RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566669.1

UBFD1-206, Transcript of ubiquitin family domain containing 1, human

TSL 2

Gene UBFD1, Length 577 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBFD1-206	ENST00000566669	ORAI2	Q96SN7	254 aa		40.95	■■■■■ 4.15
UBFD1-206	ENST00000566669	RXRB	P28702	533 aa		40.94	■■■■■ 4.14
UBFD1-206	ENST00000566669	AFF2	P51816	1311 aa		40.93	■■■■■ 4.14
UBFD1-206	ENST00000566669	NPHP3	Q7Z494	1330 aa		40.91	■■■■■ 4.14
UBFD1-206	ENST00000566669	CDK12	Q9NYV4	1490 aa	Predicted RBP	40.9	■■■■■ 4.14
UBFD1-206	ENST00000566669	SIRT1	Q96EB6	747 aa		40.9	■■■■■ 4.14
UBFD1-206	ENST00000566669	STK26	Q9P289	416 aa		40.89	■■■■■ 4.14
UBFD1-206	ENST00000566669	KNDC1	Q76NI1	1749 aa		40.87	■■■■■ 4.13
UBFD1-206	ENST00000566669	ESCO1	Q5FWF5	840 aa		40.86	■■■■■ 4.13
UBFD1-206	ENST00000566669	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		40.86	■■■■■ 4.13
UBFD1-206	ENST00000566669	C8orf37	Q96NL8	207 aa		40.85	■■■■■ 4.13
UBFD1-206	ENST00000566669	C14orf93	Q9H972	538 aa	Known RBP	40.85	■■■■■ 4.13
UBFD1-206	ENST00000566669	YTHDC2	Q9H6S0	1430 aa	Known RBP	40.84	■■■■■ 4.13
UBFD1-206	ENST00000566669	MYOM2	P54296	1465 aa		40.84	■■■■■ 4.13
UBFD1-206	ENST00000566669	NRXN1	Q9ULB1	1477 aa		40.83	■■■■■ 4.13
UBFD1-206	ENST00000566669	TMEM132E	Q6IEE7	984 aa		40.82	■■■■■ 4.13
UBFD1-206	ENST00000566669	WAPL	Q7Z5K2	1190 aa		40.81	■■■■■ 4.12
UBFD1-206	ENST00000566669	DHX57	Q6P158	1386 aa	Known RBP	40.8	■■■■■ 4.12
UBFD1-206	ENST00000566669	NGLY1	Q96IV0	654 aa		40.78	■■■■■ 4.12
UBFD1-206	ENST00000566669	HRC	P23327	699 aa		40.76	■■■■■ 4.12
UBFD1-206	ENST00000566669	RBM6	P78332	1123 aa	Known RBP	40.76	■■■■■ 4.12
UBFD1-206	ENST00000566669	QTRT2	Q9H974	415 aa	Known RBP	40.75	■■■■■ 4.11
UBFD1-206	ENST00000566669	ADAMTS2	O95450	1211 aa		40.74	■■■■■ 4.11
UBFD1-206	ENST00000566669	COL22A1	Q8NFW1	1626 aa	Predicted RBP	40.74	■■■■■ 4.11
UBFD1-206	ENST00000566669	STAC3	Q96MF2	364 aa		40.72	■■■■■ 4.11
UBFD1-206	ENST00000566669	PXDN	Q92626	1479 aa		40.71	■■■■■ 4.11
UBFD1-206	ENST00000566669	FOXO3	O43524	673 aa		40.71	■■■■■ 4.11
UBFD1-206	ENST00000566669	PLEKHH1	Q9ULM0	1364 aa		40.71	■■■■■ 4.11
UBFD1-206	ENST00000566669	CFAP70	Q5T0N1	1121 aa		40.68	■■■■■ 4.1
UBFD1-206	ENST00000566669	FNBP4	Q8N3X1	1017 aa	Predicted RBP	40.66	■■■■■ 4.1
UBFD1-206	ENST00000566669	UPF1	Q92900	1129 aa	Known RBP eCLIP	40.66	■■■■■ 4.1
UBFD1-206	ENST00000566669	FMN2	Q9NZ56	1722 aa		40.64	■■■■■ 4.1
UBFD1-206	ENST00000566669	KIF1A	Q12756	1690 aa		40.64	■■■■■ 4.1
UBFD1-206	ENST00000566669	USP21	Q9UK80	565 aa		40.64	■■■■■ 4.1
UBFD1-206	ENST00000566669	TRPC5	Q9UL62	973 aa	Predicted RBP	40.63	■■■■■ 4.09
UBFD1-206	ENST00000566669	NUTM2F	A1L443	756 aa		40.62	■■■■■ 4.09
UBFD1-206	ENST00000566669	DLC1	Q96QB1	1528 aa		40.61	■■■■■ 4.09
UBFD1-206	ENST00000566669	PRAM1	Q96QH2	718 aa		40.57	■■■■■ 4.09
UBFD1-206	ENST00000566669	POGK	Q9P215	609 aa		40.56	■■■■■ 4.08
UBFD1-206	ENST00000566669	RGS12	O14924	1447 aa		40.56	■■■■■ 4.08
UBFD1-206	ENST00000566669	XPC	Q01831	940 aa	Predicted RBP	40.55	■■■■■ 4.08
UBFD1-206	ENST00000566669	SPATA31A3	Q5VYP0	1347 aa		40.54	■■■■■ 4.08
UBFD1-206	ENST00000566669	PSME1	Q06323	249 aa		40.54	■■■■■ 4.08
UBFD1-206	ENST00000566669	PHF8	Q9UPP1	1060 aa		40.53	■■■■■ 4.08
UBFD1-206	ENST00000566669	KRT28	Q7Z3Y7	464 aa		40.51	■■■■■ 4.08
UBFD1-206	ENST00000566669	ANKAR	Q7Z5J8	1434 aa		40.5	■■■■■ 4.07
UBFD1-206	ENST00000566669	DCAF11	Q8TEB1	546 aa		40.49	■■■■■ 4.07
UBFD1-206	ENST00000566669	ATRN	O75882	1429 aa		40.49	■■■■■ 4.07
UBFD1-206	ENST00000566669	EIF3A	Q14152	1382 aa	Known RBP	40.48	■■■■■ 4.07
UBFD1-206	ENST00000566669	ADGRB1	O14514	1584 aa		40.48	■■■■■ 4.07
UBFD1-206	ENST00000566669	ADGRB2	O60241	1585 aa		40.44	■■■■■ 4.06
UBFD1-206	ENST00000566669	SAFB2	Q14151	953 aa	Known RBP eCLIP	40.44	■■■■■ 4.06
UBFD1-206	ENST00000566669	SBNO1	A3KN83	1393 aa		40.44	■■■■■ 4.06
UBFD1-206	ENST00000566669	MARF1	Q9Y4F3	1742 aa	Known RBP	40.43	■■■■■ 4.06
UBFD1-206	ENST00000566669	KDM2A	Q9Y2K7	1162 aa		40.43	■■■■■ 4.06
UBFD1-206	ENST00000566669	TNS3	Q68CZ2	1445 aa		40.42	■■■■■ 4.06
UBFD1-206	ENST00000566669	BCL9L	Q86UU0	1499 aa		40.42	■■■■■ 4.06
UBFD1-206	ENST00000566669	ATAD2	Q6PL18	1390 aa		40.41	■■■■■ 4.06
UBFD1-206	ENST00000566669	ARHGEF10	O15013	1369 aa		40.4	■■■■■ 4.06
UBFD1-206	ENST00000566669	TRAK1	Q9UPV9	953 aa		40.4	■■■■■ 4.06
UBFD1-206	ENST00000566669	HAP1	P54257	671 aa	Predicted RBP	40.36	■■■■■ 4.05
UBFD1-206	ENST00000566669	UNC5CL	Q8IV45	518 aa		40.34	■■■■■ 4.05
UBFD1-206	ENST00000566669	GJD4	Q96KN9	370 aa	Predicted RBP	40.34	■■■■■ 4.05
UBFD1-206	ENST00000566669	RGPD8	O14715	1765 aa	Predicted RBP	40.32	■■■■■ 4.04
UBFD1-206	ENST00000566669	SLIT2	O94813	1529 aa		40.32	■■■■■ 4.04
UBFD1-206	ENST00000566669	TNKS1BP1	Q9C0C2	1729 aa	Known RBP	40.31	■■■■■ 4.04
UBFD1-206	ENST00000566669	USP32	Q8NFA0	1604 aa		40.31	■■■■■ 4.04
UBFD1-206	ENST00000566669	GPRASP1	Q5JY77	1395 aa		40.28	■■■■■ 4.04
UBFD1-206	ENST00000566669	WASL	O00401	505 aa	Predicted RBP	40.28	■■■■■ 4.04
UBFD1-206	ENST00000566669	TULP4	Q9NRJ4	1543 aa		40.27	■■■■■ 4.04
UBFD1-206	ENST00000566669	MINK1	Q8N4C8	1332 aa	Predicted RBP	40.26	■■■■■ 4.04
UBFD1-206	ENST00000566669	HIRIP3	Q9BW71	556 aa	Predicted RBP	40.26	■■■■■ 4.04
UBFD1-206	ENST00000566669	PMFBP1	Q8TBY8	1022 aa		40.25	■■■■■ 4.03
UBFD1-206	ENST00000566669	LMOD2	Q6P5Q4	547 aa		40.24	■■■■■ 4.03
UBFD1-206	ENST00000566669	CCDC125	Q86Z20	511 aa		40.23	■■■■■ 4.03
UBFD1-206	ENST00000566669	RALGAPB	Q86X10	1494 aa		40.17	■■■■■ 4.02
UBFD1-206	ENST00000566669	PRR36	Q9H6K5	1346 aa		40.16	■■■■■ 4.02
UBFD1-206	ENST00000566669	CABLES1	Q8TDN4	633 aa		40.16	■■■■■ 4.02
UBFD1-206	ENST00000566669	VPS72	Q15906	364 aa		40.15	■■■■■ 4.02
UBFD1-206	ENST00000566669	NGDN	Q8NEJ9	315 aa	Known RBP	40.14	■■■■■ 4.02
UBFD1-206	ENST00000566669	NWD2	Q9ULI1	1742 aa		40.13	■■■■■ 4.02
UBFD1-206	ENST00000566669	KIAA1210	Q9ULL0	1709 aa		40.13	■■■■■ 4.01
UBFD1-206	ENST00000566669	ARHGEF28	Q8N1W1	1705 aa	Known RBP	40.12	■■■■■ 4.01
UBFD1-206	ENST00000566669	TRPM3	Q9HCF6	1732 aa	Predicted RBP	40.11	■■■■■ 4.01
UBFD1-206	ENST00000566669	ABCA3	Q99758	1704 aa		40.09	■■■■■ 4.01
UBFD1-206	ENST00000566669	GLI3	P10071	1580 aa		40.09	■■■■■ 4.01
UBFD1-206	ENST00000566669	NUDT16	Q96DE0	195 aa	Known RBP	40.07	■■■■■ 4.01
UBFD1-206	ENST00000566669	ITSN1	Q15811	1721 aa		40.06	■■■■■ 4
UBFD1-206	ENST00000566669	ALS2	Q96Q42	1657 aa		40.05	■■■■■ 4
UBFD1-206	ENST00000566669	EP400	Q96L91	3159 aa		40.05	■■■■■ 4
UBFD1-206	ENST00000566669	ATP7B	P35670	1465 aa		40.05	■■■■■ 4
UBFD1-206	ENST00000566669	FAM83G	A6ND36	823 aa		40.04	■■■■■ 4
UBFD1-206	ENST00000566669	ONECUT3	O60422	494 aa	Predicted RBP	40.04	■■■■■ 4
UBFD1-206	ENST00000566669	PLCH1	Q4KWH8	1693 aa		40.04	■■■■■ 4
UBFD1-206	ENST00000566669	CCDC9	Q9Y3X0	531 aa	Known RBP	40.03	■■■■■ 4
UBFD1-206	ENST00000566669	PLEKHG5	O94827	1062 aa		40.02	■■■■■ 4
UBFD1-206	ENST00000566669	CDK19	Q9BWU1	502 aa		40.01	■■■■■ 4
UBFD1-206	ENST00000566669	PAK3	O75914	559 aa	Predicted RBP	40	■■■■□ 3.99
UBFD1-206	ENST00000566669	CCDC61	Q9Y6R9	512 aa		40	■■■■□ 3.99
UBFD1-206	ENST00000566669	SEPT12	Q8IYM1	358 aa		39.98	■■■■□ 3.99

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