENST00000311008 SLC45A4Q5BKX6 768 aa20.35■□□□□ 0.85
SPNS1-201ENST00000311008 ACOT1Q86TX2 421 aa20.35■□□□□ 0.85
SPNS1-201ENST00000311008 IGDCC3Q8IVU1 814 aa20.35■□□□□ 0.85
SPNS1-201ENST00000311008 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
SPNS1-201ENST00000311008 PQLC3Q8N755 202 aa20.35■□□□□ 0.85
SPNS1-201ENST00000311008 ANKLE1Q8NAG6 615 aa20.35■□□□□ 0.85
SPNS1-201ENST00000311008 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
SPNS1-201ENST00000311008 RRN3P2A6NIE6 340 aa20.34■□□□□ 0.85
SPNS1-201ENST00000311008 C2CD2LO14523 706 aa20.34■□□□□ 0.85
SPNS1-201ENST00000311008 LPXNO60711 386 aa20.34■□□□□ 0.85
SPNS1-201ENST00000311008 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
SPNS1-201ENST00000311008 KRT16P08779 473 aa20.34■□□□□ 0.85
SPNS1-201ENST00000311008 CYP2C8P10632 490 aa20.34■□□□□ 0.85
SPNS1-201ENST00000311008 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa20.34■□□□□ 0.85
SPNS1-201ENST00000311008 MARCH8Q5T0T0 291 aa20.34■□□□□ 0.85
SPNS1-201ENST00000311008 LGSNQ5TDP6 509 aa20.34■□□□□ 0.85
SPNS1-201ENST00000311008 SLC27A1Q6PCB7 646 aa20.34■□□□□ 0.85
SPNS1-201ENST00000311008 SLC26A11Q86WA9 606 aa20.34■□□□□ 0.85
SPNS1-201ENST00000311008 CHSY1Q86X52 802 aa20.34■□□□□ 0.85
SPNS1-201ENST00000311008 MCUQ8NE86 351 aa20.34■□□□□ 0.85
SPNS1-201ENST00000311008 INPP5DQ92835 1189 aa20.34■□□□□ 0.85
SPNS1-201ENST00000311008 APOPT1Q96IL0 206 aa20.34■□□□□ 0.85
SPNS1-201ENST00000311008 SNX27Q96L92 541 aa20.34■□□□□ 0.85
SPNS1-201ENST00000311008 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
SPNS1-201ENST00000311008 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
SPNS1-201ENST00000311008 KATNBL1Q9H079 304 aa20.34■□□□□ 0.85
SPNS1-201ENST00000311008 LRMDAQ9H2I8 198 aa20.34■□□□□ 0.85
SPNS1-201ENST00000311008 ETNK1Q9HBU6 452 aa20.34■□□□□ 0.85
SPNS1-201ENST00000311008 ZNF180Q9UJW8 692 aa20.34■□□□□ 0.85
SPNS1-201ENST00000311008 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa20.34■□□□□ 0.85
SPNS1-201ENST00000311008 CITO14578 2027 aa20.34■□□□□ 0.85
SPNS1-201ENST00000311008 NPTXRO95502 500 aa20.34■□□□□ 0.85
SPNS1-201ENST00000311008 ZBTB6Q15916 424 aa20.34■□□□□ 0.85
SPNS1-201ENST00000311008 LDLRAD1Q5T700 205 aa20.34■□□□□ 0.85
SPNS1-201ENST00000311008 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP20.34■□□□□ 0.85
SPNS1-201ENST00000311008 PCDH19Q8TAB3 1148 aa20.34■□□□□ 0.85
SPNS1-201ENST00000311008 ADAM33Q9BZ11 813 aa20.34■□□□□ 0.85
SPNS1-201ENST00000311008 MANSC1Q9H8J5 431 aa20.34■□□□□ 0.85
SPNS1-201ENST00000311008 HEY1Q9Y5J3 304 aa20.34■□□□□ 0.85
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