RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578334.5

TSPOAP1-AS1-202, TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TSPOAP1-AS1, Length 956 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa41.8■■■■■ 4.28
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 TMEM132EQ6IEE7 984 aa41.8■■■■■ 4.28
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP41.78■■■■■ 4.28
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 WAPLQ7Z5K2 1190 aa41.78■■■■■ 4.28
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 KNDC1Q76NI1 1749 aa41.76■■■■■ 4.28
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ABCC11Q96J66 1382 aa41.76■■■■■ 4.27
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 NPHP3Q7Z494 1330 aa41.67■■■■■ 4.26
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 USP21Q9UK80 565 aa41.47■■■■■ 4.23
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 RGS12O14924 1447 aa41.46■■■■■ 4.23
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP41.46■■■■■ 4.23
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa41.41■■■■■ 4.22
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 DLC1Q96QB1 1528 aa41.4■■■■■ 4.22
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 HRCP23327 699 aa41.4■■■■■ 4.22
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 POGKQ9P215 609 aa41.4■■■■■ 4.22
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 DCAF11Q8TEB1 546 aa41.39■■■■■ 4.22
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ATAD2Q6PL18 1390 aa41.16■■■■■ 4.18
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 ALS2Q96Q42 1657 aa40.96■■■■■ 4.15
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP40.92■■■■■ 4.14
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CDK19Q9BWU1 502 aa40.87■■■■■ 4.13
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 NBPF1Q3BBV0 1214 aa40.86■■■■■ 4.13
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 BRWD3Q6RI45 1802 aa40.83■■■■■ 4.13
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TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SEPT12Q8IYM1 358 aa40.82■■■■■ 4.13
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