RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620385.1

CTXN3-204, Transcript of cortexin 3, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene CTXN3, Length 1,208 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3-204ENST00000620385 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP12.22□□□□□ -0.45
CTXN3-204ENST00000620385 GRXCR2A6NFK2 248 aa12.21□□□□□ -0.45
CTXN3-204ENST00000620385 COPS2P61201 443 aa12.21□□□□□ -0.45
CTXN3-204ENST00000620385 DISP1Q96F81 1524 aa12.2□□□□□ -0.46
CTXN3-204ENST00000620385 HDGFP51858 240 aaKnown RBP12.18□□□□□ -0.46
CTXN3-204ENST00000620385 ITSN2Q9NZM3 1697 aa12.18□□□□□ -0.46
CTXN3-204ENST00000620385 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa12.18□□□□□ -0.46
CTXN3-204ENST00000620385 ADCY10Q96PN6 1610 aa12.18□□□□□ -0.46
CTXN3-204ENST00000620385 MTUS2Q5JR59 1369 aa12.18□□□□□ -0.46
CTXN3-204ENST00000620385 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP12.17□□□□□ -0.46
CTXN3-204ENST00000620385 GGCXP38435 758 aa12.17□□□□□ -0.46
CTXN3-204ENST00000620385 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP12.17□□□□□ -0.46
CTXN3-204ENST00000620385 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP12.17□□□□□ -0.46
CTXN3-204ENST00000620385 TRIM67Q6ZTA4 783 aa12.17□□□□□ -0.46
CTXN3-204ENST00000620385 FGD6Q6ZV73 1430 aa12.17□□□□□ -0.46
CTXN3-204ENST00000620385 OSBPP22059 807 aa12.16□□□□□ -0.46
CTXN3-204ENST00000620385 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP12.16□□□□□ -0.46
CTXN3-204ENST00000620385 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP12.15□□□□□ -0.46
CTXN3-204ENST00000620385 MYOM3Q5VTT5 1437 aa12.15□□□□□ -0.46
CTXN3-204ENST00000620385 TMUB1Q9BVT8 246 aa12.15□□□□□ -0.46
CTXN3-204ENST00000620385 PHLDB1Q86UU1 1377 aa12.15□□□□□ -0.46
CTXN3-204ENST00000620385 SHROOM2Q13796 1616 aa12.15□□□□□ -0.47
CTXN3-204ENST00000620385 NCOA2Q15596 1464 aa12.14□□□□□ -0.47
CTXN3-204ENST00000620385 CHD1O14646 1710 aa12.14□□□□□ -0.47
CTXN3-204ENST00000620385 AKNAQ7Z591 1439 aa12.14□□□□□ -0.47
CTXN3-204ENST00000620385 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP12.14□□□□□ -0.47
CTXN3-204ENST00000620385 GCC2Q8IWJ2 1684 aa12.13□□□□□ -0.47
CTXN3-204ENST00000620385 MIA2Q96PC5 1412 aa12.13□□□□□ -0.47
CTXN3-204ENST00000620385 PTPN23Q9H3S7 1636 aa12.13□□□□□ -0.47
CTXN3-204ENST00000620385 ZPR1O75312 459 aa12.13□□□□□ -0.47
CTXN3-204ENST00000620385 TTC13Q8NBP0 860 aa12.13□□□□□ -0.47
CTXN3-204ENST00000620385 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP12.13□□□□□ -0.47
CTXN3-204ENST00000620385 SLF2Q8IX21 1173 aa12.11□□□□□ -0.47
CTXN3-204ENST00000620385 NECTIN2Q92692 538 aa12.11□□□□□ -0.47
CTXN3-204ENST00000620385 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP12.11□□□□□ -0.47
CTXN3-204ENST00000620385 E2F4Q16254 413 aa12.1□□□□□ -0.47
CTXN3-204ENST00000620385 PADI6Q6TGC4 694 aa12.1□□□□□ -0.47
CTXN3-204ENST00000620385 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP12.1□□□□□ -0.47
CTXN3-204ENST00000620385 ABCA8O94911 1581 aa12.09□□□□□ -0.47
CTXN3-204ENST00000620385 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP12.09□□□□□ -0.47
CTXN3-204ENST00000620385 RNF223E7ERA6 249 aa12.09□□□□□ -0.47
CTXN3-204ENST00000620385 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa12.09□□□□□ -0.47
CTXN3-204ENST00000620385 SLC19A1P41440 591 aa12.08□□□□□ -0.48
CTXN3-204ENST00000620385 MYT1Q01538 1121 aa12.08□□□□□ -0.48
CTXN3-204ENST00000620385 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP12.08□□□□□ -0.48
CTXN3-204ENST00000620385 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP12.08□□□□□ -0.48
CTXN3-204ENST00000620385 POTECB2RU33 542 aa12.07□□□□□ -0.48
CTXN3-204ENST00000620385 SLC24A1O60721 1099 aa12.07□□□□□ -0.48
CTXN3-204ENST00000620385 SETD5Q9C0A6 1442 aa12.07□□□□□ -0.48
CTXN3-204ENST00000620385 KIF14Q15058 1648 aa12.07□□□□□ -0.48
CTXN3-204ENST00000620385 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP12.06□□□□□ -0.48
CTXN3-204ENST00000620385 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP12.06□□□□□ -0.48
CTXN3-204ENST00000620385 HFM1A2PYH4 1435 aa12.06□□□□□ -0.48
CTXN3-204ENST00000620385 P3H3Q8IVL6 736 aa12.06□□□□□ -0.48
CTXN3-204ENST00000620385 PKDCCQ504Y2 493 aa12.05□□□□□ -0.48
CTXN3-204ENST00000620385 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa12.05□□□□□ -0.48
CTXN3-204ENST00000620385 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa12.05□□□□□ -0.48
CTXN3-204ENST00000620385 ADGBQ8N7X0 1667 aa12.04□□□□□ -0.48
CTXN3-204ENST00000620385 TLL1O43897 1013 aa12.04□□□□□ -0.48
CTXN3-204ENST00000620385 EYA1Q99502 592 aa12.04□□□□□ -0.48
CTXN3-204ENST00000620385 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP12.04□□□□□ -0.48
CTXN3-204ENST00000620385 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP12.04□□□□□ -0.48
CTXN3-204ENST00000620385 CROCC2H7BZ55 1655 aa12.03□□□□□ -0.48
CTXN3-204ENST00000620385 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP12.03□□□□□ -0.48
CTXN3-204ENST00000620385 SPRYD7Q5W111 196 aa12.03□□□□□ -0.48
CTXN3-204ENST00000620385 CLASP1Q7Z460 1538 aa12.02□□□□□ -0.48
CTXN3-204ENST00000620385 DGAT1O75907 488 aa12.02□□□□□ -0.49
CTXN3-204ENST00000620385 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa12.02□□□□□ -0.49
CTXN3-204ENST00000620385 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP12.01□□□□□ -0.49
CTXN3-204ENST00000620385 PRR20EP86478 221 aa12□□□□□ -0.49
CTXN3-204ENST00000620385 PRR20CP86479 221 aa12□□□□□ -0.49
CTXN3-204ENST00000620385 PRR20DP86480 221 aa12□□□□□ -0.49
CTXN3-204ENST00000620385 PRR20BP86481 221 aa12□□□□□ -0.49
CTXN3-204ENST00000620385 PRR20AP86496 221 aa12□□□□□ -0.49
CTXN3-204ENST00000620385 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
CTXN3-204ENST00000620385 PRR14Q9BWN1 585 aa12□□□□□ -0.49
CTXN3-204ENST00000620385 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP12□□□□□ -0.49
CTXN3-204ENST00000620385 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
CTXN3-204ENST00000620385 SLC4A3P48751 1232 aa11.99□□□□□ -0.49
CTXN3-204ENST00000620385 MAPKBP1O60336 1514 aa11.98□□□□□ -0.49
CTXN3-204ENST00000620385 LIAT1Q6ZQX7 453 aa11.98□□□□□ -0.49
CTXN3-204ENST00000620385 UACAQ9BZF9 1416 aa11.97□□□□□ -0.49
CTXN3-204ENST00000620385 ROCK1Q13464 1354 aa11.97□□□□□ -0.49
CTXN3-204ENST00000620385 ANKLE1Q8NAG6 615 aa11.97□□□□□ -0.49
CTXN3-204ENST00000620385 PLB1Q6P1J6 1458 aa11.96□□□□□ -0.49
CTXN3-204ENST00000620385 SHANK2Q9UPX8 1470 aa11.96□□□□□ -0.49
CTXN3-204ENST00000620385 S1PR4O95977 384 aa11.96□□□□□ -0.49
CTXN3-204ENST00000620385 ZNF697Q5TEC3 545 aa11.96□□□□□ -0.49
CTXN3-204ENST00000620385 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa11.96□□□□□ -0.49
CTXN3-204ENST00000620385 ABCC2Q92887 1545 aa11.96□□□□□ -0.5
CTXN3-204ENST00000620385 TNFRSF10AO00220 468 aa11.95□□□□□ -0.5
CTXN3-204ENST00000620385 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
CTXN3-204ENST00000620385 PREX2Q70Z35 1606 aa11.95□□□□□ -0.5
CTXN3-204ENST00000620385 FAM187AA6NFU0 413 aa11.94□□□□□ -0.5
CTXN3-204ENST00000620385 GDF9O60383 454 aa11.94□□□□□ -0.5
CTXN3-204ENST00000620385 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa11.94□□□□□ -0.5
CTXN3-204ENST00000620385 NAIPQ13075 1403 aa11.94□□□□□ -0.5
CTXN3-204ENST00000620385 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
CTXN3-204ENST00000620385 WDR70Q9NW82 654 aa11.93□□□□□ -0.5
CTXN3-204ENST00000620385 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa11.93□□□□□ -0.5
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