RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629113.1

LEMD1-210, Transcript of LEM domain containing 1, humanhuman

TSL 4

Gene LEMD1, Length 314 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LEMD1-210ENST00000629113 PIK3C2GO75747 1445 aa41.62■■■■■ 4.25
LEMD1-210ENST00000629113 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP41.62■■■■■ 4.25
LEMD1-210ENST00000629113 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa41.61■■■■■ 4.25
LEMD1-210ENST00000629113 C8orf37Q96NL8 207 aa41.59■■■■■ 4.25
LEMD1-210ENST00000629113 TECPR2O15040 1411 aa41.59■■■■■ 4.25
LEMD1-210ENST00000629113 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa41.58■■■■■ 4.25
LEMD1-210ENST00000629113 NUTM2FA1L443 756 aa41.57■■■■■ 4.25
LEMD1-210ENST00000629113 ESCO1Q5FWF5 840 aa41.57■■■■■ 4.25
LEMD1-210ENST00000629113 ABCC11Q96J66 1382 aa41.57■■■■■ 4.25
LEMD1-210ENST00000629113 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP41.55■■■■■ 4.24
LEMD1-210ENST00000629113 RXRBP28702 533 aa41.55■■■■■ 4.24
LEMD1-210ENST00000629113 ADAMTS2O95450 1211 aa41.54■■■■■ 4.24
LEMD1-210ENST00000629113 KNDC1Q76NI1 1749 aa41.53■■■■■ 4.24
LEMD1-210ENST00000629113 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP41.52■■■■■ 4.24
LEMD1-210ENST00000629113 CFAP70Q5T0N1 1121 aa41.51■■■■■ 4.24
LEMD1-210ENST00000629113 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP41.51■■■■■ 4.24
LEMD1-210ENST00000629113 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP41.49■■■■■ 4.23
LEMD1-210ENST00000629113 FOXO3O43524 673 aa41.47■■■■■ 4.23
LEMD1-210ENST00000629113 NRXN1Q9ULB1 1477 aa41.46■■■■■ 4.23
LEMD1-210ENST00000629113 NGLY1Q96IV0 654 aa41.45■■■■■ 4.23
LEMD1-210ENST00000629113 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP41.44■■■■■ 4.22
LEMD1-210ENST00000629113 NPHP3Q7Z494 1330 aa41.44■■■■■ 4.22
LEMD1-210ENST00000629113 MYOM2P54296 1465 aa41.42■■■■■ 4.22
LEMD1-210ENST00000629113 PXDNQ92626 1479 aa41.42■■■■■ 4.22
LEMD1-210ENST00000629113 FMN2Q9NZ56 1722 aa41.39■■■■■ 4.22
LEMD1-210ENST00000629113 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP41.38■■■■■ 4.21
LEMD1-210ENST00000629113 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP41.37■■■■■ 4.21
LEMD1-210ENST00000629113 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP41.36■■■■■ 4.21
LEMD1-210ENST00000629113 SIRT1Q96EB6 747 aa41.36■■■■■ 4.21
LEMD1-210ENST00000629113 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP41.35■■■■■ 4.21
LEMD1-210ENST00000629113 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP41.35■■■■■ 4.21
LEMD1-210ENST00000629113 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP41.33■■■■■ 4.21
LEMD1-210ENST00000629113 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP41.32■■■■■ 4.2
LEMD1-210ENST00000629113 PRAM1Q96QH2 718 aa41.31■■■■■ 4.2
LEMD1-210ENST00000629113 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa41.31■■■■■ 4.2
LEMD1-210ENST00000629113 RGS12O14924 1447 aa41.3■■■■■ 4.2
LEMD1-210ENST00000629113 USP21Q9UK80 565 aa41.3■■■■■ 4.2
LEMD1-210ENST00000629113 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP41.25■■■■■ 4.19
LEMD1-210ENST00000629113 DCAF11Q8TEB1 546 aa41.23■■■■■ 4.19
LEMD1-210ENST00000629113 KRT28Q7Z3Y7 464 aa41.22■■■■■ 4.19
LEMD1-210ENST00000629113 KIF1AQ12756 1690 aa41.22■■■■■ 4.19
LEMD1-210ENST00000629113 POGKQ9P215 609 aa41.21■■■■■ 4.19
LEMD1-210ENST00000629113 ADGRB1O14514 1584 aa41.2■■■■■ 4.19
LEMD1-210ENST00000629113 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa41.19■■■■■ 4.19
LEMD1-210ENST00000629113 HRCP23327 699 aa41.19■■■■■ 4.18
LEMD1-210ENST00000629113 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP41.19■■■■■ 4.18
LEMD1-210ENST00000629113 PHF8Q9UPP1 1060 aa41.19■■■■■ 4.18
LEMD1-210ENST00000629113 TRAK1Q9UPV9 953 aa41.19■■■■■ 4.18
LEMD1-210ENST00000629113 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP41.18■■■■■ 4.18
LEMD1-210ENST00000629113 DLC1Q96QB1 1528 aa41.18■■■■■ 4.18
LEMD1-210ENST00000629113 ATRNO75882 1429 aa41.15■■■■■ 4.18
LEMD1-210ENST00000629113 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP41.13■■■■■ 4.17
LEMD1-210ENST00000629113 BCL9LQ86UU0 1499 aa41.12■■■■■ 4.17
LEMD1-210ENST00000629113 PLEKHG5O94827 1062 aa41.1■■■■■ 4.17
LEMD1-210ENST00000629113 USP32Q8NFA0 1604 aa41.1■■■■■ 4.17
LEMD1-210ENST00000629113 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa41.09■■■■■ 4.17
LEMD1-210ENST00000629113 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP41.08■■■■■ 4.17
LEMD1-210ENST00000629113 CABLES1Q8TDN4 633 aa41.06■■■■■ 4.16
LEMD1-210ENST00000629113 PSME1Q06323 249 aa41.05■■■■■ 4.16
LEMD1-210ENST00000629113 ADGRB2O60241 1585 aa41.04■■■■■ 4.16
LEMD1-210ENST00000629113 TNS3Q68CZ2 1445 aa41.04■■■■■ 4.16
LEMD1-210ENST00000629113 LMOD2Q6P5Q4 547 aa41.01■■■■■ 4.16
LEMD1-210ENST00000629113 ANKARQ7Z5J8 1434 aa41.01■■■■■ 4.15
LEMD1-210ENST00000629113 PRR36Q9H6K5 1346 aa41■■■■■ 4.15
LEMD1-210ENST00000629113 STAC3Q96MF2 364 aa40.98■■■■■ 4.15
LEMD1-210ENST00000629113 SBNO1A3KN83 1393 aa40.98■■■■■ 4.15
LEMD1-210ENST00000629113 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP40.97■■■■■ 4.15
LEMD1-210ENST00000629113 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP40.96■■■■■ 4.15
LEMD1-210ENST00000629113 SLIT2O94813 1529 aa40.96■■■■■ 4.15
LEMD1-210ENST00000629113 UNC5CLQ8IV45 518 aa40.95■■■■■ 4.15
LEMD1-210ENST00000629113 WASLO00401 505 aaPredicted RBP40.94■■■■■ 4.14
LEMD1-210ENST00000629113 ATAD2Q6PL18 1390 aa40.92■■■■■ 4.14
LEMD1-210ENST00000629113 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP40.92■■■■■ 4.14
LEMD1-210ENST00000629113 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP40.9■■■■■ 4.14
LEMD1-210ENST00000629113 ABCA3Q99758 1704 aa40.9■■■■■ 4.14
LEMD1-210ENST00000629113 TULP4Q9NRJ4 1543 aa40.89■■■■■ 4.14
LEMD1-210ENST00000629113 ARHGEF10O15013 1369 aa40.87■■■■■ 4.13
LEMD1-210ENST00000629113 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP40.87■■■■■ 4.13
LEMD1-210ENST00000629113 GLI3P10071 1580 aa40.86■■■■■ 4.13
LEMD1-210ENST00000629113 RALGAPBQ86X10 1494 aa40.86■■■■■ 4.13
LEMD1-210ENST00000629113 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP40.84■■■■■ 4.13
LEMD1-210ENST00000629113 PLCH1Q4KWH8 1693 aa40.82■■■■■ 4.12
LEMD1-210ENST00000629113 FAM83GA6ND36 823 aa40.81■■■■■ 4.12
LEMD1-210ENST00000629113 GPRASP1Q5JY77 1395 aa40.81■■■■■ 4.12
LEMD1-210ENST00000629113 ALS2Q96Q42 1657 aa40.79■■■■■ 4.12
LEMD1-210ENST00000629113 NBPF1Q3BBV0 1214 aa40.79■■■■■ 4.12
LEMD1-210ENST00000629113 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP40.79■■■■■ 4.12
LEMD1-210ENST00000629113 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP40.77■■■■■ 4.12
LEMD1-210ENST00000629113 VPS72Q15906 364 aa40.75■■■■■ 4.11
LEMD1-210ENST00000629113 NWD2Q9ULI1 1742 aa40.74■■■■■ 4.11
LEMD1-210ENST00000629113 CDK19Q9BWU1 502 aa40.74■■■■■ 4.11
LEMD1-210ENST00000629113 ATP7BP35670 1465 aa40.74■■■■■ 4.11
LEMD1-210ENST00000629113 BRWD3Q6RI45 1802 aa40.73■■■■■ 4.11
LEMD1-210ENST00000629113 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP40.73■■■■■ 4.11
LEMD1-210ENST00000629113 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa40.73■■■■■ 4.11
LEMD1-210ENST00000629113 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP40.72■■■■■ 4.11
LEMD1-210ENST00000629113 SEPT12Q8IYM1 358 aa40.69■■■■■ 4.1
LEMD1-210ENST00000629113 ITSN1Q15811 1721 aa40.67■■■■■ 4.1
LEMD1-210ENST00000629113 EP400Q96L91 3159 aa40.67■■■■■ 4.1
LEMD1-210ENST00000629113 BTG4Q9NY30 223 aa40.64■■■■■ 4.1
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