RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258607.9

CKAP2-201, Transcript of cytoskeleton associated protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CKAP2, Length 3,375 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP2-201ENST00000258607 ROR1Q01973 937 aa9.48□□□□□ -0.89
CKAP2-201ENST00000258607 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
CKAP2-201ENST00000258607 HHATQ5VTY9 493 aa9.48□□□□□ -0.89
CKAP2-201ENST00000258607 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa9.48□□□□□ -0.89
CKAP2-201ENST00000258607 C3orf20Q8ND61 904 aa9.48□□□□□ -0.89
CKAP2-201ENST00000258607 MECRQ9BV79 373 aa9.48□□□□□ -0.89
CKAP2-201ENST00000258607 ULBP1Q9BZM6 244 aa9.48□□□□□ -0.89
CKAP2-201ENST00000258607 SAMD15Q9P1V8 674 aa9.48□□□□□ -0.89
CKAP2-201ENST00000258607 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa9.48□□□□□ -0.89
CKAP2-201ENST00000258607 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP9.48□□□□□ -0.89
CKAP2-201ENST00000258607 A0A1B0GUA9 196 aa9.48□□□□□ -0.89
CKAP2-201ENST00000258607 FAM187AA6NFU0 413 aa9.48□□□□□ -0.89
CKAP2-201ENST00000258607 CCL22O00626 93 aa9.48□□□□□ -0.89
CKAP2-201ENST00000258607 FSCN2O14926 492 aa9.48□□□□□ -0.89
CKAP2-201ENST00000258607 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
CKAP2-201ENST00000258607 DARSP14868 501 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
CKAP2-201ENST00000258607 CPA2P48052 419 aa9.48□□□□□ -0.89
CKAP2-201ENST00000258607 MNAT1P51948 309 aa9.48□□□□□ -0.89
CKAP2-201ENST00000258607 RTP1P59025 263 aa9.48□□□□□ -0.89
CKAP2-201ENST00000258607 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
CKAP2-201ENST00000258607 PTP4A2Q12974 167 aa9.48□□□□□ -0.89
CKAP2-201ENST00000258607 SLMAPQ14BN4 828 aa9.48□□□□□ -0.89
CKAP2-201ENST00000258607 FAM110CQ1W6H9 321 aa9.48□□□□□ -0.89
CKAP2-201ENST00000258607 FOXR2Q6PJQ5 311 aa9.48□□□□□ -0.89
CKAP2-201ENST00000258607 PID1Q7Z2X4 250 aa9.48□□□□□ -0.89
CKAP2-201ENST00000258607 OSTM1Q86WC4 334 aa9.48□□□□□ -0.89
CKAP2-201ENST00000258607 IGDCC3Q8IVU1 814 aa9.48□□□□□ -0.89
CKAP2-201ENST00000258607 SPATA6LQ8N4H0 392 aa9.48□□□□□ -0.89
CKAP2-201ENST00000258607 C3orf58Q8NDZ4 430 aa9.48□□□□□ -0.89
CKAP2-201ENST00000258607 SENP8Q96LD8 212 aa9.48□□□□□ -0.89
CKAP2-201ENST00000258607 TRAIPQ9BWF2 469 aa9.48□□□□□ -0.89
CKAP2-201ENST00000258607 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
CKAP2-201ENST00000258607 ASNSD1Q9NWL6 643 aa9.48□□□□□ -0.89
CKAP2-201ENST00000258607 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
CKAP2-201ENST00000258607 URB1O60287 2271 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
CKAP2-201ENST00000258607 RPL17P18621 184 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
CKAP2-201ENST00000258607 ETFBP38117 255 aa9.47□□□□□ -0.89
CKAP2-201ENST00000258607 CDKN2BP42772 138 aa9.47□□□□□ -0.89
CKAP2-201ENST00000258607 SLC8A3P57103 927 aa9.47□□□□□ -0.89
CKAP2-201ENST00000258607 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
CKAP2-201ENST00000258607 KCNA10Q16322 511 aa9.47□□□□□ -0.89
CKAP2-201ENST00000258607 DDR2Q16832 855 aa9.47□□□□□ -0.89
CKAP2-201ENST00000258607 C9orf57Q5W0N0 161 aa9.47□□□□□ -0.89
CKAP2-201ENST00000258607 FAM219BQ5XKK7 198 aa9.47□□□□□ -0.89
CKAP2-201ENST00000258607 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa9.47□□□□□ -0.89
CKAP2-201ENST00000258607 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa9.47□□□□□ -0.89
CKAP2-201ENST00000258607 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
CKAP2-201ENST00000258607 GRK7Q8WTQ7 553 aa9.47□□□□□ -0.89
CKAP2-201ENST00000258607 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
CKAP2-201ENST00000258607 CCDC77Q9BR77 488 aa9.47□□□□□ -0.89
CKAP2-201ENST00000258607 AP4E1Q9UPM8 1137 aa9.47□□□□□ -0.89
CKAP2-201ENST00000258607 KBTBD13C9JR72 458 aa9.47□□□□□ -0.89
CKAP2-201ENST00000258607 NRP1O14786 923 aa9.47□□□□□ -0.89
CKAP2-201ENST00000258607 STRNO43815 780 aa9.47□□□□□ -0.89
CKAP2-201ENST00000258607 B4GALT4O60513 344 aa9.47□□□□□ -0.89
CKAP2-201ENST00000258607 TBX18O95935 607 aa9.47□□□□□ -0.89
CKAP2-201ENST00000258607 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
CKAP2-201ENST00000258607 GRIK1P39086 918 aa9.47□□□□□ -0.89
CKAP2-201ENST00000258607 GPR15P49685 360 aa9.47□□□□□ -0.89
CKAP2-201ENST00000258607 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
CKAP2-201ENST00000258607 FAM228AQ86W67 206 aa9.47□□□□□ -0.89
CKAP2-201ENST00000258607 RCOR2Q8IZ40 523 aa9.47□□□□□ -0.89
CKAP2-201ENST00000258607 PDIK1LQ8N165 341 aa9.47□□□□□ -0.89
CKAP2-201ENST00000258607 MPP5Q8N3R9 675 aa9.47□□□□□ -0.89
CKAP2-201ENST00000258607 KCTD17Q8N5Z5 321 aa9.47□□□□□ -0.89
CKAP2-201ENST00000258607 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa9.47□□□□□ -0.89
CKAP2-201ENST00000258607 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
CKAP2-201ENST00000258607 EPB41L4BQ9H329 900 aa9.47□□□□□ -0.89
CKAP2-201ENST00000258607 PTPRHQ9HD43 1115 aa9.47□□□□□ -0.89
CKAP2-201ENST00000258607 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
CKAP2-201ENST00000258607 YJEFN3A6XGL0 299 aa9.47□□□□□ -0.89
CKAP2-201ENST00000258607 E7ENQ6 273 aa9.47□□□□□ -0.89
CKAP2-201ENST00000258607 H0YGN5 161 aa9.47□□□□□ -0.89
CKAP2-201ENST00000258607 LGR5O75473 907 aa9.47□□□□□ -0.89
CKAP2-201ENST00000258607 TTC4O95801 387 aa9.47□□□□□ -0.89
CKAP2-201ENST00000258607 MCF2P10911 925 aa9.47□□□□□ -0.89
CKAP2-201ENST00000258607 CYP2F1P24903 491 aa9.47□□□□□ -0.89
CKAP2-201ENST00000258607 GRK4P32298 578 aa9.47□□□□□ -0.89
CKAP2-201ENST00000258607 TAF6P49848 677 aa9.47□□□□□ -0.89
CKAP2-201ENST00000258607 LILRA4P59901 499 aa9.47□□□□□ -0.89
CKAP2-201ENST00000258607 CCDC14Q49A88 953 aa9.47□□□□□ -0.89
CKAP2-201ENST00000258607 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
CKAP2-201ENST00000258607 RGMBQ6NW40 437 aa9.47□□□□□ -0.89
CKAP2-201ENST00000258607 C16orf46Q6P387 395 aa9.47□□□□□ -0.89
CKAP2-201ENST00000258607 KCNT2Q6UVM3 1135 aa9.47□□□□□ -0.89
CKAP2-201ENST00000258607 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa9.47□□□□□ -0.89
CKAP2-201ENST00000258607 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
CKAP2-201ENST00000258607 EXD1Q8NHP7 514 aa9.47□□□□□ -0.89
CKAP2-201ENST00000258607 CD99L2Q8TCZ2 262 aa9.47□□□□□ -0.89
CKAP2-201ENST00000258607 RAET1EQ8TD07 263 aa9.47□□□□□ -0.89
CKAP2-201ENST00000258607 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
CKAP2-201ENST00000258607 AZIN2Q96A70 460 aa9.47□□□□□ -0.89
CKAP2-201ENST00000258607 SCLYQ96I15 445 aa9.47□□□□□ -0.89
CKAP2-201ENST00000258607 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
CKAP2-201ENST00000258607 RASSF4Q9H2L5 321 aa9.47□□□□□ -0.89
CKAP2-201ENST00000258607 ABCF3Q9NUQ8 709 aa9.47□□□□□ -0.89
CKAP2-201ENST00000258607 HAUS2Q9NVX0 235 aa9.47□□□□□ -0.89
CKAP2-201ENST00000258607 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP9.47□□□□□ -0.89
CKAP2-201ENST00000258607 KCNG1Q9UIX4 513 aa9.47□□□□□ -0.89
CKAP2-201ENST00000258607 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.4 ms