RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000606714.5

TRAM2-AS1-204, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRAM2-AS1, Length 2,453 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SLFN5Q08AF3 891 aa28.58■■■□□ 2.17
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TULP4Q9NRJ4 1543 aa28.56■■■□□ 2.16
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 STAG3Q9UJ98 1225 aa28.55■■■□□ 2.16
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP28.55■■■□□ 2.16
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 MLECQ14165 292 aa28.55■■■□□ 2.16
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CGNL1Q0VF96 1302 aa28.55■■■□□ 2.16
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 DIP2BQ9P265 1576 aa28.55■■■□□ 2.16
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TSPOAP1O95153 1857 aa28.54■■■□□ 2.16
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 DMRT2Q9Y5R5 561 aa28.54■■■□□ 2.16
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PREX1Q8TCU6 1659 aa28.54■■■□□ 2.16
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP28.53■■■□□ 2.16
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP28.53■■■□□ 2.16
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ZFYVE9O95405 1425 aa28.52■■■□□ 2.16
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 MTHFSP49914 203 aa28.51■■■□□ 2.16
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP28.51■■■□□ 2.16
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PRAM1Q96QH2 718 aa28.51■■■□□ 2.15
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa28.51■■■□□ 2.15
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 MYO5BQ9ULV0 1848 aa28.5■■■□□ 2.15
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 NEUROD2Q15784 382 aa28.5■■■□□ 2.15
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa28.49■■■□□ 2.15
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 POGKQ9P215 609 aa28.49■■■□□ 2.15
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 DEKP35659 375 aaKnown RBP28.48■■■□□ 2.15
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP28.48■■■□□ 2.15
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP28.47■■■□□ 2.15
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP28.47■■■□□ 2.15
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 E9PSI1 815 aa28.45■■■□□ 2.14
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SKAP1Q86WV1 359 aa28.45■■■□□ 2.14
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP28.43■■■□□ 2.14
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 WWC1Q8IX03 1113 aa28.43■■■□□ 2.14
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 A0A1W2PP64 1363 aa28.42■■■□□ 2.14
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 BCAR3O75815 825 aa28.42■■■□□ 2.14
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CFAP53Q96M91 514 aa28.42■■■□□ 2.14
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PTPRMP28827 1452 aa28.41■■■□□ 2.14
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP28.41■■■□□ 2.14
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP28.41■■■□□ 2.14
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 GGNBP2Q9H3C7 697 aa28.4■■■□□ 2.14
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP28.4■■■□□ 2.14
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 RUNDC1Q96C34 613 aa28.4■■■□□ 2.14
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TCP11L2Q8N4U5 519 aa28.39■■■□□ 2.14
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SHPRHQ149N8 1683 aa28.38■■■□□ 2.13
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP28.37■■■□□ 2.13
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 USP32Q8NFA0 1604 aa28.37■■■□□ 2.13
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 NGEFQ8N5V2 710 aa28.36■■■□□ 2.13
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ALKQ9UM73 1620 aa28.35■■■□□ 2.13
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 NSD2O96028 1365 aa28.35■■■□□ 2.13
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP28.34■■■□□ 2.13
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP28.34■■■□□ 2.13
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP28.34■■■□□ 2.13
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 NBR1Q14596 966 aa28.34■■■□□ 2.13
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP28.34■■■□□ 2.13
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CDK19Q9BWU1 502 aa28.34■■■□□ 2.13
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PPP6R1Q9UPN7 881 aa28.33■■■□□ 2.13
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 WAPLQ7Z5K2 1190 aa28.33■■■□□ 2.13
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ATAD2Q6PL18 1390 aa28.33■■■□□ 2.13
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 AGLP35573 1532 aa28.32■■■□□ 2.12
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ABCC11Q96J66 1382 aa28.32■■■□□ 2.12
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TERF2IPQ9NYB0 399 aa28.32■■■□□ 2.12
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 A2ML1A8K2U0 1454 aa28.3■■■□□ 2.12
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 NINLQ9Y2I6 1382 aa28.3■■■□□ 2.12
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP28.3■■■□□ 2.12
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CABP1Q9NZU7 370 aa28.3■■■□□ 2.12
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 FYB1O15117 783 aa28.29■■■□□ 2.12
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PDE4AP27815 886 aa28.29■■■□□ 2.12
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 REREQ9P2R6 1566 aa28.29■■■□□ 2.12
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 RIMS2Q9UQ26 1411 aa28.28■■■□□ 2.12
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP28.27■■■□□ 2.12
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP28.27■■■□□ 2.12
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 IQSEC2Q5JU85 1478 aa28.27■■■□□ 2.12
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP28.27■■■□□ 2.12
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 KDM2BQ8NHM5 1336 aa28.27■■■□□ 2.12
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CD163L1Q9NR16 1453 aa28.26■■■□□ 2.11
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP28.26■■■□□ 2.11
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CANXP27824 592 aaKnown RBP28.24■■■□□ 2.11
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 MS4A1P11836 297 aa28.24■■■□□ 2.11
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa28.23■■■□□ 2.11
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP28.23■■■□□ 2.11
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP28.23■■■□□ 2.11
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 BACH2Q9BYV9 841 aa28.22■■■□□ 2.11
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa28.22■■■□□ 2.11
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP28.21■■■□□ 2.11
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP28.21■■■□□ 2.11
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 WDR63Q8IWG1 891 aa28.2■■■□□ 2.11
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP28.2■■■□□ 2.1
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ZMYM3Q14202 1370 aa28.19■■■□□ 2.1
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PANK1Q8TE04 598 aa28.19■■■□□ 2.1
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 BCL2L13Q9BXK5 485 aa28.18■■■□□ 2.1
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 FBLN1P23142 703 aa28.17■■■□□ 2.1
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 NLRP1Q9C000 1473 aa28.17■■■□□ 2.1
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CCDC27Q2M243 656 aa28.16■■■□□ 2.1
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 RARSP54136 660 aaKnown RBP28.16■■■□□ 2.1
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TXNDC2Q86VQ3 553 aa28.16■■■□□ 2.1
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 COG6Q9Y2V7 657 aa28.16■■■□□ 2.1
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 METP08581 1390 aa28.15■■■□□ 2.1
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP28.14■■■□□ 2.09
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PLEKHF1Q96S99 279 aa28.13■■■□□ 2.09
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PDE3AQ14432 1141 aa28.12■■■□□ 2.09
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TNNQ9UQP3 1299 aa28.11■■■□□ 2.09
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP28.11■■■□□ 2.09
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP28.11■■■□□ 2.09
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa28.1■■■□□ 2.09
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