RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617119.4

UBE2V1-223, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 V1, human

TSL 4 BASIC

Gene UBE2V1, Length 2,432 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBE2V1-223	ENST00000617119	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		11.27	□□□□□ -0.61
UBE2V1-223	ENST00000617119	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		11.26	□□□□□ -0.61
UBE2V1-223	ENST00000617119	TBC1D2	Q9BYX2	928 aa		11.26	□□□□□ -0.61
UBE2V1-223	ENST00000617119	PDZRN3	Q9UPQ7	1066 aa		11.26	□□□□□ -0.61
UBE2V1-223	ENST00000617119	KIF1B	O60333	1816 aa		11.25	□□□□□ -0.61
UBE2V1-223	ENST00000617119	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		11.25	□□□□□ -0.61
UBE2V1-223	ENST00000617119	CANX	P27824	592 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61
UBE2V1-223	ENST00000617119	NEUROD2	Q15784	382 aa		11.25	□□□□□ -0.61
UBE2V1-223	ENST00000617119	BCL2L13	Q9BXK5	485 aa		11.25	□□□□□ -0.61
UBE2V1-223	ENST00000617119	MYOM2	P54296	1465 aa		11.25	□□□□□ -0.61
UBE2V1-223	ENST00000617119	AFAP1	Q8N556	730 aa		11.25	□□□□□ -0.61
UBE2V1-223	ENST00000617119	BECN1	Q14457	450 aa		11.24	□□□□□ -0.61
UBE2V1-223	ENST00000617119	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		11.24	□□□□□ -0.61
UBE2V1-223	ENST00000617119	NGEF	Q8N5V2	710 aa		11.24	□□□□□ -0.61
UBE2V1-223	ENST00000617119	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
UBE2V1-223	ENST00000617119	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
UBE2V1-223	ENST00000617119	TCP11L2	Q8N4U5	519 aa		11.23	□□□□□ -0.61
UBE2V1-223	ENST00000617119	STAC3	Q96MF2	364 aa		11.23	□□□□□ -0.61
UBE2V1-223	ENST00000617119	ZMYND15	Q9H091	742 aa		11.23	□□□□□ -0.61
UBE2V1-223	ENST00000617119	QRICH2	Q9H0J4	1663 aa		11.23	□□□□□ -0.61
UBE2V1-223	ENST00000617119	NSD3	Q9BZ95	1437 aa		11.23	□□□□□ -0.61
UBE2V1-223	ENST00000617119	NRXN1	Q9ULB1	1477 aa		11.23	□□□□□ -0.61
UBE2V1-223	ENST00000617119	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
UBE2V1-223	ENST00000617119	ZMYM3	Q14202	1370 aa		11.22	□□□□□ -0.61
UBE2V1-223	ENST00000617119	L1TD1	Q5T7N2	865 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
UBE2V1-223	ENST00000617119	VSIG10	Q8N0Z9	540 aa		11.21	□□□□□ -0.61
UBE2V1-223	ENST00000617119	SPRYD3	Q8NCJ5	442 aa		11.21	□□□□□ -0.61
UBE2V1-223	ENST00000617119	PMFBP1	Q8TBY8	1022 aa		11.21	□□□□□ -0.61
UBE2V1-223	ENST00000617119	RUNDC1	Q96C34	613 aa		11.21	□□□□□ -0.61
UBE2V1-223	ENST00000617119	USP32	Q8NFA0	1604 aa		11.21	□□□□□ -0.62
UBE2V1-223	ENST00000617119	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		11.21	□□□□□ -0.62
UBE2V1-223	ENST00000617119	ATP7A	Q04656	1500 aa		11.2	□□□□□ -0.62
UBE2V1-223	ENST00000617119	XRCC6	P12956	609 aa	Known RBP eCLIP	11.2	□□□□□ -0.62
UBE2V1-223	ENST00000617119	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
UBE2V1-223	ENST00000617119	FSD2	A1L4K1	749 aa		11.2	□□□□□ -0.62
UBE2V1-223	ENST00000617119	SBNO2	Q9Y2G9	1366 aa		11.2	□□□□□ -0.62
UBE2V1-223	ENST00000617119	ADGRB2	O60241	1585 aa		11.2	□□□□□ -0.62
UBE2V1-223	ENST00000617119	PANK2	Q9BZ23	570 aa		11.19	□□□□□ -0.62
UBE2V1-223	ENST00000617119	SLC12A5	Q9H2X9	1139 aa		11.19	□□□□□ -0.62
UBE2V1-223	ENST00000617119	RRP9	O43818	475 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
UBE2V1-223	ENST00000617119	MORC1	Q86VD1	984 aa		11.19	□□□□□ -0.62
UBE2V1-223	ENST00000617119	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		11.18	□□□□□ -0.62
UBE2V1-223	ENST00000617119	KANK1	Q14678	1352 aa		11.18	□□□□□ -0.62
UBE2V1-223	ENST00000617119	WDR63	Q8IWG1	891 aa		11.18	□□□□□ -0.62
UBE2V1-223	ENST00000617119	ARX	Q96QS3	562 aa		11.18	□□□□□ -0.62
UBE2V1-223	ENST00000617119	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		11.18	□□□□□ -0.62
UBE2V1-223	ENST00000617119	PPL	O60437	1756 aa		11.18	□□□□□ -0.62
UBE2V1-223	ENST00000617119	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
UBE2V1-223	ENST00000617119	SETBP1	Q9Y6X0	1596 aa		11.18	□□□□□ -0.62
UBE2V1-223	ENST00000617119	MCM4	P33991	863 aa		11.18	□□□□□ -0.62
UBE2V1-223	ENST00000617119	ADGRB1	O14514	1584 aa		11.17	□□□□□ -0.62
UBE2V1-223	ENST00000617119	HSP90AA2P	Q14568	343 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
UBE2V1-223	ENST00000617119	MVP	Q14764	893 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
UBE2V1-223	ENST00000617119	ADGRB3	O60242	1522 aa		11.17	□□□□□ -0.62
UBE2V1-223	ENST00000617119	NOS1	P29475	1434 aa		11.17	□□□□□ -0.62
UBE2V1-223	ENST00000617119	MTHFS	P49914	203 aa		11.17	□□□□□ -0.62
UBE2V1-223	ENST00000617119	AAMP	Q13685	434 aa		11.17	□□□□□ -0.62
UBE2V1-223	ENST00000617119	ZNF692	Q9BU19	519 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
UBE2V1-223	ENST00000617119	RWDD1	Q9H446	243 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
UBE2V1-223	ENST00000617119	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		11.17	□□□□□ -0.62
UBE2V1-223	ENST00000617119	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		11.17	□□□□□ -0.62
UBE2V1-223	ENST00000617119	KIF3B	O15066	747 aa		11.16	□□□□□ -0.62
UBE2V1-223	ENST00000617119	CLCN1	P35523	988 aa		11.16	□□□□□ -0.62
UBE2V1-223	ENST00000617119	CCDC27	Q2M243	656 aa		11.16	□□□□□ -0.62
UBE2V1-223	ENST00000617119	NAP1L5	Q96NT1	182 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
UBE2V1-223	ENST00000617119	GZF1	Q9H116	711 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
UBE2V1-223	ENST00000617119	PNN	Q9H307	717 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
UBE2V1-223	ENST00000617119	HSP90AA1	P07900	732 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
UBE2V1-223	ENST00000617119	UPF2	Q9HAU5	1272 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
UBE2V1-223	ENST00000617119	TSR2	Q969E8	191 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
UBE2V1-223	ENST00000617119	C22orf23	Q9BZE7	217 aa		11.15	□□□□□ -0.63
UBE2V1-223	ENST00000617119	TRAK1	Q9UPV9	953 aa		11.15	□□□□□ -0.63
UBE2V1-223	ENST00000617119	MFAP1	P55081	439 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
UBE2V1-223	ENST00000617119	CD109	Q6YHK3	1445 aa		11.14	□□□□□ -0.63
UBE2V1-223	ENST00000617119	NCOA3	Q9Y6Q9	1424 aa		11.14	□□□□□ -0.63
UBE2V1-223	ENST00000617119	TULP4	Q9NRJ4	1543 aa		11.13	□□□□□ -0.63
UBE2V1-223	ENST00000617119	GOLGA6L3	A6NEY3	463 aa		11.13	□□□□□ -0.63
UBE2V1-223	ENST00000617119	DDIT3	P35638	169 aa		11.13	□□□□□ -0.63
UBE2V1-223	ENST00000617119	DZIP1L	Q8IYY4	767 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
UBE2V1-223	ENST00000617119	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		11.13	□□□□□ -0.63
UBE2V1-223	ENST00000617119	ARHGEF28	Q8N1W1	1705 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
UBE2V1-223	ENST00000617119	TRIM27	P14373	513 aa		11.13	□□□□□ -0.63
UBE2V1-223	ENST00000617119	ZKSCAN2	Q63HK3	967 aa		11.13	□□□□□ -0.63
UBE2V1-223	ENST00000617119	TMEM132E	Q6IEE7	984 aa		11.13	□□□□□ -0.63
UBE2V1-223	ENST00000617119	TRAK2	O60296	914 aa		11.12	□□□□□ -0.63
UBE2V1-223	ENST00000617119	CHMP5	Q9NZZ3	219 aa		11.12	□□□□□ -0.63
UBE2V1-223	ENST00000617119	ADGRL1	O94910	1474 aa		11.12	□□□□□ -0.63
UBE2V1-223	ENST00000617119	EXOSC9	Q06265	439 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
UBE2V1-223	ENST00000617119	FANCA	O15360	1455 aa		11.11	□□□□□ -0.63
UBE2V1-223	ENST00000617119	COL3A1	P02461	1466 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
UBE2V1-223	ENST00000617119	HDAC1	Q13547	482 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
UBE2V1-223	ENST00000617119	SSH1	Q8WYL5	1049 aa		11.11	□□□□□ -0.63
UBE2V1-223	ENST00000617119	MYH16	Q9H6N6	1097 aa		11.11	□□□□□ -0.63
UBE2V1-223	ENST00000617119	GLI2	P10070	1586 aa		11.1	□□□□□ -0.63
UBE2V1-223	ENST00000617119	TRIM35	Q9UPQ4	493 aa		11.1	□□□□□ -0.63
UBE2V1-223	ENST00000617119	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		11.1	□□□□□ -0.63
UBE2V1-223	ENST00000617119	U2AF1L5	P0DN76	240 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
UBE2V1-223	ENST00000617119	U2AF1	Q01081	240 aa	Known RBP eCLIP	11.1	□□□□□ -0.63	5e-7	■■■■□ 21.6
UBE2V1-223	ENST00000617119	SMC5	Q8IY18	1101 aa		11.1	□□□□□ -0.63
UBE2V1-223	ENST00000617119	PLEKHF1	Q96S99	279 aa		11.1	□□□□□ -0.63

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