RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577760.1

RPL23-208, Transcript of ribosomal protein L23, human

Gene RPL23, Length 3,081 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPL23-208	ENST00000577760	ERBB4	Q15303	1308 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RPL23-208	ENST00000577760	SAFB2	Q14151	953 aa	Known RBP eCLIP	13.75	□□□□□ -0.21
RPL23-208	ENST00000577760	PKNOX2	Q96KN3	472 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RPL23-208	ENST00000577760	NUTM2D	Q5VT03	806 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
RPL23-208	ENST00000577760	ABCC2	Q92887	1545 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RPL23-208	ENST00000577760	VIRMA	Q69YN4	1812 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
RPL23-208	ENST00000577760	EXOSC9	Q06265	439 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
RPL23-208	ENST00000577760	ESPN	B1AK53	854 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RPL23-208	ENST00000577760	TMEM132E	Q6IEE7	984 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RPL23-208	ENST00000577760	GAS2L3	Q86XJ1	694 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RPL23-208	ENST00000577760	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RPL23-208	ENST00000577760	LAMC1	P11047	1609 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RPL23-208	ENST00000577760	NSD3	Q9BZ95	1437 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RPL23-208	ENST00000577760	KIF3B	O15066	747 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RPL23-208	ENST00000577760	ERCC6	Q03468	1493 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RPL23-208	ENST00000577760	TNPO1	Q92973	898 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
RPL23-208	ENST00000577760	SYNM	O15061	1565 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RPL23-208	ENST00000577760	NINL	Q9Y2I6	1382 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RPL23-208	ENST00000577760	ZMYND15	Q9H091	742 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RPL23-208	ENST00000577760	TRIM27	P14373	513 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RPL23-208	ENST00000577760	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
RPL23-208	ENST00000577760	SSH1	Q8WYL5	1049 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RPL23-208	ENST00000577760	CFAP53	Q96M91	514 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RPL23-208	ENST00000577760	DDX11L8	A8MPP1	907 aa		13.71	□□□□□ -0.22
RPL23-208	ENST00000577760	RBM42	Q9BTD8	480 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.22
RPL23-208	ENST00000577760	NOB1	Q9ULX3	412 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.22
RPL23-208	ENST00000577760	UNC13B	O14795	1591 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RPL23-208	ENST00000577760	NCL	P19338	710 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
RPL23-208	ENST00000577760	WDR63	Q8IWG1	891 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RPL23-208	ENST00000577760	TMEM57	Q8N5G2	664 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RPL23-208	ENST00000577760	C1orf115	Q9H7X2	142 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RPL23-208	ENST00000577760	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RPL23-208	ENST00000577760	MADD	Q8WXG6	1647 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RPL23-208	ENST00000577760	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RPL23-208	ENST00000577760	NGEF	Q8N5V2	710 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RPL23-208	ENST00000577760	NPC1L1	Q9UHC9	1359 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RPL23-208	ENST00000577760	ERVK-7	P63135	1459 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RPL23-208	ENST00000577760	POLR3A	O14802	1390 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
RPL23-208	ENST00000577760	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RPL23-208	ENST00000577760	ARID3A	Q99856	593 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RPL23-208	ENST00000577760	PREX2	Q70Z35	1606 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RPL23-208	ENST00000577760	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
RPL23-208	ENST00000577760	CD2BP2	O95400	341 aa	Known RBP	13.68	□□□□□ -0.22
RPL23-208	ENST00000577760	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		13.68	□□□□□ -0.22
RPL23-208	ENST00000577760	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		13.68	□□□□□ -0.22
RPL23-208	ENST00000577760	MYOM1	P52179	1685 aa		13.68	□□□□□ -0.22
RPL23-208	ENST00000577760	IQGAP1	P46940	1657 aa		13.68	□□□□□ -0.22
RPL23-208	ENST00000577760	ZNF692	Q9BU19	519 aa	Predicted RBP	13.67	□□□□□ -0.22
RPL23-208	ENST00000577760	ANKRD45	Q5TZF3	282 aa		13.67	□□□□□ -0.22
RPL23-208	ENST00000577760	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	13.67	□□□□□ -0.22
RPL23-208	ENST00000577760	ATP10A	O60312	1499 aa		13.66	□□□□□ -0.22
RPL23-208	ENST00000577760	SSFA2	P28290	1259 aa		13.66	□□□□□ -0.22
RPL23-208	ENST00000577760	DDX19B	Q9UMR2	479 aa		13.66	□□□□□ -0.22
RPL23-208	ENST00000577760	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		13.66	□□□□□ -0.22
RPL23-208	ENST00000577760	ELL2	O00472	640 aa	Predicted RBP	13.66	□□□□□ -0.22
RPL23-208	ENST00000577760	ATF7IP	Q6VMQ6	1270 aa		13.66	□□□□□ -0.22
RPL23-208	ENST00000577760	GBP4	Q96PP9	640 aa		13.66	□□□□□ -0.22
RPL23-208	ENST00000577760	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		13.66	□□□□□ -0.22
RPL23-208	ENST00000577760	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		13.66	□□□□□ -0.22
RPL23-208	ENST00000577760	ZBTB7C	A1YPR0	619 aa		13.65	□□□□□ -0.22
RPL23-208	ENST00000577760	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	13.65	□□□□□ -0.22
RPL23-208	ENST00000577760	GGNBP2	Q9H3C7	697 aa		13.65	□□□□□ -0.22
RPL23-208	ENST00000577760	RBM10	P98175	930 aa	Known RBP	13.65	□□□□□ -0.23
RPL23-208	ENST00000577760	AAMP	Q13685	434 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RPL23-208	ENST00000577760	CABP2	Q9NPB3	220 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RPL23-208	ENST00000577760	RRP9	O43818	475 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
RPL23-208	ENST00000577760	PHF23	Q9BUL5	403 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
RPL23-208	ENST00000577760	DDX49	Q9Y6V7	483 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
RPL23-208	ENST00000577760	KIAA1211	Q6ZU35	1233 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RPL23-208	ENST00000577760	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RPL23-208	ENST00000577760	RIPK4	P57078	832 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RPL23-208	ENST00000577760	CLTCL1	P53675	1640 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RPL23-208	ENST00000577760	CHD1L	Q86WJ1	897 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RPL23-208	ENST00000577760	SMC5	Q8IY18	1101 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RPL23-208	ENST00000577760	CEP152	O94986	1710 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RPL23-208	ENST00000577760	TMPO	P42166	694 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
RPL23-208	ENST00000577760	NASP	P49321	788 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
RPL23-208	ENST00000577760	HDAC1	Q13547	482 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
RPL23-208	ENST00000577760	GAS2L2	Q8NHY3	880 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RPL23-208	ENST00000577760	STK26	Q9P289	416 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RPL23-208	ENST00000577760	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
RPL23-208	ENST00000577760	AK9	Q5TCS8	1911 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RPL23-208	ENST00000577760	FBLN1	P23142	703 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RPL23-208	ENST00000577760	FOXD4L5	Q5VV16	416 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
RPL23-208	ENST00000577760	FOXD4L4	Q8WXT5	416 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
RPL23-208	ENST00000577760	ANP32B	Q92688	251 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
RPL23-208	ENST00000577760	KANK1	Q14678	1352 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RPL23-208	ENST00000577760	PTPRT	O14522	1441 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RPL23-208	ENST00000577760	APBB1	O00213	710 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RPL23-208	ENST00000577760	RAB3GAP1	Q15042	981 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RPL23-208	ENST00000577760	THUMPD2	Q9BTF0	503 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
RPL23-208	ENST00000577760	ZBTB40	Q9NUA8	1239 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RPL23-208	ENST00000577760	PLXNC1	O60486	1568 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RPL23-208	ENST00000577760	MCTP1	Q6DN14	999 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RPL23-208	ENST00000577760	TRIM35	Q9UPQ4	493 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RPL23-208	ENST00000577760	NUCB1	Q02818	461 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RPL23-208	ENST00000577760	CHAMP1	Q96JM3	812 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RPL23-208	ENST00000577760	GOLGA6L22	H0YM25	854 aa		13.58	□□□□□ -0.23
RPL23-208	ENST00000577760	SLC24A1	O60721	1099 aa		13.58	□□□□□ -0.23
RPL23-208	ENST00000577760	MSN	P26038	577 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.23

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