RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570085.5

ARIH1-210, Transcript of ariadne RBR E3 ubiquitin protein ligase 1, humanhuman

TSL 3

Gene ARIH1, Length 807 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARIH1-210ENST00000570085 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa42.57■■■■■ 4.41
ARIH1-210ENST00000570085 NBPF1Q3BBV0 1214 aa42.56■■■■■ 4.4
ARIH1-210ENST00000570085 HSPA1LP34931 641 aa42.55■■■■■ 4.4
ARIH1-210ENST00000570085 TRAK1Q9UPV9 953 aa42.55■■■■■ 4.4
ARIH1-210ENST00000570085 PRAM1Q96QH2 718 aa42.54■■■■■ 4.4
ARIH1-210ENST00000570085 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP42.54■■■■■ 4.4
ARIH1-210ENST00000570085 NBPF8Q3BBV2 869 aa42.48■■■■■ 4.39
ARIH1-210ENST00000570085 POGKQ9P215 609 aa42.46■■■■■ 4.39
ARIH1-210ENST00000570085 C1orf167Q5SNV9 1468 aa42.46■■■■■ 4.39
ARIH1-210ENST00000570085 BRINP3Q76B58 766 aa42.43■■■■■ 4.38
ARIH1-210ENST00000570085 ADGRB2O60241 1585 aa42.43■■■■■ 4.38
ARIH1-210ENST00000570085 FMN2Q9NZ56 1722 aa42.43■■■■■ 4.38
ARIH1-210ENST00000570085 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP42.4■■■■■ 4.38
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ARIH1-210ENST00000570085 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa42.38■■■■■ 4.37
ARIH1-210ENST00000570085 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP42.38■■■■■ 4.37
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ARIH1-210ENST00000570085 PHLPP1O60346 1717 aa42.36■■■■■ 4.37
ARIH1-210ENST00000570085 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP42.35■■■■■ 4.37
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ARIH1-210ENST00000570085 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP42.3■■■■■ 4.36
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ARIH1-210ENST00000570085 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP42.24■■■■■ 4.35
ARIH1-210ENST00000570085 USP32Q8NFA0 1604 aa42.22■■■■■ 4.35
ARIH1-210ENST00000570085 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP42.21■■■■■ 4.35
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ARIH1-210ENST00000570085 WASLO00401 505 aaPredicted RBP42.21■■■■■ 4.35
ARIH1-210ENST00000570085 ANKARQ7Z5J8 1434 aa42.2■■■■■ 4.35
ARIH1-210ENST00000570085 ESCO1Q5FWF5 840 aa42.2■■■■■ 4.35
ARIH1-210ENST00000570085 QRICH2Q9H0J4 1663 aa42.19■■■■■ 4.34
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ARIH1-210ENST00000570085 KIF1AQ12756 1690 aa42.15■■■■■ 4.34
ARIH1-210ENST00000570085 CARD11Q9BXL7 1154 aa42.15■■■■■ 4.34
ARIH1-210ENST00000570085 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP42.13■■■■■ 4.33
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ARIH1-210ENST00000570085 PRR36Q9H6K5 1346 aa42.1■■■■■ 4.33
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ARIH1-210ENST00000570085 SHPRHQ149N8 1683 aa42.07■■■■■ 4.33
ARIH1-210ENST00000570085 NPHP3Q7Z494 1330 aa42.07■■■■■ 4.33
ARIH1-210ENST00000570085 CDK19Q9BWU1 502 aa42.07■■■■■ 4.33
ARIH1-210ENST00000570085 ATP7BP35670 1465 aa42.05■■■■■ 4.32
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ARIH1-210ENST00000570085 FOXO3O43524 673 aa42.03■■■■■ 4.32
ARIH1-210ENST00000570085 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP42.03■■■■■ 4.32
ARIH1-210ENST00000570085 ITSN1Q15811 1721 aa42.02■■■■■ 4.32
ARIH1-210ENST00000570085 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP42.01■■■■■ 4.32
ARIH1-210ENST00000570085 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa42.01■■■■■ 4.31
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ARIH1-210ENST00000570085 EVC2Q86UK5 1308 aa41.92■■■■■ 4.3
ARIH1-210ENST00000570085 PNPLA6Q8IY17 1366 aa41.91■■■■■ 4.3
ARIH1-210ENST00000570085 CCDC61Q9Y6R9 512 aa41.9■■■■■ 4.3
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ARIH1-210ENST00000570085 CABP2Q9NPB3 220 aa41.87■■■■■ 4.29
ARIH1-210ENST00000570085 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP41.84■■■■■ 4.29
ARIH1-210ENST00000570085 PLEKHG3A1L390 1219 aa41.84■■■■■ 4.29
ARIH1-210ENST00000570085 USP47Q96K76 1375 aa41.83■■■■■ 4.29
ARIH1-210ENST00000570085 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa41.82■■■■■ 4.29
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ARIH1-210ENST00000570085 SBNO1A3KN83 1393 aa41.81■■■■■ 4.28
ARIH1-210ENST00000570085 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP41.81■■■■■ 4.28
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ARIH1-210ENST00000570085 TNS3Q68CZ2 1445 aa41.76■■■■■ 4.28
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ARIH1-210ENST00000570085 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP41.56■■■■■ 4.24
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ARIH1-210ENST00000570085 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP41.55■■■■■ 4.24
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ARIH1-210ENST00000570085 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP41.53■■■■■ 4.24
ARIH1-210ENST00000570085 LMOD2Q6P5Q4 547 aa41.53■■■■■ 4.24
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