RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000309641.10

PDE4D-201, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,025 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-201ENST00000309641 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
PDE4D-201ENST00000309641 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
PDE4D-201ENST00000309641 MDM4O15151 490 aa9.56□□□□□ -0.88
PDE4D-201ENST00000309641 COCHO43405 550 aa9.56□□□□□ -0.88
PDE4D-201ENST00000309641 OAS1P00973 400 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
PDE4D-201ENST00000309641 FERP16591 822 aa9.56□□□□□ -0.88
PDE4D-201ENST00000309641 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
PDE4D-201ENST00000309641 DAOAP59103 153 aa9.56□□□□□ -0.88
PDE4D-201ENST00000309641 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
PDE4D-201ENST00000309641 MEA1Q16626 185 aa9.56□□□□□ -0.88
PDE4D-201ENST00000309641 TMEM110Q86TL2 294 aa9.56□□□□□ -0.88
PDE4D-201ENST00000309641 GJD3Q8N144 294 aa9.56□□□□□ -0.88
PDE4D-201ENST00000309641 TTC16Q8NEE8 873 aa9.56□□□□□ -0.88
PDE4D-201ENST00000309641 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
PDE4D-201ENST00000309641 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa9.56□□□□□ -0.88
PDE4D-201ENST00000309641 HSFY1Q96LI6 401 aa9.56□□□□□ -0.88
PDE4D-201ENST00000309641 GCNAQ96QF7 691 aa9.56□□□□□ -0.88
PDE4D-201ENST00000309641 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
PDE4D-201ENST00000309641 AGPAT1Q99943 283 aa9.56□□□□□ -0.88
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PDE4D-201ENST00000309641 KCNK12Q9HB15 430 aa9.56□□□□□ -0.88
PDE4D-201ENST00000309641 TAS2R14Q9NYV8 317 aa9.56□□□□□ -0.88
PDE4D-201ENST00000309641 GDE1Q9NZC3 331 aa9.56□□□□□ -0.88
PDE4D-201ENST00000309641 NR2E1Q9Y466 385 aa9.56□□□□□ -0.88
PDE4D-201ENST00000309641 NUMBLQ9Y6R0 609 aa9.56□□□□□ -0.88
PDE4D-201ENST00000309641 ANHXE9PGG2 379 aa9.55□□□□□ -0.88
PDE4D-201ENST00000309641 ADCY5O95622 1261 aa9.55□□□□□ -0.88
PDE4D-201ENST00000309641 FGF19O95750 216 aa9.55□□□□□ -0.88
PDE4D-201ENST00000309641 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
PDE4D-201ENST00000309641 HDCP19113 662 aa9.55□□□□□ -0.88
PDE4D-201ENST00000309641 PRKCIP41743 596 aa9.55□□□□□ -0.88
PDE4D-201ENST00000309641 KLHL30Q0D2K2 578 aa9.55□□□□□ -0.88
PDE4D-201ENST00000309641 HTR4Q13639 388 aa9.55□□□□□ -0.88
PDE4D-201ENST00000309641 SNX30Q5VWJ9 437 aa9.55□□□□□ -0.88
PDE4D-201ENST00000309641 WDR59Q6PJI9 974 aa9.55□□□□□ -0.88
PDE4D-201ENST00000309641 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa9.55□□□□□ -0.88
PDE4D-201ENST00000309641 RNF135Q8IUD6 432 aa9.55□□□□□ -0.88
PDE4D-201ENST00000309641 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa9.55□□□□□ -0.88
PDE4D-201ENST00000309641 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa9.55□□□□□ -0.88
PDE4D-201ENST00000309641 STK32AQ8WU08 396 aa9.55□□□□□ -0.88
PDE4D-201ENST00000309641 EDEM1Q92611 657 aa9.55□□□□□ -0.88
PDE4D-201ENST00000309641 SMARCD2Q92925 531 aa9.55□□□□□ -0.88
PDE4D-201ENST00000309641 WBP2Q969T9 261 aa9.55□□□□□ -0.88
PDE4D-201ENST00000309641 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa9.55□□□□□ -0.88
PDE4D-201ENST00000309641 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
PDE4D-201ENST00000309641 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP9.55□□□□□ -0.88
PDE4D-201ENST00000309641 COMMD8Q9NX08 183 aa9.55□□□□□ -0.88
PDE4D-201ENST00000309641 SMPD4Q9NXE4 827 aa9.55□□□□□ -0.88
PDE4D-201ENST00000309641 NAGPAQ9UK23 515 aa9.55□□□□□ -0.88
PDE4D-201ENST00000309641 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP9.55□□□□□ -0.88
PDE4D-201ENST00000309641 CUL9Q8IWT3 2517 aa9.55□□□□□ -0.88
PDE4D-201ENST00000309641 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP9.55□□□□□ -0.883e-7■■■■□ 19.9
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PDE4D-201ENST00000309641 FYNP06241 537 aa9.55□□□□□ -0.88
PDE4D-201ENST00000309641 CKMP06732 381 aa9.55□□□□□ -0.88
PDE4D-201ENST00000309641 UNGP13051 313 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
PDE4D-201ENST00000309641 RARGP13631 454 aa9.55□□□□□ -0.88
PDE4D-201ENST00000309641 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP9.55□□□□□ -0.88
PDE4D-201ENST00000309641 GRM2Q14416 872 aa9.55□□□□□ -0.88
PDE4D-201ENST00000309641 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa9.55□□□□□ -0.88
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PDE4D-201ENST00000309641 SMYD5Q6GMV2 418 aa9.55□□□□□ -0.88
PDE4D-201ENST00000309641 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa9.55□□□□□ -0.88
PDE4D-201ENST00000309641 ZNF677Q86XU0 584 aa9.55□□□□□ -0.88
PDE4D-201ENST00000309641 TMEM35BQ8NCS4 154 aa9.55□□□□□ -0.88
PDE4D-201ENST00000309641 PDZD8Q8NEN9 1154 aa9.55□□□□□ -0.88
PDE4D-201ENST00000309641 OVCA2Q8WZ82 227 aa9.55□□□□□ -0.88
PDE4D-201ENST00000309641 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
PDE4D-201ENST00000309641 CNGB3Q9NQW8 809 aa9.55□□□□□ -0.88
PDE4D-201ENST00000309641 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
PDE4D-201ENST00000309641 GKN1Q9NS71 199 aa9.55□□□□□ -0.88
PDE4D-201ENST00000309641 EHD2Q9NZN4 543 aa9.55□□□□□ -0.88
PDE4D-201ENST00000309641 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa9.55□□□□□ -0.88
PDE4D-201ENST00000309641 HEPACAM2A8MVW5 462 aa9.54□□□□□ -0.88
PDE4D-201ENST00000309641 TMCO5BA8MYB1 307 aa9.54□□□□□ -0.88
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PDE4D-201ENST00000309641 MFAP3LO75121 409 aa9.54□□□□□ -0.88
PDE4D-201ENST00000309641 GRAP2O75791 330 aa9.54□□□□□ -0.88
PDE4D-201ENST00000309641 OLFM2O95897 454 aa9.54□□□□□ -0.88
PDE4D-201ENST00000309641 AVPR1AP37288 418 aa9.54□□□□□ -0.88
PDE4D-201ENST00000309641 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
PDE4D-201ENST00000309641 PTP4A2Q12974 167 aa9.54□□□□□ -0.88
PDE4D-201ENST00000309641 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa9.54□□□□□ -0.88
PDE4D-201ENST00000309641 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
PDE4D-201ENST00000309641 HECTD3Q5T447 861 aa9.54□□□□□ -0.88
PDE4D-201ENST00000309641 OLFML1Q6UWY5 402 aa9.54□□□□□ -0.88
PDE4D-201ENST00000309641 VITQ6UXI7 678 aa9.54□□□□□ -0.88
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PDE4D-201ENST00000309641 PLCD3Q8N3E9 789 aa9.54□□□□□ -0.88
PDE4D-201ENST00000309641 SLC44A3Q8N4M1 653 aa9.54□□□□□ -0.88
PDE4D-201ENST00000309641 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
PDE4D-201ENST00000309641 DNAJC7Q99615 494 aa9.54□□□□□ -0.88
PDE4D-201ENST00000309641 CHP1Q99653 195 aa9.54□□□□□ -0.88
PDE4D-201ENST00000309641 CYLDQ9NQC7 956 aa9.54□□□□□ -0.88
PDE4D-201ENST00000309641 MUTYHQ9UIF7 546 aa9.54□□□□□ -0.88
PDE4D-201ENST00000309641 CEP83Q9Y592 693 aa9.54□□□□□ -0.88
PDE4D-201ENST00000309641 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
PDE4D-201ENST00000309641 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa9.53□□□□□ -0.88
PDE4D-201ENST00000309641 GJB6O95452 261 aa9.53□□□□□ -0.88
PDE4D-201ENST00000309641 LSM8O95777 96 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
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