RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567780.1

HOXC-AS3-204, HOXC cluster antisense RNA 3, humanhuman

Gene HOXC-AS3, Length 2,816 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS3-204ENST00000567780 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CFAP74Q9C0B2 1584 aa16.15■□□□□ 0.18
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CGNL1Q0VF96 1302 aa16.14■□□□□ 0.17
HOXC-AS3-204ENST00000567780 EVC2Q86UK5 1308 aa16.14■□□□□ 0.17
HOXC-AS3-204ENST00000567780 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa16.14■□□□□ 0.17
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CANXP27824 592 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
HOXC-AS3-204ENST00000567780 KDM2BQ8NHM5 1336 aa16.14■□□□□ 0.17
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ADGRB1O14514 1584 aa16.13■□□□□ 0.17
HOXC-AS3-204ENST00000567780 MYO3AQ8NEV4 1616 aa16.13■□□□□ 0.17
HOXC-AS3-204ENST00000567780 PPLO60437 1756 aa16.12■□□□□ 0.17
HOXC-AS3-204ENST00000567780 RGS3P49796 1198 aa16.12■□□□□ 0.17
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TCP11L2Q8N4U5 519 aa16.12■□□□□ 0.17
HOXC-AS3-204ENST00000567780 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CFAP53Q96M91 514 aa16.11■□□□□ 0.17
HOXC-AS3-204ENST00000567780 QRICH2Q9H0J4 1663 aa16.11■□□□□ 0.17
HOXC-AS3-204ENST00000567780 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
HOXC-AS3-204ENST00000567780 RUNDC1Q96C34 613 aa16.11■□□□□ 0.17
HOXC-AS3-204ENST00000567780 NGEFQ8N5V2 710 aa16.1■□□□□ 0.17
HOXC-AS3-204ENST00000567780 NEO1Q92859 1461 aa16.09■□□□□ 0.17
HOXC-AS3-204ENST00000567780 YEATS2Q9ULM3 1422 aa16.09■□□□□ 0.17
HOXC-AS3-204ENST00000567780 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
HOXC-AS3-204ENST00000567780 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP16.09■□□□□ 0.17
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CYB5RLQ6IPT4 315 aa16.09■□□□□ 0.17
HOXC-AS3-204ENST00000567780 PANK1Q8TE04 598 aa16.08■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa16.08■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-204ENST00000567780 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-204ENST00000567780 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-204ENST00000567780 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa16.07■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-204ENST00000567780 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-204ENST00000567780 COG6Q9Y2V7 657 aa16.07■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-204ENST00000567780 GLI2P10070 1586 aa16.07■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-204ENST00000567780 DEKP35659 375 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-204ENST00000567780 SLC52A1Q9NWF4 448 aa16.07■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-204ENST00000567780 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-204ENST00000567780 BCL2L13Q9BXK5 485 aa16.06■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-204ENST00000567780 GGNBP2Q9H3C7 697 aa16.06■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-204ENST00000567780 POGKQ9P215 609 aa16.06■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-204ENST00000567780 STAG3Q9UJ98 1225 aa16.06■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa16.06■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-204ENST00000567780 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa16.06■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-204ENST00000567780 PRAM1Q96QH2 718 aa16.04■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-204ENST00000567780 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa16.04■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TULP4Q9NRJ4 1543 aa16.04■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-204ENST00000567780 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-204ENST00000567780 IGHDP01880 384 aa16.03■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-204ENST00000567780 FAM161AQ3B820 660 aa16.03■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-204ENST00000567780 PDE3AQ14432 1141 aa16.02■□□□□ 0.16
HOXC-AS3-204ENST00000567780 RARSP54136 660 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-204ENST00000567780 A0A1W2PP64 1363 aa16.02■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-204ENST00000567780 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CLUAP1Q96AJ1 413 aa16.01■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa16.01■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-204ENST00000567780 SLC4A3P48751 1232 aa16■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-204ENST00000567780 FAM69CQ0P6D2 419 aa16■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-204ENST00000567780 C8orf34Q49A92 452 aa16■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-204ENST00000567780 WDR63Q8IWG1 891 aa16■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TNNQ9UQP3 1299 aa16■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-204ENST00000567780 SHPRHQ149N8 1683 aa16■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-204ENST00000567780 DDRGK1Q96HY6 314 aa16■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-204ENST00000567780 PIK3C2BO00750 1634 aa16■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TERF2IPQ9NYB0 399 aa15.99■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-204ENST00000567780 NSD2O96028 1365 aa15.98■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-204ENST00000567780 MLECQ14165 292 aa15.98■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-204ENST00000567780 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-204ENST00000567780 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-204ENST00000567780 NEFMP07197 916 aa15.97■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-204ENST00000567780 RLBP1P12271 317 aa15.97■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-204ENST00000567780 MYH16Q9H6N6 1097 aa15.97■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-204ENST00000567780 IQSEC2Q5JU85 1478 aa15.97■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-204ENST00000567780 FYB1O15117 783 aa15.96■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-204ENST00000567780 RICTORQ6R327 1708 aa15.96■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CDK19Q9BWU1 502 aa15.96■□□□□ 0.15
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CCDC27Q2M243 656 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CABP1Q9NZU7 370 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ABCC11Q96J66 1382 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXC-AS3-204ENST00000567780 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXC-AS3-204ENST00000567780 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
HOXC-AS3-204ENST00000567780 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ZFYVE9O95405 1425 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXC-AS3-204ENST00000567780 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ATAD2Q6PL18 1390 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXC-AS3-204ENST00000567780 NINLQ9Y2I6 1382 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXC-AS3-204ENST00000567780 USP32Q8NFA0 1604 aa15.94■□□□□ 0.14
HOXC-AS3-204ENST00000567780 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP15.94■□□□□ 0.14
HOXC-AS3-204ENST00000567780 MYO5BQ9ULV0 1848 aa15.93■□□□□ 0.14
HOXC-AS3-204ENST00000567780 WAPLQ7Z5K2 1190 aa15.93■□□□□ 0.14
HOXC-AS3-204ENST00000567780 FBLN1P23142 703 aa15.92■□□□□ 0.14
HOXC-AS3-204ENST00000567780 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa15.92■□□□□ 0.14
HOXC-AS3-204ENST00000567780 PTPRMP28827 1452 aa15.92■□□□□ 0.14
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TMPOP42166 694 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
HOXC-AS3-204ENST00000567780 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
HOXC-AS3-204ENST00000567780 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa15.91■□□□□ 0.14
HOXC-AS3-204ENST00000567780 PREX1Q8TCU6 1659 aa15.91■□□□□ 0.14
HOXC-AS3-204ENST00000567780 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
HOXC-AS3-204ENST00000567780 PLEKHF1Q96S99 279 aa15.9■□□□□ 0.14
HOXC-AS3-204ENST00000567780 SMC4Q9NTJ3 1288 aa15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.6 ms