RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000219084.10

CHD9-201, Transcript of chromodomain helicase DNA binding protein 9, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CHD9, Length 8,739 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD9-201ENST00000219084 ECSITQ9BQ95 431 aa4.55□□□□□ -1.68
CHD9-201ENST00000219084 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
CHD9-201ENST00000219084 PDGFCQ9NRA1 345 aa4.55□□□□□ -1.68
CHD9-201ENST00000219084 RGL1Q9NZL6 768 aa4.55□□□□□ -1.68
CHD9-201ENST00000219084 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
CHD9-201ENST00000219084 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa4.55□□□□□ -1.68
CHD9-201ENST00000219084 PI4K2BG5E9Z4 385 aa4.55□□□□□ -1.68
CHD9-201ENST00000219084 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP4.55□□□□□ -1.68
CHD9-201ENST00000219084 CBFA2T3O75081 653 aa4.55□□□□□ -1.68
CHD9-201ENST00000219084 VPS26AO75436 327 aa4.55□□□□□ -1.68
CHD9-201ENST00000219084 PDE5AO76074 875 aa4.55□□□□□ -1.68
CHD9-201ENST00000219084 BMP10O95393 424 aa4.55□□□□□ -1.68
CHD9-201ENST00000219084 TPBGLP0DKB5 382 aa4.55□□□□□ -1.68
CHD9-201ENST00000219084 POU4F1Q01851 419 aa4.55□□□□□ -1.68
CHD9-201ENST00000219084 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
CHD9-201ENST00000219084 KCNA1Q09470 495 aa4.55□□□□□ -1.68
CHD9-201ENST00000219084 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
CHD9-201ENST00000219084 TSNQ15631 228 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
CHD9-201ENST00000219084 PTPN21Q16825 1174 aa4.55□□□□□ -1.68
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CHD9-201ENST00000219084 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
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CHD9-201ENST00000219084 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa4.55□□□□□ -1.68
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CHD9-201ENST00000219084 ZNF280CQ8ND82 737 aa4.55□□□□□ -1.68
CHD9-201ENST00000219084 ZNF507Q8TCN5 953 aa4.55□□□□□ -1.68
CHD9-201ENST00000219084 ATP8B4Q8TF62 1192 aa4.55□□□□□ -1.68
CHD9-201ENST00000219084 BSNDQ8WZ55 320 aa4.55□□□□□ -1.68
CHD9-201ENST00000219084 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa4.55□□□□□ -1.68
CHD9-201ENST00000219084 SLC39A8Q9C0K1 460 aa4.55□□□□□ -1.68
CHD9-201ENST00000219084 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa4.55□□□□□ -1.68
CHD9-201ENST00000219084 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
CHD9-201ENST00000219084 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
CHD9-201ENST00000219084 KCNQ5Q9NR82 932 aa4.55□□□□□ -1.68
CHD9-201ENST00000219084 GJB4Q9NTQ9 266 aa4.55□□□□□ -1.68
CHD9-201ENST00000219084 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
CHD9-201ENST00000219084 HEY2Q9UBP5 337 aa4.55□□□□□ -1.68
CHD9-201ENST00000219084 ZNF711Q9Y462 761 aa4.55□□□□□ -1.68
CHD9-201ENST00000219084 TNS2Q63HR2 1409 aa4.55□□□□□ -1.68
CHD9-201ENST00000219084 HEATR9A2RTY3 570 aa4.55□□□□□ -1.68
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CHD9-201ENST00000219084 AIM2O14862 343 aa4.55□□□□□ -1.68
CHD9-201ENST00000219084 CST8O60676 142 aa4.55□□□□□ -1.68
CHD9-201ENST00000219084 CAND2O75155 1236 aa4.55□□□□□ -1.68
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CHD9-201ENST00000219084 EGFRP00533 1210 aa4.55□□□□□ -1.68
CHD9-201ENST00000219084 OSTNP61366 133 aa4.55□□□□□ -1.68
CHD9-201ENST00000219084 CYP24A1Q07973 514 aa4.55□□□□□ -1.68
CHD9-201ENST00000219084 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
CHD9-201ENST00000219084 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa4.55□□□□□ -1.68
CHD9-201ENST00000219084 BRINP3Q76B58 766 aa4.55□□□□□ -1.68
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CHD9-201ENST00000219084 SEPT8Q92599 483 aa4.55□□□□□ -1.68
CHD9-201ENST00000219084 CASP10Q92851 521 aa4.55□□□□□ -1.68
CHD9-201ENST00000219084 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa4.55□□□□□ -1.68
CHD9-201ENST00000219084 JMJD4Q9H9V9 463 aa4.55□□□□□ -1.68
CHD9-201ENST00000219084 CYP39A1Q9NYL5 469 aa4.55□□□□□ -1.68
CHD9-201ENST00000219084 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
CHD9-201ENST00000219084 BTBD7Q9P203 1132 aa4.55□□□□□ -1.68
CHD9-201ENST00000219084 H7C4K7 107 aa4.55□□□□□ -1.68
CHD9-201ENST00000219084 KPNA6O60684 536 aa4.55□□□□□ -1.68
CHD9-201ENST00000219084 ALDH1A1P00352 501 aa4.55□□□□□ -1.68
CHD9-201ENST00000219084 FASP25445 335 aa4.55□□□□□ -1.68
CHD9-201ENST00000219084 NMT1P30419 496 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
CHD9-201ENST00000219084 MAPK9P45984 424 aa4.55□□□□□ -1.68
CHD9-201ENST00000219084 NPY2RP49146 381 aa4.55□□□□□ -1.68
CHD9-201ENST00000219084 GPSM2P81274 684 aa4.55□□□□□ -1.68
CHD9-201ENST00000219084 MMRN1Q13201 1228 aa4.55□□□□□ -1.68
CHD9-201ENST00000219084 DCAF6Q58WW2 860 aa4.55□□□□□ -1.68
CHD9-201ENST00000219084 ZNF544Q6NX49 715 aa4.55□□□□□ -1.68
CHD9-201ENST00000219084 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa4.55□□□□□ -1.68
CHD9-201ENST00000219084 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa4.55□□□□□ -1.68
CHD9-201ENST00000219084 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
CHD9-201ENST00000219084 RNF149Q8NC42 400 aa4.55□□□□□ -1.68
CHD9-201ENST00000219084 ADGRE3Q9BY15 652 aa4.55□□□□□ -1.68
CHD9-201ENST00000219084 ARMC7Q9H6L4 198 aa4.55□□□□□ -1.68
CHD9-201ENST00000219084 CD274Q9NZQ7 290 aa4.55□□□□□ -1.68
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CHD9-201ENST00000219084 JCADQ9P266 1359 aa4.55□□□□□ -1.68
CHD9-201ENST00000219084 LRRC37A3O60309 1634 aa4.55□□□□□ -1.68
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CHD9-201ENST00000219084 CYP2C18P33260 490 aa4.55□□□□□ -1.68
CHD9-201ENST00000219084 BNC1Q01954 994 aa4.55□□□□□ -1.68
CHD9-201ENST00000219084 MGAT5Q09328 741 aa4.55□□□□□ -1.68
CHD9-201ENST00000219084 CNTN1Q12860 1018 aa4.55□□□□□ -1.68
CHD9-201ENST00000219084 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
CHD9-201ENST00000219084 DPYSQ14117 519 aa4.55□□□□□ -1.68
CHD9-201ENST00000219084 CNGA2Q16280 664 aa4.55□□□□□ -1.68
CHD9-201ENST00000219084 DGKDQ16760 1214 aa4.55□□□□□ -1.68
CHD9-201ENST00000219084 ATAD3BQ5T9A4 648 aa4.55□□□□□ -1.68
CHD9-201ENST00000219084 PKN3Q6P5Z2 889 aa4.55□□□□□ -1.68
CHD9-201ENST00000219084 ZNF720Q7Z2F6 126 aa4.55□□□□□ -1.68
CHD9-201ENST00000219084 C4orf19Q8IY42 314 aa4.55□□□□□ -1.68
CHD9-201ENST00000219084 C4orf33Q8N1A6 199 aa4.55□□□□□ -1.68
CHD9-201ENST00000219084 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa4.55□□□□□ -1.68
CHD9-201ENST00000219084 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
CHD9-201ENST00000219084 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP4.55□□□□□ -1.68
CHD9-201ENST00000219084 SLC30A5Q8TAD4 765 aa4.55□□□□□ -1.68
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