RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261667.7

KPNA3-201, Transcript of karyopherin subunit alpha 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene KPNA3, Length 4,474 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA3-201ENST00000261667 LRP6O75581 1613 aa11.01□□□□□ -0.65
KPNA3-201ENST00000261667 MED23Q9ULK4 1368 aa11.01□□□□□ -0.65
KPNA3-201ENST00000261667 SRP72O76094 671 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
KPNA3-201ENST00000261667 PRKD3O94806 890 aa11.01□□□□□ -0.65
KPNA3-201ENST00000261667 PEX2P28328 305 aa11.01□□□□□ -0.65
KPNA3-201ENST00000261667 YARSP54577 528 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
KPNA3-201ENST00000261667 CDK17Q00537 523 aa11.01□□□□□ -0.65
KPNA3-201ENST00000261667 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP11.01□□□□□ -0.65
KPNA3-201ENST00000261667 ERICH5Q6P6B1 374 aa11.01□□□□□ -0.65
KPNA3-201ENST00000261667 POTEHQ6S545 545 aa11.01□□□□□ -0.65
KPNA3-201ENST00000261667 PROM2Q8N271 834 aa11.01□□□□□ -0.65
KPNA3-201ENST00000261667 C8orf37Q96NL8 207 aa11.01□□□□□ -0.65
KPNA3-201ENST00000261667 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
KPNA3-201ENST00000261667 PACSIN3Q9UKS6 424 aa11.01□□□□□ -0.65
KPNA3-201ENST00000261667 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
KPNA3-201ENST00000261667 ALG6Q9Y672 507 aa11.01□□□□□ -0.65
KPNA3-201ENST00000261667 ITGB4P16144 1822 aa11.01□□□□□ -0.65
KPNA3-201ENST00000261667 C2CD2LO14523 706 aa11□□□□□ -0.65
KPNA3-201ENST00000261667 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
KPNA3-201ENST00000261667 SPDYCQ5MJ68 293 aa11□□□□□ -0.65
KPNA3-201ENST00000261667 TAF2Q6P1X5 1199 aa11□□□□□ -0.65
KPNA3-201ENST00000261667 XKR5Q6UX68 686 aa11□□□□□ -0.65
KPNA3-201ENST00000261667 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
KPNA3-201ENST00000261667 FAM118BQ9BPY3 351 aa11□□□□□ -0.65
KPNA3-201ENST00000261667 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
KPNA3-201ENST00000261667 TPK1Q9H3S4 243 aa11□□□□□ -0.65
KPNA3-201ENST00000261667 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa11□□□□□ -0.65
KPNA3-201ENST00000261667 PCSK1NQ9UHG2 260 aa11□□□□□ -0.65
KPNA3-201ENST00000261667 LAD1O00515 517 aa11□□□□□ -0.65
KPNA3-201ENST00000261667 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
KPNA3-201ENST00000261667 ADRA1DP25100 572 aa11□□□□□ -0.65
KPNA3-201ENST00000261667 PTENP60484 403 aa11□□□□□ -0.65
KPNA3-201ENST00000261667 CENPCQ03188 943 aa11□□□□□ -0.65
KPNA3-201ENST00000261667 SLCO6A1Q86UG4 719 aa11□□□□□ -0.65
KPNA3-201ENST00000261667 P3H2Q8IVL5 708 aa11□□□□□ -0.65
KPNA3-201ENST00000261667 FAM47BQ8NA70 645 aa11□□□□□ -0.65
KPNA3-201ENST00000261667 KYQ8NBH2 561 aa11□□□□□ -0.65
KPNA3-201ENST00000261667 C19orf18Q8NEA5 215 aa11□□□□□ -0.65
KPNA3-201ENST00000261667 CLPTM1LQ96KA5 538 aa11□□□□□ -0.65
KPNA3-201ENST00000261667 VPS35Q96QK1 796 aa11□□□□□ -0.65
KPNA3-201ENST00000261667 QPCTLQ9NXS2 382 aa11□□□□□ -0.65
KPNA3-201ENST00000261667 GMIPQ9P107 970 aa11□□□□□ -0.65
KPNA3-201ENST00000261667 KIAA1024Q9UPX6 916 aa11□□□□□ -0.65
KPNA3-201ENST00000261667 HPSEQ9Y251 543 aa11□□□□□ -0.65
KPNA3-201ENST00000261667 DGKBQ9Y6T7 804 aa11□□□□□ -0.65
KPNA3-201ENST00000261667 DISP2A7MBM2 1401 aa11□□□□□ -0.65
KPNA3-201ENST00000261667 PFASO15067 1338 aa11□□□□□ -0.65
KPNA3-201ENST00000261667 NWD2Q9ULI1 1742 aa11□□□□□ -0.65
KPNA3-201ENST00000261667 KCPQ6ZWJ8 1503 aa11□□□□□ -0.65
KPNA3-201ENST00000261667 ARHGEF35A5YM69 484 aa11□□□□□ -0.65
KPNA3-201ENST00000261667 TRIM49D1C9J1S8 452 aa11□□□□□ -0.65
KPNA3-201ENST00000261667 AGRPO00253 132 aa11□□□□□ -0.65
KPNA3-201ENST00000261667 TLR3O15455 904 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
KPNA3-201ENST00000261667 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
KPNA3-201ENST00000261667 WEE2P0C1S8 567 aa11□□□□□ -0.65
KPNA3-201ENST00000261667 QARSP47897 775 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
KPNA3-201ENST00000261667 MTMR2Q13614 643 aa11□□□□□ -0.65
KPNA3-201ENST00000261667 DGCR6Q14129 220 aa11□□□□□ -0.65
KPNA3-201ENST00000261667 C6orf52Q5T4I8 152 aa11□□□□□ -0.65
KPNA3-201ENST00000261667 KRT39Q6A163 491 aa11□□□□□ -0.65
KPNA3-201ENST00000261667 FAM45BPQ6NSW5 357 aa11□□□□□ -0.65
KPNA3-201ENST00000261667 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
KPNA3-201ENST00000261667 PALB2Q86YC2 1186 aa11□□□□□ -0.65
KPNA3-201ENST00000261667 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
KPNA3-201ENST00000261667 PQLC1Q8N2U9 271 aa11□□□□□ -0.65
KPNA3-201ENST00000261667 EFCAB3Q8N7B9 438 aa11□□□□□ -0.65
KPNA3-201ENST00000261667 BTBD9Q96Q07 612 aa11□□□□□ -0.65
KPNA3-201ENST00000261667 CDRT15Q96T59 188 aa11□□□□□ -0.65
KPNA3-201ENST00000261667 IL1RL2Q9HB29 575 aa11□□□□□ -0.65
KPNA3-201ENST00000261667 C1orf112Q9NSG2 853 aa11□□□□□ -0.65
KPNA3-201ENST00000261667 PKD2L1Q9P0L9 805 aa11□□□□□ -0.65
KPNA3-201ENST00000261667 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
KPNA3-201ENST00000261667 ERVK-11Q9UQG0 969 aa11□□□□□ -0.65
KPNA3-201ENST00000261667 FUOMA2VDF0 154 aa10.99□□□□□ -0.65
KPNA3-201ENST00000261667 F8W031 263 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
KPNA3-201ENST00000261667 F8W810 466 aa10.99□□□□□ -0.65
KPNA3-201ENST00000261667 K7EPI3 171 aa10.99□□□□□ -0.65
KPNA3-201ENST00000261667 NUDT17P0C025 328 aa10.99□□□□□ -0.65
KPNA3-201ENST00000261667 SLC16A2P36021 539 aa10.99□□□□□ -0.65
KPNA3-201ENST00000261667 RHBDL3P58872 404 aa10.99□□□□□ -0.65
KPNA3-201ENST00000261667 CYP4A11Q02928 519 aa10.99□□□□□ -0.65
KPNA3-201ENST00000261667 COG2Q14746 738 aa10.99□□□□□ -0.65
KPNA3-201ENST00000261667 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
KPNA3-201ENST00000261667 CYP4A22Q5TCH4 519 aa10.99□□□□□ -0.65
KPNA3-201ENST00000261667 OGFOD2Q6N063 350 aa10.99□□□□□ -0.65
KPNA3-201ENST00000261667 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa10.99□□□□□ -0.65
KPNA3-201ENST00000261667 MYO1HQ8N1T3 1032 aa10.99□□□□□ -0.65
KPNA3-201ENST00000261667 BEST2Q8NFU1 509 aa10.99□□□□□ -0.65
KPNA3-201ENST00000261667 TCP10LQ8TDR4 215 aa10.99□□□□□ -0.65
KPNA3-201ENST00000261667 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
KPNA3-201ENST00000261667 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
KPNA3-201ENST00000261667 CDY2AQ9Y6F7 541 aa10.99□□□□□ -0.65
KPNA3-201ENST00000261667 CDY1Q9Y6F8 540 aa10.99□□□□□ -0.65
KPNA3-201ENST00000261667 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
KPNA3-201ENST00000261667 ANGPT2O15123 496 aa10.99□□□□□ -0.65
KPNA3-201ENST00000261667 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
KPNA3-201ENST00000261667 CTDNEP1O95476 244 aa10.99□□□□□ -0.65
KPNA3-201ENST00000261667 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
KPNA3-201ENST00000261667 SULT2A1Q06520 285 aa10.99□□□□□ -0.65
KPNA3-201ENST00000261667 BNIP3Q12983 259 aa10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.1 ms