RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567432.1

GINS3-208, Transcript of GINS complex subunit 3, human

TSL 3

Gene GINS3, Length 322 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GINS3-208	ENST00000567432	NUTM2A	Q8IVF1	878 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
GINS3-208	ENST00000567432	CABLES1	Q8TDN4	633 aa		4.95	□□□□□ -1.62
GINS3-208	ENST00000567432	SPDYE5	A6NIY4	337 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GINS3-208	ENST00000567432	C6orf229	H3BNL8	230 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GINS3-208	ENST00000567432	RFC5	P40937	340 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GINS3-208	ENST00000567432	MTMR2	Q13614	643 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GINS3-208	ENST00000567432	RTL5	Q5HYW3	569 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
GINS3-208	ENST00000567432	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
GINS3-208	ENST00000567432	BLOC1S3	Q6QNY0	202 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GINS3-208	ENST00000567432	SCUBE3	Q8IX30	993 aa		4.94	□□□□□ -1.62
GINS3-208	ENST00000567432	RNF166	Q96A37	237 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
GINS3-208	ENST00000567432	COPS2	P61201	443 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GINS3-208	ENST00000567432	TMEM259	Q4ZIN3	620 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GINS3-208	ENST00000567432	HCST	Q9UBK5	93 aa		4.93	□□□□□ -1.62
GINS3-208	ENST00000567432	SALL2	Q9Y467	1007 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
GINS3-208	ENST00000567432	FMNL1	O95466	1100 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
GINS3-208	ENST00000567432	BRICD5	Q6PL45	260 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GINS3-208	ENST00000567432	ERICH6	Q7L0X2	663 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GINS3-208	ENST00000567432	RETREG3	Q86VR2	466 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GINS3-208	ENST00000567432	BANK1	Q8NDB2	785 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GINS3-208	ENST00000567432	SYMPK	Q92797	1274 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
GINS3-208	ENST00000567432	THAP11	Q96EK4	314 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GINS3-208	ENST00000567432	MTR	Q99707	1265 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GINS3-208	ENST00000567432	CFAP99	D6REC4	459 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GINS3-208	ENST00000567432	FLII	Q13045	1269 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GINS3-208	ENST00000567432	TJAP1	Q5JTD0	557 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GINS3-208	ENST00000567432	RNF19B	Q6ZMZ0	732 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GINS3-208	ENST00000567432	PRR7	Q8TB68	274 aa		4.91	□□□□□ -1.62
GINS3-208	ENST00000567432	USB1	Q9BQ65	265 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
GINS3-208	ENST00000567432	ZPR1	O75312	459 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GINS3-208	ENST00000567432	AP1G2	O75843	785 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GINS3-208	ENST00000567432	MMRN1	Q13201	1228 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GINS3-208	ENST00000567432	C14orf37	Q86TY3	774 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GINS3-208	ENST00000567432	HELB	Q8NG08	1087 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
GINS3-208	ENST00000567432	IL21	Q9HBE4	155 aa		4.9	□□□□□ -1.63
GINS3-208	ENST00000567432	MCM6	Q14566	821 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GINS3-208	ENST00000567432	TSC1	Q92574	1164 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GINS3-208	ENST00000567432	ZNF516	Q92618	1163 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GINS3-208	ENST00000567432	SPSB2	Q99619	263 aa		4.89	□□□□□ -1.63
GINS3-208	ENST00000567432	TLL1	O43897	1013 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GINS3-208	ENST00000567432	ADH1B	P00325	375 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GINS3-208	ENST00000567432	USP17L8	P0C7I0	530 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GINS3-208	ENST00000567432	CTDSPL2	Q05D32	466 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GINS3-208	ENST00000567432	MSS51	Q4VC12	460 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GINS3-208	ENST00000567432	DESI1	Q6ICB0	168 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GINS3-208	ENST00000567432	FAM160A2	Q8N612	972 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
GINS3-208	ENST00000567432	SNRK	Q9NRH2	765 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GINS3-208	ENST00000567432	TIMELESS	Q9UNS1	1208 aa		4.88	□□□□□ -1.63
GINS3-208	ENST00000567432	SOCS7	O14512	581 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GINS3-208	ENST00000567432	PER1	O15534	1290 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
GINS3-208	ENST00000567432	DXO	O77932	396 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
GINS3-208	ENST00000567432	ITGBL1	O95965	494 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
GINS3-208	ENST00000567432	JUND	P17535	347 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GINS3-208	ENST00000567432	KCNC4	Q03721	635 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GINS3-208	ENST00000567432	LYPD8	Q6UX82	237 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GINS3-208	ENST00000567432	MTMR14	Q8NCE2	650 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GINS3-208	ENST00000567432	LRRN4	Q8WUT4	740 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GINS3-208	ENST00000567432	APBB1	O00213	710 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GINS3-208	ENST00000567432	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
GINS3-208	ENST00000567432	MMP16	P51512	607 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GINS3-208	ENST00000567432	NKX2-3	Q8TAU0	364 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GINS3-208	ENST00000567432	SLC6A16	Q9GZN6	736 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GINS3-208	ENST00000567432	PRDM9	Q9NQV7	894 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GINS3-208	ENST00000567432	PTPRN	Q16849	979 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GINS3-208	ENST00000567432	ZMYND15	Q9H091	742 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GINS3-208	ENST00000567432	PRM3	Q9NNZ6	103 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GINS3-208	ENST00000567432	HMX1	Q9NP08	348 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
GINS3-208	ENST00000567432	RAD21	O60216	631 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GINS3-208	ENST00000567432	S1PR4	O95977	384 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GINS3-208	ENST00000567432	GJD4	Q96KN9	370 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
GINS3-208	ENST00000567432	TRIM34	Q9BYJ4	488 aa		4.83	□□□□□ -1.64
GINS3-208	ENST00000567432		A6NJR5	290 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GINS3-208	ENST00000567432	CCNYL3	P0C7X3	344 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GINS3-208	ENST00000567432	NR6A1	Q15406	480 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GINS3-208	ENST00000567432	CLUAP1	Q96AJ1	413 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GINS3-208	ENST00000567432	POM121	Q96HA1	1249 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GINS3-208	ENST00000567432	NUDT12	Q9BQG2	462 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GINS3-208	ENST00000567432	EVA1B	Q9NVM1	165 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GINS3-208	ENST00000567432	COG6	Q9Y2V7	657 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GINS3-208	ENST00000567432	NDUFB9	Q9Y6M9	179 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GINS3-208	ENST00000567432	F12	P00748	615 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
GINS3-208	ENST00000567432	CTH	P32929	405 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GINS3-208	ENST00000567432	KCNH2	Q12809	1159 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GINS3-208	ENST00000567432	EPS8L1	Q8TE68	723 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GINS3-208	ENST00000567432	GDPD2	Q9HCC8	539 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GINS3-208	ENST00000567432	TBC1D2B	Q9UPU7	963 aa		4.81	□□□□□ -1.64
GINS3-208	ENST00000567432	GGCX	P38435	758 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GINS3-208	ENST00000567432	IFFO2	Q5TF58	517 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GINS3-208	ENST00000567432	CCDC24	Q8N4L8	307 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GINS3-208	ENST00000567432	PNMA1	Q8ND90	353 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GINS3-208	ENST00000567432	MAP10	Q9P2G4	905 aa		4.8	□□□□□ -1.64
GINS3-208	ENST00000567432	RNF223	E7ERA6	249 aa		4.79	□□□□□ -1.64
GINS3-208	ENST00000567432	PPEF1	O14829	653 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
GINS3-208	ENST00000567432	ABL2	P42684	1182 aa		4.79	□□□□□ -1.64
GINS3-208	ENST00000567432	PPP1R18	Q6NYC8	613 aa		4.79	□□□□□ -1.64
GINS3-208	ENST00000567432	PROSER2	Q86WR7	435 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
GINS3-208	ENST00000567432	WWC1	Q8IX03	1113 aa		4.79	□□□□□ -1.64
GINS3-208	ENST00000567432	EIF4ENIF1	Q9NRA8	985 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
GINS3-208	ENST00000567432	FCF1	Q9Y324	198 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
GINS3-208	ENST00000567432	TRAK2	O60296	914 aa		4.78	□□□□□ -1.64

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