RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261497.8

USP22-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 22, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP22, Length 5,220 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP22-201ENST00000261497 PKN1Q16512 942 aa14.27□□□□□ -0.13
USP22-201ENST00000261497 MTBPQ96DY7 904 aa14.27□□□□□ -0.13
USP22-201ENST00000261497 ZNF185O15231 689 aa14.27□□□□□ -0.13
USP22-201ENST00000261497 SLITRK3O94933 977 aa14.27□□□□□ -0.13
USP22-201ENST00000261497 CCR1P32246 355 aa14.27□□□□□ -0.13
USP22-201ENST00000261497 SEC24CP53992 1094 aa14.27□□□□□ -0.13
USP22-201ENST00000261497 MRNIPQ6NTE8 343 aa14.27□□□□□ -0.13
USP22-201ENST00000261497 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP14.27□□□□□ -0.132e-9■■■■■ 44.1
USP22-201ENST00000261497 KLRG1Q96E93 195 aa14.27□□□□□ -0.13
USP22-201ENST00000261497 MS4A14Q96JA4 679 aa14.27□□□□□ -0.13
USP22-201ENST00000261497 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP14.27□□□□□ -0.13
USP22-201ENST00000261497 NMRK2Q9NPI5 230 aa14.27□□□□□ -0.13
USP22-201ENST00000261497 SCUBE2Q9NQ36 999 aa14.27□□□□□ -0.13
USP22-201ENST00000261497 SELENONQ9NZV5 590 aa14.27□□□□□ -0.13
USP22-201ENST00000261497 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa14.27□□□□□ -0.13
USP22-201ENST00000261497 TBC1D12O60347 775 aa14.27□□□□□ -0.13
USP22-201ENST00000261497 OCM2P0CE71 109 aa14.27□□□□□ -0.13
USP22-201ENST00000261497 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP14.27□□□□□ -0.13
USP22-201ENST00000261497 UBE3AQ05086 875 aa14.27□□□□□ -0.13
USP22-201ENST00000261497 BTKQ06187 659 aa14.27□□□□□ -0.13
USP22-201ENST00000261497 MAPRE2Q15555 327 aa14.27□□□□□ -0.13
USP22-201ENST00000261497 EME1Q96AY2 570 aa14.27□□□□□ -0.13
USP22-201ENST00000261497 ZBTB10Q96DT7 871 aa14.27□□□□□ -0.13
USP22-201ENST00000261497 CNPY3Q9BT09 278 aa14.27□□□□□ -0.13
USP22-201ENST00000261497 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa14.27□□□□□ -0.13
USP22-201ENST00000261497 CD248Q9HCU0 757 aa14.27□□□□□ -0.13
USP22-201ENST00000261497 MROH7Q68CQ1 1323 aa14.26□□□□□ -0.13
USP22-201ENST00000261497 C5orf58C9J3I9 102 aa14.26□□□□□ -0.13
USP22-201ENST00000261497 NDST1P52848 882 aa14.26□□□□□ -0.13
USP22-201ENST00000261497 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP14.26□□□□□ -0.13
USP22-201ENST00000261497 MAP3K10Q02779 954 aa14.26□□□□□ -0.13
USP22-201ENST00000261497 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP14.26□□□□□ -0.13
USP22-201ENST00000261497 KCNT1Q5JUK3 1230 aa14.26□□□□□ -0.13
USP22-201ENST00000261497 LRIG3Q6UXM1 1119 aa14.26□□□□□ -0.13
USP22-201ENST00000261497 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP14.26□□□□□ -0.13
USP22-201ENST00000261497 SMARCD1Q96GM5 515 aa14.26□□□□□ -0.13
USP22-201ENST00000261497 ELOVL4Q9GZR5 314 aa14.26□□□□□ -0.13
USP22-201ENST00000261497 THAP2Q9H0W7 228 aa14.26□□□□□ -0.13
USP22-201ENST00000261497 CCDC134Q9H6E4 229 aa14.26□□□□□ -0.13
USP22-201ENST00000261497 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa14.26□□□□□ -0.13
USP22-201ENST00000261497 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa14.26□□□□□ -0.13
USP22-201ENST00000261497 SMAPO00193 183 aa14.26□□□□□ -0.13
USP22-201ENST00000261497 SCNN1GP51170 649 aa14.26□□□□□ -0.13
USP22-201ENST00000261497 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP14.26□□□□□ -0.13
USP22-201ENST00000261497 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP14.26□□□□□ -0.13
USP22-201ENST00000261497 MKL1Q969V6 931 aa14.26□□□□□ -0.13
USP22-201ENST00000261497 USP20Q9Y2K6 914 aa14.26□□□□□ -0.13
USP22-201ENST00000261497 AKAP3O75969 853 aa14.26□□□□□ -0.13
USP22-201ENST00000261497 ELNP15502 786 aa14.26□□□□□ -0.13
USP22-201ENST00000261497 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP14.26□□□□□ -0.13
USP22-201ENST00000261497 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP14.26□□□□□ -0.13
USP22-201ENST00000261497 TBX4P57082 545 aa14.26□□□□□ -0.13
USP22-201ENST00000261497 MYBPC2Q14324 1141 aa14.26□□□□□ -0.13
USP22-201ENST00000261497 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP14.26□□□□□ -0.13
USP22-201ENST00000261497 SLC39A12Q504Y0 691 aa14.26□□□□□ -0.13
USP22-201ENST00000261497 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa14.26□□□□□ -0.13
USP22-201ENST00000261497 NPHS2Q9NP85 383 aa14.26□□□□□ -0.13
USP22-201ENST00000261497 SLC39A10Q9ULF5 831 aa14.26□□□□□ -0.13
USP22-201ENST00000261497 AP4E1Q9UPM8 1137 aa14.26□□□□□ -0.13
USP22-201ENST00000261497 CCT8L1PA6NM43 557 aa14.26□□□□□ -0.13
USP22-201ENST00000261497 ITGALP20701 1170 aa14.26□□□□□ -0.13
USP22-201ENST00000261497 STIP1P31948 543 aaKnown RBP14.26□□□□□ -0.13
USP22-201ENST00000261497 KCNJ1P48048 391 aa14.26□□□□□ -0.13
USP22-201ENST00000261497 BLVRAP53004 296 aa14.26□□□□□ -0.13
USP22-201ENST00000261497 NTRK3Q16288 839 aa14.26□□□□□ -0.13
USP22-201ENST00000261497 KIRREL3Q8IZU9 778 aa14.26□□□□□ -0.13
USP22-201ENST00000261497 SGSM3Q96HU1 749 aa14.26□□□□□ -0.13
USP22-201ENST00000261497 NOD2Q9HC29 1040 aa14.26□□□□□ -0.13
USP22-201ENST00000261497 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP14.26□□□□□ -0.13
USP22-201ENST00000261497 SPAG6O75602 509 aa14.25□□□□□ -0.13
USP22-201ENST00000261497 HMGCRP04035 888 aa14.25□□□□□ -0.13
USP22-201ENST00000261497 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa14.25□□□□□ -0.13
USP22-201ENST00000261497 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa14.25□□□□□ -0.13
USP22-201ENST00000261497 S100A5P33763 92 aa14.25□□□□□ -0.13
USP22-201ENST00000261497 MFSD4BQ5TF39 518 aa14.25□□□□□ -0.13
USP22-201ENST00000261497 FAXCQ5TGI0 409 aa14.25□□□□□ -0.13
USP22-201ENST00000261497 C11orf96Q7Z7L8 435 aa14.25□□□□□ -0.13
USP22-201ENST00000261497 CACUL1Q86Y37 369 aa14.25□□□□□ -0.13
USP22-201ENST00000261497 PLD3Q8IV08 490 aa14.25□□□□□ -0.13
USP22-201ENST00000261497 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP14.25□□□□□ -0.13
USP22-201ENST00000261497 VGLL2Q8N8G2 317 aa14.25□□□□□ -0.13
USP22-201ENST00000261497 SKA1Q96BD8 255 aa14.25□□□□□ -0.13
USP22-201ENST00000261497 NFKBIZQ9BYH8 718 aa14.25□□□□□ -0.13
USP22-201ENST00000261497 BRD8Q9H0E9 1235 aa14.25□□□□□ -0.13
USP22-201ENST00000261497 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP14.25□□□□□ -0.13
USP22-201ENST00000261497 C16orf96A6NNT2 1141 aa14.25□□□□□ -0.13
USP22-201ENST00000261497 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP14.25□□□□□ -0.13
USP22-201ENST00000261497 ATP6V1E1P36543 226 aa14.25□□□□□ -0.13
USP22-201ENST00000261497 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP14.25□□□□□ -0.13
USP22-201ENST00000261497 CRYMQ14894 314 aa14.25□□□□□ -0.13
USP22-201ENST00000261497 PDK2Q15119 407 aa14.25□□□□□ -0.13
USP22-201ENST00000261497 CCDC149Q6ZUS6 474 aa14.25□□□□□ -0.13
USP22-201ENST00000261497 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP14.25□□□□□ -0.13
USP22-201ENST00000261497 FTHL17Q9BXU8 183 aa14.25□□□□□ -0.13
USP22-201ENST00000261497 PRDM4Q9UKN5 801 aa14.25□□□□□ -0.13
USP22-201ENST00000261497 TSPAN16Q9UKR8 245 aa14.25□□□□□ -0.13
USP22-201ENST00000261497 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP14.25□□□□□ -0.13
USP22-201ENST00000261497 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP14.25□□□□□ -0.13
USP22-201ENST00000261497 MAPTP10636 758 aaKnown RBP14.25□□□□□ -0.13
USP22-201ENST00000261497 SCNN1BP51168 640 aa14.25□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48 ms