RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640726.1

SLC35A3-223, Transcript of solute carrier family 35 member A3, human

TSL 5

Gene SLC35A3, Length 1,636 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SLC35A3-223	ENST00000640726	TMEM94	Q12767	1356 aa		30.23	■■■□□ 2.43
SLC35A3-223	ENST00000640726	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		30.23	■■■□□ 2.43
SLC35A3-223	ENST00000640726	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		30.23	■■■□□ 2.43
SLC35A3-223	ENST00000640726	NCOA3	Q9Y6Q9	1424 aa		30.22	■■■□□ 2.43
SLC35A3-223	ENST00000640726	SIPA1L2	Q9P2F8	1722 aa	Predicted RBP	30.22	■■■□□ 2.43
SLC35A3-223	ENST00000640726	MINK1	Q8N4C8	1332 aa	Predicted RBP	30.22	■■■□□ 2.43
SLC35A3-223	ENST00000640726	C14orf37	Q86TY3	774 aa		30.18	■■■□□ 2.42
SLC35A3-223	ENST00000640726	ADGRL3	Q9HAR2	1447 aa		30.17	■■■□□ 2.42
SLC35A3-223	ENST00000640726	XIRP1	Q702N8	1843 aa	Known RBP	30.17	■■■□□ 2.42
SLC35A3-223	ENST00000640726	NALCN	Q8IZF0	1738 aa		30.16	■■■□□ 2.42
SLC35A3-223	ENST00000640726	TMF1	P82094	1093 aa		30.15	■■■□□ 2.42
SLC35A3-223	ENST00000640726	ADGRB2	O60241	1585 aa		30.14	■■■□□ 2.42
SLC35A3-223	ENST00000640726	C19orf44	Q9H6X5	657 aa		30.14	■■■□□ 2.41
SLC35A3-223	ENST00000640726	EVC2	Q86UK5	1308 aa		30.13	■■■□□ 2.41
SLC35A3-223	ENST00000640726	WASL	O00401	505 aa	Predicted RBP	30.11	■■■□□ 2.41
SLC35A3-223	ENST00000640726	TULP4	Q9NRJ4	1543 aa		30.1	■■■□□ 2.41
SLC35A3-223	ENST00000640726	DISP3	Q9P2K9	1392 aa		30.09	■■■□□ 2.41
SLC35A3-223	ENST00000640726	CDK19	Q9BWU1	502 aa		30.09	■■■□□ 2.41
SLC35A3-223	ENST00000640726	MSH6	P52701	1360 aa		30.08	■■■□□ 2.41
SLC35A3-223	ENST00000640726	CDC42BPG	Q6DT37	1551 aa		30.08	■■■□□ 2.41
SLC35A3-223	ENST00000640726	CDCA8	Q53HL2	280 aa		30.07	■■■□□ 2.4
SLC35A3-223	ENST00000640726	C11orf95	C9JLR9	678 aa	Predicted RBP	30.06	■■■□□ 2.4
SLC35A3-223	ENST00000640726	DCC	P43146	1447 aa		30.05	■■■□□ 2.4
SLC35A3-223	ENST00000640726	SRPK2	P78362	688 aa	Known RBP	30.05	■■■□□ 2.4
SLC35A3-223	ENST00000640726	PUS7	Q96PZ0	661 aa	Known RBP	30.04	■■■□□ 2.4
SLC35A3-223	ENST00000640726	ZNF316	A6NFI3	1004 aa	Predicted RBP	30.04	■■■□□ 2.4
SLC35A3-223	ENST00000640726	ATF3	P18847	181 aa		30.04	■■■□□ 2.4
SLC35A3-223	ENST00000640726	CABP2	Q9NPB3	220 aa		30.04	■■■□□ 2.4
SLC35A3-223	ENST00000640726	CADPS2	Q86UW7	1296 aa		30.02	■■■□□ 2.4
SLC35A3-223	ENST00000640726	FMN2	Q9NZ56	1722 aa		30.01	■■■□□ 2.39
SLC35A3-223	ENST00000640726	KIF7	Q2M1P5	1343 aa		29.99	■■■□□ 2.39
SLC35A3-223	ENST00000640726	WASHC2A	Q641Q2	1341 aa		29.97	■■■□□ 2.39
SLC35A3-223	ENST00000640726	NUTM2F	A1L443	756 aa		29.97	■■■□□ 2.39
SLC35A3-223	ENST00000640726	CCDC7	Q96M83	1385 aa		29.97	■■■□□ 2.39
SLC35A3-223	ENST00000640726	NUDT16	Q96DE0	195 aa	Known RBP	29.96	■■■□□ 2.39
SLC35A3-223	ENST00000640726	ATAD2	Q6PL18	1390 aa		29.96	■■■□□ 2.39
SLC35A3-223	ENST00000640726	POLR3GL	Q9BT43	218 aa		29.96	■■■□□ 2.39
SLC35A3-223	ENST00000640726	ANKAR	Q7Z5J8	1434 aa		29.96	■■■□□ 2.39
SLC35A3-223	ENST00000640726	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		29.95	■■■□□ 2.39
SLC35A3-223	ENST00000640726	CERK	Q8TCT0	537 aa		29.95	■■■□□ 2.38
SLC35A3-223	ENST00000640726	PRR36	Q9H6K5	1346 aa		29.94	■■■□□ 2.38
SLC35A3-223	ENST00000640726	ATP7B	P35670	1465 aa		29.94	■■■□□ 2.38
SLC35A3-223	ENST00000640726	CCDC61	Q9Y6R9	512 aa		29.93	■■■□□ 2.38
SLC35A3-223	ENST00000640726	USP32	Q8NFA0	1604 aa		29.93	■■■□□ 2.38
SLC35A3-223	ENST00000640726	RGPD8	O14715	1765 aa	Predicted RBP	29.92	■■■□□ 2.38
SLC35A3-223	ENST00000640726	MST1R	Q04912	1400 aa		29.92	■■■□□ 2.38
SLC35A3-223	ENST00000640726	C1orf167	Q5SNV9	1468 aa		29.89	■■■□□ 2.38
SLC35A3-223	ENST00000640726	SLAIN2	Q9P270	581 aa		29.89	■■■□□ 2.37
SLC35A3-223	ENST00000640726	ITSN1	Q15811	1721 aa		29.88	■■■□□ 2.37
SLC35A3-223	ENST00000640726	TMC1	Q8TDI8	760 aa		29.87	■■■□□ 2.37
SLC35A3-223	ENST00000640726	CABP1	Q9NZU7	370 aa		29.86	■■■□□ 2.37
SLC35A3-223	ENST00000640726	TOPAZ1	Q8N9V7	1692 aa		29.86	■■■□□ 2.37
SLC35A3-223	ENST00000640726	NINL	Q9Y2I6	1382 aa		29.86	■■■□□ 2.37
SLC35A3-223	ENST00000640726	PPIP5K1	Q6PFW1	1433 aa		29.86	■■■□□ 2.37
SLC35A3-223	ENST00000640726	ESCO1	Q5FWF5	840 aa		29.85	■■■□□ 2.37
SLC35A3-223	ENST00000640726	SLC12A5	Q9H2X9	1139 aa		29.85	■■■□□ 2.37
SLC35A3-223	ENST00000640726	TOM1	O60784	492 aa		29.83	■■■□□ 2.37
SLC35A3-223	ENST00000640726	MYOM1	P52179	1685 aa		29.83	■■■□□ 2.37
SLC35A3-223	ENST00000640726	PLEKHG3	A1L390	1219 aa		29.82	■■■□□ 2.36
SLC35A3-223	ENST00000640726	ORAI2	Q96SN7	254 aa		29.82	■■■□□ 2.36
SLC35A3-223	ENST00000640726	PHF8	Q9UPP1	1060 aa		29.81	■■■□□ 2.36
SLC35A3-223	ENST00000640726	PMFBP1	Q8TBY8	1022 aa		29.79	■■■□□ 2.36
SLC35A3-223	ENST00000640726	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		29.78	■■■□□ 2.36
SLC35A3-223	ENST00000640726	BRINP3	Q76B58	766 aa		29.76	■■■□□ 2.35
SLC35A3-223	ENST00000640726	TERF2IP	Q9NYB0	399 aa		29.76	■■■□□ 2.35
SLC35A3-223	ENST00000640726	ACE	P12821	1306 aa		29.75	■■■□□ 2.35
SLC35A3-223	ENST00000640726	KIF1A	Q12756	1690 aa		29.75	■■■□□ 2.35
SLC35A3-223	ENST00000640726	NGDN	Q8NEJ9	315 aa	Known RBP	29.75	■■■□□ 2.35
SLC35A3-223	ENST00000640726	POLR3A	O14802	1390 aa	Predicted RBP	29.74	■■■□□ 2.35
SLC35A3-223	ENST00000640726	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	29.74	■■■□□ 2.35
SLC35A3-223	ENST00000640726	HDGFL2	Q7Z4V5	671 aa	Predicted RBP	29.74	■■■□□ 2.35
SLC35A3-223	ENST00000640726	ANKRD36B	Q8N2N9	1353 aa		29.74	■■■□□ 2.35
SLC35A3-223	ENST00000640726	CD163L1	Q9NR16	1453 aa		29.73	■■■□□ 2.35
SLC35A3-223	ENST00000640726	ZNF692	Q9BU19	519 aa	Predicted RBP	29.73	■■■□□ 2.35
SLC35A3-223	ENST00000640726	PANK3	Q9H999	370 aa		29.73	■■■□□ 2.35
SLC35A3-223	ENST00000640726	CPSF1	Q10570	1443 aa	Known RBP	29.72	■■■□□ 2.35
SLC35A3-223	ENST00000640726		A0A1W2PP64	1363 aa		29.71	■■■□□ 2.35
SLC35A3-223	ENST00000640726	FOXO3	O43524	673 aa		29.71	■■■□□ 2.35
SLC35A3-223	ENST00000640726	AKAP12	Q02952	1782 aa		29.7	■■■□□ 2.34
SLC35A3-223	ENST00000640726	ROBO1	Q9Y6N7	1651 aa		29.68	■■■□□ 2.34
SLC35A3-223	ENST00000640726	KTN1	Q86UP2	1357 aa	Known RBP	29.68	■■■□□ 2.34
SLC35A3-223	ENST00000640726	PIP4K2B	P78356	416 aa		29.67	■■■□□ 2.34
SLC35A3-223	ENST00000640726	PSME1	Q06323	249 aa		29.67	■■■□□ 2.34
SLC35A3-223	ENST00000640726	NPHP3	Q7Z494	1330 aa		29.66	■■■□□ 2.34
SLC35A3-223	ENST00000640726	MON2	Q7Z3U7	1717 aa		29.65	■■■□□ 2.34
SLC35A3-223	ENST00000640726	CARD14	Q9BXL6	1004 aa		29.64	■■■□□ 2.34
SLC35A3-223	ENST00000640726	USP6	P35125	1406 aa		29.64	■■■□□ 2.34
SLC35A3-223	ENST00000640726	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	29.63	■■■□□ 2.33
SLC35A3-223	ENST00000640726	DDX17	Q92841	729 aa	Known RBP	29.62	■■■□□ 2.33
SLC35A3-223	ENST00000640726	PER1	O15534	1290 aa	Predicted RBP	29.61	■■■□□ 2.33
SLC35A3-223	ENST00000640726	KRT28	Q7Z3Y7	464 aa		29.61	■■■□□ 2.33
SLC35A3-223	ENST00000640726	NHSL1	Q5SYE7	1610 aa		29.61	■■■□□ 2.33
SLC35A3-223	ENST00000640726	EDC4	Q6P2E9	1401 aa	Known RBP	29.6	■■■□□ 2.33
SLC35A3-223	ENST00000640726	BRD4	O60885	1362 aa	Predicted RBP	29.6	■■■□□ 2.33
SLC35A3-223	ENST00000640726	NSD3	Q9BZ95	1437 aa		29.6	■■■□□ 2.33
SLC35A3-223	ENST00000640726	XPC	Q01831	940 aa	Predicted RBP	29.59	■■■□□ 2.33
SLC35A3-223	ENST00000640726	KNSTRN	Q9Y448	316 aa		29.59	■■■□□ 2.33
SLC35A3-223	ENST00000640726	SSH2	Q76I76	1423 aa		29.58	■■■□□ 2.33
SLC35A3-223	ENST00000640726	SOS2	Q07890	1332 aa	Predicted RBP	29.57	■■■□□ 2.32
SLC35A3-223	ENST00000640726	NRK	Q7Z2Y5	1582 aa		29.56	■■■□□ 2.32

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