RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027667.12

Pkp1-201, Transcript of Plakophilin-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pkp1, Length 4,669 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Yme1l1O88967 715 aaKnown RBP13.27□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Sult1e1P49891 295 aa13.27□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gas1Q01721 343 aa13.27□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Styk1Q6J9G1 429 aa13.27□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 KynuQ9CXF0 464 aa13.27□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ola1Q9CZ30 396 aaKnown RBP13.27□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rag1P15919 1040 aa13.27□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Crabp2P22935 138 aa13.27□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Pou2f3P31362 431 aa13.27□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Dpep1P31428 410 aa13.27□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Usp4P35123 962 aa13.27□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 FpgsP48760 587 aa13.27□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 GemP55041 295 aa13.27□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ndufaf2Q59J78 168 aa13.27□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Map3k10Q66L42 940 aa13.27□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Q8CCC3 530 aa13.27□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Vps37aQ8CHS8 397 aa13.27□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Pcdhb19Q91Y01 801 aa13.27□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Sntg2Q925E0 539 aa13.27□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ndufb5Q9CQH3 189 aa13.27□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rnf135Q9CWS1 417 aa13.27□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Vps28Q9D1C8 221 aa13.27□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ubxn11Q9D572 484 aa13.27□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Apobec2Q9WV35 224 aa13.27□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 1700064H15RikD3Z4D4 81 aa13.26□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 TpteG5E8H5 664 aa13.26□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 TazI7HJS2 263 aa13.26□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Man1a1P45700 655 aa13.26□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mfsd14aP70187 490 aa13.26□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Zfyve27Q3TXX3 415 aa13.26□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Chi3l1Q61362 389 aa13.26□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Dpysl3Q62188 570 aa13.26□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Krt73Q6NXH9 539 aa13.26□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Wdr60Q8C761 999 aa13.26□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 F11Q91Y47 624 aa13.26□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tfap2dQ91ZK0 452 aa13.26□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Klc4Q9DBS5 619 aa13.26□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Map3k6Q9WTR2 1291 aa13.26□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Lsp1P19973 330 aa13.26□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Itga4Q00651 1039 aa13.26□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Srebf2Q3U1N2 1130 aa13.26□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Kansl1lQ5DTI6 991 aa13.26□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Adgre1Q61549 931 aa13.26□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Trnp1Q80ZI1 223 aa13.26□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Azin2Q8BVM4 459 aa13.26□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Bclaf1Q8K019 919 aaKnown RBP13.26□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Alg1Q921Q3 482 aa13.26□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ppp1r16aQ923M0 524 aa13.26□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rnf4Q9QZS2 194 aa13.26□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Pnldc1B2RXZ1 531 aa13.26□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr726E9Q8X3 321 aa13.26□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 4930544D05RikJ3QK56 214 aa13.26□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Anxa8O35640 327 aa13.26□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cyp2b9P12790 491 aa13.26□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Akt1P31750 480 aa13.26□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 MafbP54841 323 aa13.26□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Casp4P70343 373 aa13.26□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 VcpQ01853 806 aaKnown RBP13.26□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr725Q05A45 321 aa13.26□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Smyd5Q3TYX3 416 aa13.26□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Snx27Q3UHD6 539 aa13.26□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mansc4Q3UU94 337 aa13.26□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Serpinb6dQ3UWK8 375 aa13.26□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mfhas1Q3V1N1 1048 aa13.26□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gja6Q6S5G4 283 aa13.26□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Lyve1Q8BHC0 318 aa13.26□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rbm22Q8BHS3 420 aaKnown RBP13.26□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 4921511C20RikQ8BVT7 469 aa13.26□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 4932411N23RikQ8C0S0 470 aa13.26□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Nup85Q8R480 656 aaKnown RBP13.26□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Trim12aQ99PQ1 284 aa13.26□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Slxl1Q9D515 155 aa13.26□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Pkp3Q9QY23 797 aa13.26□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 C130060K24RikG3UWA8 416 aa13.25□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Inf2Q0GNC1 1273 aa13.25□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Yipf3Q3UDR8 347 aa13.25□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Dab2ipQ3UHC7 1189 aa13.25□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 RhocQ62159 193 aa13.25□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Stx3Q64704 289 aa13.25□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Skida1Q80YR3 822 aa13.25□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Disc1Q811T9 852 aa13.25□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 IscuQ9D7P6 168 aa13.25□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 EvplQ9D952 2035 aa13.25□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr456B2RT27 312 aa13.25□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 AmhP27106 555 aa13.25□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Hsd17b1P51656 344 aa13.25□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mrgprx2Q3UG50 352 aa13.25□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ccdc61Q3UJV1 511 aa13.25□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ptpn14Q62130 1189 aa13.25□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tfe3Q64092 572 aaKnown RBP13.25□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ppm1nQ8BGL1 404 aa13.25□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Slc9a9Q8BZ00 644 aa13.25□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rbm34Q8C5L7 375 aaKnown RBP13.25□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 P3h2Q8CG71 703 aa13.25□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Defb19Q8K3I8 83 aa13.25□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tesk2Q8VCT9 570 aa13.25□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr458Q8VF80 313 aa13.25□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr457Q8VGP5 313 aa13.25□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 FtcdQ91XD4 541 aa13.25□□□□□ -0.29
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Kcnq4Q9JK97 696 aa13.25□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 26.6 ms