RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296642.4

PGGT1B-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 552 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-201ENST00000296642 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 HLA-BQ31612 363 aa8.38□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 CCDC157Q569K6 752 aa8.38□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 BROXQ5VW32 411 aa8.38□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 NAT16Q8N8M0 369 aa8.38□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 NECAB1Q8N987 351 aa8.38□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 HVCN1Q96D96 273 aa8.38□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 WBP1Q96G27 269 aa8.38□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa8.38□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 SYT15Q9BQS2 421 aa8.38□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 NUP58Q9BVL2 599 aa8.38□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 TTLL2Q9BWV7 592 aa8.38□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 HAPLN2Q9GZV7 340 aa8.38□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 PRORYQ9H606 182 aa8.38□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 SPHK2Q9NRA0 654 aa8.38□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 GDAP2Q9NXN4 497 aa8.38□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 FTSJ1Q9UET6 329 aa8.38□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 L1RE1Q9UN81 338 aa8.38□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 SHROOM3Q8TF72 1996 aa8.38□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 HELZP42694 1942 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 GON4LQ3T8J9 2241 aa8.38□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 ATP8B3O60423 1300 aa8.37□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 ARHGAP6O43182 974 aa8.37□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 DKK1O94907 266 aa8.37□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 BDNFP23560 247 aa8.37□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 MAOBP27338 520 aa8.37□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 YWHAQP27348 245 aa8.37□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 ACTN2P35609 894 aa8.37□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 WASP42768 502 aa8.37□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 TUBP50607 506 aa8.37□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC12A3P55017 1021 aa8.37□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 GTF2BQ00403 316 aa8.37□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 RHDQ02161 417 aa8.37□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 ORC1Q13415 861 aa8.37□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 SURF1Q15526 300 aa8.37□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 GAB4Q2WGN9 574 aa8.37□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 HYIQ5T013 277 aa8.37□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 HECTD3Q5T447 861 aa8.37□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 DCAF12L1Q5VU92 463 aa8.37□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM171BQ6P995 826 aa8.37□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 DBX2Q6ZNG2 339 aa8.37□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 HS2ST1Q7LGA3 356 aa8.37□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF843Q8N446 348 aa8.37□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa8.37□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 MRGPRX1Q96LB2 322 aa8.37□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 C8orf48Q96LL4 319 aa8.37□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 GABRG3Q99928 467 aa8.37□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 GPR174Q9BXC1 333 aa8.37□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 ELOVL4Q9GZR5 314 aa8.37□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa8.37□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP8.37□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 KIF3AQ9Y496 699 aa8.37□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa8.37□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa8.37□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 DSPP15924 2871 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa8.36□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 PTPRBP23467 1997 aa8.36□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 A0A1W2PQF6 199 aa8.36□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 METTL12A8MUP2 240 aa8.36□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 GABRDO14764 452 aa8.36□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 OAS1P00973 400 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 TNNC2P02585 160 aa8.36□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 UBA7P41226 1012 aa8.36□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 DGKGP49619 791 aa8.36□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 SEMG2Q02383 582 aa8.36□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 ARID5AQ03989 594 aa8.36□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 TAF10Q12962 218 aa8.36□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 CAMK2BQ13554 666 aa8.36□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 ME3Q16798 604 aa8.36□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa8.36□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 GPBP1Q86WP2 473 aa8.36□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 C12orf40Q86WS4 652 aa8.36□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa8.36□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 NUP93Q8N1F7 819 aa8.36□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM130Q8N3G9 435 aa8.36□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 C4orf32Q8N8J7 132 aa8.36□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 SNX19Q92543 992 aa8.36□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 FGF11Q92914 225 aa8.36□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 IGSF8Q969P0 613 aa8.36□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 FBXO32Q969P5 355 aa8.36□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 MYLPFQ96A32 169 aa8.36□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 SIPA1Q96FS4 1042 aa8.36□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 AK8Q96MA6 479 aa8.36□□□□□ -1.07
PGGT1B-201ENST00000296642 ARID3AQ99856 593 aa8.36□□□□□ -1.07
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