RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607519.1

GMDS-AS1-216, humanhuman

TSL 4

Gene GMDS-AS1, Length 579 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDS-AS1-216ENST00000607519 DLC1Q96QB1 1528 aa14.83□□□□□ -0.04
GMDS-AS1-216ENST00000607519 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
GMDS-AS1-216ENST00000607519 C19orf44Q9H6X5 657 aa14.82□□□□□ -0.04
GMDS-AS1-216ENST00000607519 USP47Q96K76 1375 aa14.82□□□□□ -0.04
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
GMDS-AS1-216ENST00000607519 TESK2Q96S53 571 aa14.8□□□□□ -0.04
GMDS-AS1-216ENST00000607519 CDK19Q9BWU1 502 aa14.8□□□□□ -0.04
GMDS-AS1-216ENST00000607519 NALCNQ8IZF0 1738 aa14.8□□□□□ -0.04
GMDS-AS1-216ENST00000607519 UBAP1LF5GYI3 381 aa14.79□□□□□ -0.04
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ATF3P18847 181 aa14.79□□□□□ -0.04
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa14.79□□□□□ -0.04
GMDS-AS1-216ENST00000607519 MSH6P52701 1360 aa14.78□□□□□ -0.04
GMDS-AS1-216ENST00000607519 WASLO00401 505 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
GMDS-AS1-216ENST00000607519 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP14.78□□□□□ -0.04
GMDS-AS1-216ENST00000607519 CABP2Q9NPB3 220 aa14.78□□□□□ -0.04
GMDS-AS1-216ENST00000607519 PIP4K2BP78356 416 aa14.77□□□□□ -0.05
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SLAIN2Q9P270 581 aa14.77□□□□□ -0.05
GMDS-AS1-216ENST00000607519 QRICH2Q9H0J4 1663 aa14.77□□□□□ -0.05
GMDS-AS1-216ENST00000607519 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa14.76□□□□□ -0.05
GMDS-AS1-216ENST00000607519 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ORAI2Q96SN7 254 aa14.76□□□□□ -0.05
GMDS-AS1-216ENST00000607519 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
GMDS-AS1-216ENST00000607519 PRR36Q9H6K5 1346 aa14.75□□□□□ -0.05
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
GMDS-AS1-216ENST00000607519 CADPS2Q86UW7 1296 aa14.74□□□□□ -0.05
GMDS-AS1-216ENST00000607519 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
GMDS-AS1-216ENST00000607519 TOM1O60784 492 aa14.73□□□□□ -0.05
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
GMDS-AS1-216ENST00000607519 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
GMDS-AS1-216ENST00000607519 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
GMDS-AS1-216ENST00000607519 MST1RQ04912 1400 aa14.73□□□□□ -0.05
GMDS-AS1-216ENST00000607519 DISP3Q9P2K9 1392 aa14.73□□□□□ -0.05
GMDS-AS1-216ENST00000607519 TULP4Q9NRJ4 1543 aa14.72□□□□□ -0.05
GMDS-AS1-216ENST00000607519 EVC2Q86UK5 1308 aa14.71□□□□□ -0.05
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ESCO1Q5FWF5 840 aa14.71□□□□□ -0.05
GMDS-AS1-216ENST00000607519 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa14.71□□□□□ -0.05
GMDS-AS1-216ENST00000607519 POLR3GLQ9BT43 218 aa14.71□□□□□ -0.05
GMDS-AS1-216ENST00000607519 C1orf167Q5SNV9 1468 aa14.7□□□□□ -0.06
GMDS-AS1-216ENST00000607519 FMN2Q9NZ56 1722 aa14.7□□□□□ -0.06
GMDS-AS1-216ENST00000607519 BRINP3Q76B58 766 aa14.7□□□□□ -0.06
GMDS-AS1-216ENST00000607519 IQSEC2Q5JU85 1478 aa14.69□□□□□ -0.06
GMDS-AS1-216ENST00000607519 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa14.69□□□□□ -0.06
GMDS-AS1-216ENST00000607519 USP32Q8NFA0 1604 aa14.69□□□□□ -0.06
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ADGRB2O60241 1585 aa14.68□□□□□ -0.06
GMDS-AS1-216ENST00000607519 DCCP43146 1447 aa14.68□□□□□ -0.06
GMDS-AS1-216ENST00000607519 TMF1P82094 1093 aa14.68□□□□□ -0.06
GMDS-AS1-216ENST00000607519 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
GMDS-AS1-216ENST00000607519 CABP1Q9NZU7 370 aa14.68□□□□□ -0.06
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa14.67□□□□□ -0.06
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa14.67□□□□□ -0.06
GMDS-AS1-216ENST00000607519 FOXO3O43524 673 aa14.66□□□□□ -0.06
GMDS-AS1-216ENST00000607519 TMC1Q8TDI8 760 aa14.66□□□□□ -0.06
GMDS-AS1-216ENST00000607519 PHF8Q9UPP1 1060 aa14.66□□□□□ -0.06
GMDS-AS1-216ENST00000607519 CCDC61Q9Y6R9 512 aa14.65□□□□□ -0.06
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ATP7BP35670 1465 aa14.64□□□□□ -0.07
GMDS-AS1-216ENST00000607519 FBXO41Q8TF61 875 aa14.64□□□□□ -0.07
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa14.63□□□□□ -0.07
GMDS-AS1-216ENST00000607519 HSPA1LP34931 641 aa14.63□□□□□ -0.07
GMDS-AS1-216ENST00000607519 KIF7Q2M1P5 1343 aa14.63□□□□□ -0.07
GMDS-AS1-216ENST00000607519 PLEKHG3A1L390 1219 aa14.62□□□□□ -0.07
GMDS-AS1-216ENST00000607519 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa14.62□□□□□ -0.07
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ANKARQ7Z5J8 1434 aa14.62□□□□□ -0.07
GMDS-AS1-216ENST00000607519 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ACEP12821 1306 aa14.62□□□□□ -0.07
GMDS-AS1-216ENST00000607519 KRT28Q7Z3Y7 464 aa14.61□□□□□ -0.07
GMDS-AS1-216ENST00000607519 WASHC2AQ641Q2 1341 aa14.61□□□□□ -0.07
GMDS-AS1-216ENST00000607519 PSME1Q06323 249 aa14.6□□□□□ -0.07
GMDS-AS1-216ENST00000607519 PLEKHG5O94827 1062 aa14.59□□□□□ -0.07
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
GMDS-AS1-216ENST00000607519 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ATAD2Q6PL18 1390 aa14.59□□□□□ -0.07
GMDS-AS1-216ENST00000607519 CCDC7Q96M83 1385 aa14.59□□□□□ -0.07
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SLC24A1O60721 1099 aa14.58□□□□□ -0.08
GMDS-AS1-216ENST00000607519 CDCA8Q53HL2 280 aa14.58□□□□□ -0.08
GMDS-AS1-216ENST00000607519 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa14.58□□□□□ -0.08
GMDS-AS1-216ENST00000607519 CD163L1Q9NR16 1453 aa14.57□□□□□ -0.08
GMDS-AS1-216ENST00000607519 NUTM2GQ5VZR2 741 aa14.56□□□□□ -0.08
GMDS-AS1-216ENST00000607519 CARD14Q9BXL6 1004 aa14.56□□□□□ -0.08
GMDS-AS1-216ENST00000607519 PANK3Q9H999 370 aa14.56□□□□□ -0.08
GMDS-AS1-216ENST00000607519 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ZRANB1Q9UGI0 708 aa14.55□□□□□ -0.08
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
GMDS-AS1-216ENST00000607519 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
GMDS-AS1-216ENST00000607519 LMOD2Q6P5Q4 547 aa14.54□□□□□ -0.08
GMDS-AS1-216ENST00000607519 NPHP3Q7Z494 1330 aa14.54□□□□□ -0.08
GMDS-AS1-216ENST00000607519 PXDNQ92626 1479 aa14.54□□□□□ -0.08
GMDS-AS1-216ENST00000607519 PHLPP1O60346 1717 aa14.54□□□□□ -0.08
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ITSN1Q15811 1721 aa14.54□□□□□ -0.08
GMDS-AS1-216ENST00000607519 NHSL1Q5SYE7 1610 aa14.53□□□□□ -0.08
GMDS-AS1-216ENST00000607519 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
GMDS-AS1-216ENST00000607519 A0A1W2PP64 1363 aa14.53□□□□□ -0.08
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP14.53□□□□□ -0.086e-7■■■□□ 16.5
GMDS-AS1-216ENST00000607519 MYOM1P52179 1685 aa14.52□□□□□ -0.08
GMDS-AS1-216ENST00000607519 KIF1AQ12756 1690 aa14.52□□□□□ -0.08
GMDS-AS1-216ENST00000607519 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
GMDS-AS1-216ENST00000607519 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
GMDS-AS1-216ENST00000607519 TERF2IPQ9NYB0 399 aa14.52□□□□□ -0.09
GMDS-AS1-216ENST00000607519 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
GMDS-AS1-216ENST00000607519 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.8 ms