RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580361.1

RAB31-208, Transcript of RAB31, member RAS oncogene family, human

TSL 2

Gene RAB31, Length 367 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RAB31-208	ENST00000580361	RSBN1L	Q6PCB5	846 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
RAB31-208	ENST00000580361	FAM117A	Q9C073	453 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RAB31-208	ENST00000580361	PLEKHG3	A1L390	1219 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RAB31-208	ENST00000580361	SKIV2L	Q15477	1246 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
RAB31-208	ENST00000580361	RIC3	Q7Z5B4	369 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RAB31-208	ENST00000580361	USB1	Q9BQ65	265 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
RAB31-208	ENST00000580361	RETREG3	Q86VR2	466 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RAB31-208	ENST00000580361	NKX2-3	Q8TAU0	364 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RAB31-208	ENST00000580361	SLC6A16	Q9GZN6	736 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RAB31-208	ENST00000580361	EIF4ENIF1	Q9NRA8	985 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
RAB31-208	ENST00000580361	PCDHGC3	Q9UN70	934 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RAB31-208	ENST00000580361	TLL1	O43897	1013 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RAB31-208	ENST00000580361	NDUFV2	P19404	249 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RAB31-208	ENST00000580361	CLK2	P49760	499 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
RAB31-208	ENST00000580361	MMP16	P51512	607 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RAB31-208	ENST00000580361	MTMR2	Q13614	643 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RAB31-208	ENST00000580361	DESI1	Q6ICB0	168 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RAB31-208	ENST00000580361	PPP1R18	Q6NYC8	613 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RAB31-208	ENST00000580361	RNF19B	Q6ZMZ0	732 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RAB31-208	ENST00000580361	FAM160A2	Q8N612	972 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
RAB31-208	ENST00000580361	ANKLE1	Q8NAG6	615 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RAB31-208	ENST00000580361	HLA-C	Q95604	372 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RAB31-208	ENST00000580361	ZBTB3	Q9H5J0	574 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RAB31-208	ENST00000580361	C6orf229	H3BNL8	230 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RAB31-208	ENST00000580361	GUCA2A	Q02747	115 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RAB31-208	ENST00000580361	LILRB3	O75022	631 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RAB31-208	ENST00000580361	DXO	O77932	396 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
RAB31-208	ENST00000580361	S1PR4	O95977	384 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RAB31-208	ENST00000580361	IL27	Q8NEV9	243 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RAB31-208	ENST00000580361	GNL3	Q9BVP2	549 aa	Known RBP eCLIP	4.72	□□□□□ -1.65
RAB31-208	ENST00000580361	LIMD1	Q9UGP4	676 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RAB31-208	ENST00000580361	RNF223	E7ERA6	249 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RAB31-208	ENST00000580361	HRC	P23327	699 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RAB31-208	ENST00000580361	PPP2R2D	Q66LE6	453 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RAB31-208	ENST00000580361	PCMTD1	Q96MG8	357 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
RAB31-208	ENST00000580361	PCDHB15	Q9Y5E8	787 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RAB31-208	ENST00000580361		V9GY48	417 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
RAB31-208	ENST00000580361	NUTM2B	A6NNL0	878 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
RAB31-208	ENST00000580361	NUTM2E	B1AL46	878 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
RAB31-208	ENST00000580361	JUND	P17535	347 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RAB31-208	ENST00000580361	NUTM2D	Q5VT03	806 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
RAB31-208	ENST00000580361	NUTM2A	Q8IVF1	878 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
RAB31-208	ENST00000580361	PRR7	Q8TB68	274 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RAB31-208	ENST00000580361	POLR3E	Q9NVU0	708 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RAB31-208	ENST00000580361	RPIA	P49247	311 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RAB31-208	ENST00000580361	PTPRN	Q16849	979 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RAB31-208	ENST00000580361	SYMPK	Q92797	1274 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
RAB31-208	ENST00000580361	PRDM9	Q9NQV7	894 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RAB31-208	ENST00000580361	QPCT	Q16769	361 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RAB31-208	ENST00000580361	LYPD8	Q6UX82	237 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RAB31-208	ENST00000580361	HELB	Q8NG08	1087 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
RAB31-208	ENST00000580361	CABLES1	Q8TDN4	633 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RAB31-208	ENST00000580361	FCF1	Q9Y324	198 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
RAB31-208	ENST00000580361	CFAP99	D6REC4	459 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RAB31-208	ENST00000580361	CCNYL3	P0C7X3	344 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RAB31-208	ENST00000580361	CSPP1	Q1MSJ5	1256 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RAB31-208	ENST00000580361	RTL5	Q5HYW3	569 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
RAB31-208	ENST00000580361	PROCA1	Q8NCQ7	364 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
RAB31-208	ENST00000580361	NUDT12	Q9BQG2	462 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RAB31-208	ENST00000580361	ZBTB24	O43167	697 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
RAB31-208	ENST00000580361	CD2BP2	O95400	341 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
RAB31-208	ENST00000580361	SLC19A1	P41440	591 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RAB31-208	ENST00000580361	TMEM132A	Q24JP5	1023 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RAB31-208	ENST00000580361	TMEM259	Q4ZIN3	620 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RAB31-208	ENST00000580361	PRKD2	Q9BZL6	878 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RAB31-208	ENST00000580361	EVA1B	Q9NVM1	165 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RAB31-208	ENST00000580361	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
RAB31-208	ENST00000580361	SOCS7	O14512	581 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RAB31-208	ENST00000580361	PPEF1	O14829	653 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RAB31-208	ENST00000580361	RFC5	P40937	340 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RAB31-208	ENST00000580361	ZNF598	Q86UK7	904 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RAB31-208	ENST00000580361	F12	P00748	615 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RAB31-208	ENST00000580361	KCNH2	Q12809	1159 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RAB31-208	ENST00000580361	PLA2G2C	Q5R387	149 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RAB31-208	ENST00000580361	SPRYD7	Q5W111	196 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RAB31-208	ENST00000580361	LIAT1	Q6ZQX7	453 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RAB31-208	ENST00000580361	BANK1	Q8NDB2	785 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RAB31-208	ENST00000580361	ARMC2	Q8NEN0	867 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RAB31-208	ENST00000580361	EMID1	Q96A84	441 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RAB31-208	ENST00000580361	WNT7B	P56706	349 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAB31-208	ENST00000580361	TRIM32	Q13049	653 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAB31-208	ENST00000580361		Q6ZNB5	142 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAB31-208	ENST00000580361	CCDC24	Q8N4L8	307 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RAB31-208	ENST00000580361	APBB1	O00213	710 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAB31-208	ENST00000580361	PER1	O15534	1290 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RAB31-208	ENST00000580361	PRR20E	P86478	221 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAB31-208	ENST00000580361	PRR20C	P86479	221 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAB31-208	ENST00000580361	PRR20D	P86480	221 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAB31-208	ENST00000580361	PRR20B	P86481	221 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAB31-208	ENST00000580361	PRR20A	P86496	221 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAB31-208	ENST00000580361	CTDSPL2	Q05D32	466 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAB31-208	ENST00000580361	LAPTM4A	Q15012	233 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAB31-208	ENST00000580361	PNMA1	Q8ND90	353 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAB31-208	ENST00000580361	TSC1	Q92574	1164 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RAB31-208	ENST00000580361	GPKOW	Q92917	476 aa	Predicted RBP eCLIP	4.62	□□□□□ -1.67
RAB31-208	ENST00000580361	AP1G2	O75843	785 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RAB31-208	ENST00000580361	USP17L8	P0C7I0	530 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RAB31-208	ENST00000580361	ZNF697	Q5TEC3	545 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RAB31-208	ENST00000580361	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RAB31-208	ENST00000580361	UNC93B1	Q9H1C4	597 aa		4.61	□□□□□ -1.67

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